2017 Fiscal Year Research-status Report
水が駆動する巨大生体分子の自律化メカニズムの熱力学解析
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15K05254
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| Research Institution | Himeji Dokkyo University |
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Principal Investigator |
原野 雄一 姫路獨協大学, 薬学部, 准教授 (60456259)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | in silico 創薬 / 構造活性相関 / 熱力学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
生体分子の自律化(タンパク質の立体構造形成、分子認識など)の過程は、全て液相で起こることから、溶媒である『水』の存在が大 きく関与している。また、実験として観測される重要な生体分子の挙動はsec以上(系によってはday~month)という長い時間スケー ルである。以上のことから、生体分子と水を含んだ全系に対する分子論と熱力学とを統合した理解が必要である。
近年、我々の研究グル ープが開発した水和自由エネルギーの高速計算法を用い、巨大生体分子の構造変化に対する自由エネルギー地形を描くことを試みた。
これまでのところ、小ペプチドの系においては計算は終了しており、有効性は確認できている。
水の熱力学的性質が如何に関与するかを物理化学的理論に基づき明らかにした。さらに応用的な研究としては,計算化学と溶液化学の 融合によるin silico創薬を中心に実施した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
学内業務の増加
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| Strategy for Future Research Activity |
システムは仕上がっているので、研究協力者を募り、協同的に研究推進を行う。
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| Causes of Carryover |
次年度以降、購入予定サーバーがスペックアップする情報があったため。
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