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2015 Fiscal Year Research-status Report

酵素-基質複合体誘導によるSer/Thrホスファターゼ基質同定法の開発

Research Project

Project/Area Number 15K05560
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

中馬 吉郎  新潟大学, 自然科学系, 准教授 (40372263)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywordsホスファターゼ / 酵素 / 触媒機構 / がん
Outline of Annual Research Achievements

平成27年度はリン酸化ミミックAlF4-を用いたSer/Thrホスファターゼの基質トラップ法の有用性確認を実施した。まず、Ser/ThrホスファターゼとしてPPMタイプのPPM1D430、ならびにSCP/FCPタイプのヒト由来SCP1およびFCP1について、大腸菌発現システムを用いて発現・精製を行った。pNPPならびにリン酸化ペプチドを用いた速度論的解析を実施し、発現したすべての組み換えタンパク質がホスファターゼ活性を有することを確認した。次に、AlF4-イオンによるホスファターゼ阻害活性を確認したところ、SCP1, FCP1はAlF4-添加により顕著に活性が阻害され、PPM1D430においても弱い阻害活性が認められた。これらのことから、AlF4-がリン酸化ミミック分子として組み換えタンパク質にトラップされることが示唆された。
立体制約型ファージライブラリーの構築は、フィブロネクチン由来構造を導入したファージミドベクターを構築し、現在クローニング中である。そこで、最初に基質同定のためのスクリーニングの系を確立するため、7残基提示の立体制約型ファージライブラリーを用いてFCP1ホスファターゼに対する基質モチーフ探索実験を実施した。AlF4-存在下、FCP1結合ファージをスクリーニングし218個の塩基配列を解析したところ、9種類の集積した配列を同定した。、これらの配列の中には機知のFCP1基質配列であるPolII CTDドメイン類似配列を含んでおり、本手法がSer/Thrホスファターゼ基質同定法として有用であることが強く示唆された。
また、Ser/Thrホスファターゼの基質トラップ型変異体についてはPPM1D430を用いて作製し、これまでに高純度で発現精製することを確認した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初計画であるin vitro ホスファターゼ基質トラップスクリーニング法の有用性を確認できた。また、立体制約性ライブライブラリーの構築、ならびに基質トラップ型変異体の作成も当初計画に従った展開をしている。また、学会での成果発表等も実施している。

Strategy for Future Research Activity

作製した独自の立体制約型ファージライブラリーを用いて、より結合力の強いSer/Thrホスファターゼ基質候補ペプチドを同定する。同定したペプチド配列含有タンパク質をタンパク質データベースより探索し、実際に生体内標的分子として機能するかどうか検証する。また、得られた結合配列をもとに、Ser/Thrホスファターゼ阻害剤への展開を行う。また、基質トラップ型変異体を用いた、細胞内基質の同定を行う。

Causes of Carryover

研究で使用するマイクロプレートリーダーが当初計画予算より低価格で購入できたため、また、研究の進行が概ね順調であったため、経費節減により次年度使用額が生じた。

Expenditure Plan for Carryover Budget

経費節減の結果生じた使用残について、より一層の研究推進ため物品費および旅費等に有効に使用する。

  • Research Products

    (11 results)

All 2016 2015 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Novel Inhibitors Targeting PPM1D Phosphatase Potently Suppress Cancer Cell Proliferation.2015

    • Author(s)
      Ogasawara, S., Kiyota, Y., Chuman, Y., Kowata, A., Yoshimura, F., Tanino, K., Kamada, R., and Sakaguchi, K.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem.

      Volume: 23 Pages: 6246-6249

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2015.08.042

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Synthesis of Yellow and Red Fluorescent 1,3a,6a-Triazapentalene and Theoretical Investigation of Optical Properties.2015

    • Author(s)
      Namba, K., Osawa, A., Nakayama, A., Mera, A., Tano, F., Chuman, Y., Sakuda, E., Taketsugu, T., Sakaguchi, K., Kitamura, N., and Tanino, K.
    • Journal Title

      Chem. Sci.

      Volume: 6 Pages: 1083-1093

    • DOI

      DOI: 10.1039/C4SC02780A

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Function of Proto-oncogene Product PPM1D and Development of PPM1D Inhibitors for Cancer Chemotherapy.2015

    • Author(s)
      Kamada, R.; Chuman, Y.; Kozakai, Y.; Sakaguchi, K.
    • Journal Title

      Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society

      Volume: 87 Pages: 531-538

    • Open Access
  • [Journal Article] Development of the Novel Substrate Identification Methodology for Ser/Thr Phosphatases Using Phosphorylation Mimic Phage Display Library.2015

    • Author(s)
      Otsubo, K., Furukawa K, Chuman, Y.
    • Journal Title

      Peptide Sci.

      Volume: 2016 Pages: 271-272

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] リン酸化模倣ファージディスプレイによるSer/Thrホスファターゼ基質同定法の開発2016

    • Author(s)
      大坪 広大、 米田崇史、 古川和広、 中馬 吉郎
    • Organizer
      第6回 グリーンケミストリー研究会
    • Place of Presentation
      新潟大学(新潟市)
    • Year and Date
      2016-03-15 – 2016-03-15
  • [Presentation] 発癌関連ホスファターゼに対する新規基質同定法と阻害剤の開発2016

    • Author(s)
      中馬吉郎
    • Organizer
      第22回ペプチドフォーラム
    • Place of Presentation
      金沢大学サテライトプラザ(金沢市)
    • Year and Date
      2016-03-05 – 2016-03-05
    • Invited
  • [Presentation] リン酸化ミミック分子によるSer/Thrプロテインホスファターゼ基質同定法の開発2016

    • Author(s)
      大坪 広大, 古川 和広, 中馬 吉郎
    • Organizer
      第7回日本プロテインホスファターゼ研究会学術集会
    • Place of Presentation
      自然科学研究機構(岡崎市)
    • Year and Date
      2016-01-29 – 2016-01-30
  • [Presentation] DEVELOPMENT OF THE NOVEL SUBSTRATE IDENTIFICATION METHODOLOGY FOR SER/THR PHOSPHATASES USING PHOSPHORYLATION MIMIC PHAGE DISPLAY LIBRARY2015

    • Author(s)
      Kodai Otsubo, Kazuhiro Furukawa, Yoshiro Chuman
    • Organizer
      第52回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      平塚中央貢民会(平塚市)
    • Year and Date
      2015-11-16 – 2015-11-18
  • [Presentation] リン酸化ミミックファージディスプレイによるホスファターゼ基質同定法の開発2015

    • Author(s)
      大坪 広大, 古川 和広, 中馬 吉郎
    • Organizer
      H27年度生化学会 関東支部会・第56回新潟生化学懇話会
    • Place of Presentation
      新潟日報メディアシップ(新潟市)
    • Year and Date
      2015-06-20 – 2015-06-20
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      http://chem.sc.niigata-u.ac.jp/~chuman/

  • [Remarks] 日本ペプチド学会ホームページ

    • URL

      http://www.peptide-soc.jp/pnj/

URL: 

Published: 2017-01-06  

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