• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2017 Fiscal Year Annual Research Report

Prediction and verification of O-GlcNAc modifiction in intrinsically disorder protein

Research Project

Project/Area Number 15K00412
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

伊藤 將弘  立命館大学, 生命科学部, 教授 (50388112)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 亀村 和生  長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 准教授 (00399437)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
KeywordsO-GlcNAc修飾 / O-GlcNAc転移酵素 / O-GlcNAcase / 進化 / 修飾関連部位 / エピゲノム
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、O-GlcNAc修飾を担う2つの酵素であるO-GlcNAc転移酵素(OGT)とO-GlcNAcase(OGA)とO-GlcNAc修飾を受けるタンパク質に着目して天然変性領域(IDR)との関係も含めて進化解析を行った。OGTとOGAの解析では、ヒトOGT/OGAの相同タンパク質をゲノムワイドに検索することで付加と除去を行う酵素の有無からO-GlcNAc修飾の獲得過程を解明した。O-GlcNAc修飾を受けるタンパク質の解析では、ヒトO-GlcNAc修飾タンパク質を進化解析の基準とし、生物間での差異を確認することでO-GlcNAc修飾によるタンパク質の機能調節の解明を行った。。
その結果、OGTは真核生物全体で保存されておりOGAは動物でのみ保存されていた。O-GlcNAc修飾タンパク質は動物で保存されており、動物以外で保存されているものは13%のみであった。また、それらが持つO-GlcNAc修飾残基は脊椎動物での保存がみられた。脊椎動物ではO-GlcNAc修飾残基が保存されているだけでなく、OGT・OGAのリンカー部分もよく保存されていた。特に、OGTのリンカー部分は触媒ドメイン中に存在し、IDRであると予測された。
以上より、O-GlcNAc修飾は真核生物で進化し、オルガネラで管理されなかった糖転移酵素OGTによるGlcNAcの付加が起源であることを示唆した。次に、OGAを獲得したことによりGlcNAcの付加が可逆的な翻訳後修飾となったことで栄養センサーとなるUDP-GlcNAcの量に応じた転写・翻訳を始めとするタンパク質の機能調節が可能になったと推察された。OGTがIDRを得て基質特異性が変化したことでO-GlcNAc修飾の使われ方も急速に進化し、多様な役割をエピゲのミックスに果たすことが示唆された。

  • Research Products

    (13 results)

All 2018 2017

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results)

  • [Journal Article] Structural analysis of neutral glycosphingolipids from the silkworm Bombyx mori and the difference in ceramide composition between larvae and pupae2018

    • Author(s)
      Itonori S, Hashimoto K, Nakagawa M, Harada M, Suzuki T, Kojima H, Ito M Sugita M
    • Journal Title

      J Biochem

      Volume: 163 Pages: 201-214

    • DOI

      10.1093/jb/mvx072

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The glycosylation stoichiometry of EWS species in neuronal cells2017

    • Author(s)
      Kamemura K, Abe H
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem

      Volume: 81 Pages: 165-167

    • DOI

      10.1080/09168451.2016.1230004

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] O-GlcNAc glycosylation stoichiometry of the FET protein family: only EWS is glycosylated with a high stoichiometry2017

    • Author(s)
      Kamemura K
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem

      Volume: 81 Pages: 541-546

    • DOI

      10.1080/09168451.2016.1263148

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Analyzing of comparative transcriptomics, SIN-3/HDAC complex is related to epigenome in early embryogenesis of Caenorhabditis elegans2017

    • Author(s)
      Ohnishi Y, Nagano T, Kojima H, Ito M
    • Organizer
      21st International C. elegans Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] spn-4 gene cascade prediction in Caenorhabditis elegans by using multi-omics and big data analysis2017

    • Author(s)
      Nomoto Y, Kojima H, Ito M
    • Organizer
      21st International C. elegans Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Evolutionary analysis of human glycoside hydrolase using phylogenetic profile analysis from 360 organism genomes2017

    • Author(s)
      Nakamura T, Kojima H, Tanaka J, Ito M
    • Organizer
      The 12th International Workshop on Advanced Genomics
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ホヤの中性および酸糖脂質構造2017

    • Author(s)
      小島寿夫、糸乗前、伊藤將弘
    • Organizer
      第36回日本糖質学会年会
  • [Presentation] O-GlcNAc修飾タンパク質の進化的保存度によるクラスタリング解析2017

    • Author(s)
      田中純、藤井正興、小島寿夫、伊藤將弘
    • Organizer
      第36回日本糖質学会年会
  • [Presentation] ヒト糖加水分解酵素の系統プロファイル解析2017

    • Author(s)
      中村孝大、田中純、小島寿夫、伊藤將弘
    • Organizer
      第36回日本糖質学会年会
  • [Presentation] Elucidation of the Order of Glycan Acquisition by a Phylogenetic Profile Analysis of Human Glycoside Hydrolases2017

    • Author(s)
      Nakamura T, Tanaka J, Kojima H, Ito M
    • Organizer
      24th International Symposium on Glycoconjugates (Glyco24)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Inter-Species Analysis of O-GlcNAcylated Proteins.2017

    • Author(s)
      Tanaka J, Fujii M, Kojima H, Ito M
    • Organizer
      24th International Symposium on Glycoconjugates (Glyco24)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] O-GlcNAc修飾タンパク質の種間解析2017

    • Author(s)
      田中純、藤井正興、小島寿夫、伊藤將弘
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)
  • [Presentation] EWSのプリオン様ドメインに潜在するO-GlcNAcグリコシル化モチーフ2017

    • Author(s)
      福田真幸、亀村和生
    • Organizer
      第64回日本生化学会近畿支部例会

URL: 

Published: 2018-12-17  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi