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2015 Fiscal Year Research-status Report

LC/MS/MSを用いた次世代メタボロミクス研究のための基盤技術開発

Research Project

Project/Area Number 15K01812
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

津川 裕司  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 特別研究員 (30647235)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywordsメタボロミクス / 質量分析
Outline of Annual Research Achievements

質量分析において,もっとも解析が難しいとされていたdata independent MS/MS acquisition(以下,DIA法)より得られるデータを解析するプログラム,MS-DIALの開発を行った.これにより,LC/MS/MSで取得される代謝物由来イオンすべてに対してMS/MSを対応付けることが可能となり,分析におけるMS/MSスペクトルの網羅性を担保することができるようになった.また,生体を構成する主要なグリセロ脂質に対するin silico保持時間・MS/MSを全77,962分子種に対して構築し,15分の分析時間と開発した同定戦略により合計1,023化合物を藻類から同定することに成功した.さらに,9種類の藻類について,同定した1,023個の化合物それぞれの有無0, 1の値を持った「脂質フィンガープリント」を用いて分類した結果,古典分類学の系統樹と完全に一致する結果を得た.当時,藻類株UTEX2341はクロレラ種に属するかナンノクロロプシス種に属するか議論が分かれていたが,脂質フィンガープリントによる系統樹から明確にクロレラ種に属することが示唆された.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

共同研究者の協力もあり,計画通りに研究が遂行している.

Strategy for Future Research Activity

昨年度までは,質量分析生データより代謝物由来ピークを円滑に抽出してデータベースと照らしあわせ,化合物同定を精度高く行うためのプログラム開発を行った.一方,メタボロミクス最大の難関は,未知代謝物由来ピークの構造推定である.「メタボローム」として定義されている代謝物データベースはおよそ20万種類の低分子化合物を登録している一方,標準品によるマススペクトルの確認が行われているのは5,000弱と非常に少ない.そこで本年度では,未知スペクトルから組成式を予測し,複数得られる構造異性体候補の中から「理論的に」MS/MSスペクトルと最も合致する構造を抽出することで,正解構造を見つけ出すプログラムの構築にとりかかる.

Causes of Carryover

当該研究計画ではもともと,初年度に8割の予算割り振りをしていた.しかしながら,研究の進行に伴ない,次年度に持ち越すことが効率が良いと判断し,およそ30万円の使用額が生じる結果となった.

Expenditure Plan for Carryover Budget

今年度開催されるアメリカ質量分析学会の旅費,および投稿予定にある査読論文の校閲費に使用する.

  • Research Products

    (1 results)

All 2015

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results)

  • [Journal Article] MS-DIAL: data-independent MS/MS deconvolution for comprehensive metabolome analysis.2015

    • Author(s)
      Hiroshi Tsugawa, Tomas Cajka, Tobias Kind, Yan Ma, Brendan Higgins, Kazutaka Ikeda, Mitsuhiro Kanazawa, Jean VanderGheynst, Oliver Fiehn, Masanori Arita
    • Journal Title

      Nature Methods

      Volume: 12 Pages: 523-526

    • DOI

      10.1038/nmeth.3393

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant

URL: 

Published: 2017-01-06  

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