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2016 Fiscal Year Research-status Report

単一生細胞での細胞内遺伝子センシング技術の開発とチップデバイス化

Research Project

Project/Area Number 15K01829
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

青木 寛  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 環境管理研究部門, 主任研究員 (00392580)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords遺伝子センシング / バイオマーカー / マイクロRNA / 顕微イメージング / チップデバイス / 電気化学検出 / 表面プラズモン共鳴 / ナノ粒子
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、単一生細胞での細胞内遺伝子センシング技術を開発しそれをチップデバイス化することで、多数の細胞内遺伝子活動を並列的に同時観測可能とし、簡便かつ迅速な遺伝子診断技術の構築を目指す。最終的には、臨床や環境の現場で使用可能な一次スクリーニング技術として統合し、テーラーメード医療や化学物質の生体影響評価に貢献する。
この課題のもと、H28年度は、表面プラズモン共鳴(SPR)イメージング法/顕微イメージング法に基づく検討を行った。
まずSPRイメージング測定では、相補的な配列を有するDNAをプローブとして金表面上に固定化して配列選択的なターゲット認識を行い、その後の酵素反応によりシグナル増幅を図ることとした。具体的には、ターゲットであるマイクロRNA(miRNA)の認識後、酵素反応miRNA末端にpoly(A)鎖を伸長させ、複数のシグナル増幅因子添加後、TMB/H2O2混合溶液添加により酸化TMB(3,3’,5,5’-tetramethylbenzidine)の青色沈殿を生成させることで、シグナル増幅を行った。この際、酵素反応後にタンパク質分解酵素を反応させることでバックグラウンドシグナルを減少させてS/N比を向上させるとともに、シグナル増幅因子の添加割合や添加方法を検討することで最適化を行った。本研究の結果、肺がんマーカーである鎖長22 merのmiRNAに対して、検出下限がpMレベルであることを確認した。次に、SPR顕微イメージング測定法に基づく高感度検出では、生体試料のモデルとして単糖類マンノースをターゲットとし、これを選択的に捕捉するレセプターであるコンカナバリンAを表面固定化したハイドロゲルナノ粒子を用いた。この研究では、ナノ粒子表面でマンノースが選択性良く分子認識されることを見出し、この手法が微量生体試料測定に有用であることが分かった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

H28年度は、H27年度に判明した新たな検討事項であるSPRイメージング法/顕微イメージング法によるmiRNAの高感度検出法の開発に取り組んだ。具体的には、簡便・迅速な測定のための新規プローブと測定原理の開発、および酵素反応を活用した高感度測定法の開発を試みた。さらに、高感度検出に不可欠な、酵素反応後のバックグラウンドシグナルの除去手法、および酵素反応におけるシグナル増幅の最適化手法も開発した。最終的に、肺がんのバイオマーカーとなるマイクロRNAの配列選択的な非標識検出に成功した。併せて、SPR顕微イメージング測定法に基づいたナノ粒子表面での微量生体試料の高感度検出にも挑戦した。以上のことから、おおむね順調に進展していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

申請者の技術である電気化学的手法と、本年度習得したSPRイメージング法/顕微イメージング法との両方の特徴を活かしたマイクロデバイスを作製するとともに、研究終了後の実用化検討に向けて、モニタリングすべき遺伝子バイオマーカーの探索を推進する。

Causes of Carryover

他の予算が使用不可能な年度末、年度初めに、消耗品等の購入に本予算を使用するため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

H29年度に消耗品等の購入に使用予定。

  • Research Products

    (7 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] University California, Irvine(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University California, Irvine
  • [Journal Article] 遺伝子検出センサの高集積チップデバイス化と環境診断応用への展開2017

    • Author(s)
      青木 寛
    • Journal Title

      JIR News

      Volume: 3 Pages: 14-17

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Anchoring Titanium dioxide on Carbon Spheres for High-Performance Visible Light Photocatalysis2017

    • Author(s)
      Haoyi Wu, Xiao-Li Wu, Zheng-Ming Wang, Hiroshi Aoki, Shuzo Kutsuna, Keiko Jimura, Shigenobu Hayashi
    • Journal Title

      APPLIED CATALYSIS B-ENVIRONMENTAL

      Volume: 15 Pages: 255-266

    • DOI

      dx.doi.org/10.1016/j.apcatb.2017.02.027

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 「飛び出すカード」で血液を診断する2016

    • Author(s)
      青木 寛
    • Journal Title

      ぶんせき

      Volume: 11 Pages: 496-496

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genome-wide gene expression analysis of mouse embryonic stem cells exposed to p-dichlorobenzene2016

    • Author(s)
      Hidenori Tani, Jun-ichi Takeshita, Hiroshi Aoki, Ryosuke Abe, Akinobu Toyoda, Yasunori Endo, Sadaaki Miyamoto, Masashi Gamo, and Masaki Torimura
    • Journal Title

      JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING

      Volume: 122 Pages: 329-333

    • DOI

      dx.doi.org/10.1016/j.jbiosc.2016.02.007

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Integrated sensor array chips for simple and rapid diagnosis of biologically-significant RNA sequences2016

    • Author(s)
      Hiroshi AOKI
    • Organizer
      Global Research Efforts on Energy and Nanomaterials (GREEN 2016)
    • Place of Presentation
      GIS Taipei Tech Convention Center (Taipei, Taiwan)
    • Year and Date
      2016-12-24 – 2016-12-24
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Label-free sensor array chips: application to simultaneous oligonucleotide detaction2016

    • Author(s)
      Hiroshi AOKI
    • Organizer
      Spacial Seminar in Kansas State University
    • Place of Presentation
      Kansas State University (Kansas, USA)
    • Year and Date
      2016-10-06 – 2016-10-06
    • Invited

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-02-16  

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