2015 Fiscal Year Research-status Report
in vivo安定同位体標識代謝物を用いた定量メタボロミクス技術の開発
Project/Area Number |
15K06557
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Research Institution | Kyushu University |
Principal Investigator |
和泉 自泰 九州大学, 生体防御医学研究所, 准教授 (70622166)
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Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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Keywords | 定量メタボロミクス / 疾患メタボローム解析 |
Outline of Annual Research Achievements |
現状のメタボローム解析技術により取得できる定量情報は,「相対定量」に制限されているため,細胞内の精確な代謝物濃度の決定には至っていない.また,相対定量情報では,他施設での異なる分析装置や異なる分析手法で取得したデータと直接比較検証できないため,生理学的・生化学的考察を深めることが困難である.そこで,当該研究では,原核細胞から真核細胞に至る幅広い生物種に適用可能な包括的な安定同位体標識代謝物の調製法の開発を軸に,試料調製,高感度定量メタボローム分析,定量データ解析手法を含む「in vivo安定同位体標識代謝物を用いた定量メタボロミクス技術の開発」に取り組む.平成27年度は,イオンクロマトグラフィー高分解能質量分析 (IC/Q Exactive MS) による陰イオン性代謝物の網羅的測定法について検討した.有機酸,糖リン酸,ヌクレオチド,補酵素など約200種の代謝物について,Q Exactiveにおけるイオン化条件を最適化するとともに,精密質量MS及びMS/MSスペクトルライブラリーを作成した.続いて,IC分離条件の最適化を行ったところ,クエン酸やイソクエン酸,あるいはヘキソース一リン酸の各種異性体のクロマト分離を達成できることが分かった.また,ATPやNAD(P)+, NAD(P)Hなどは生体内のエネルギー獲得や酸化還元バランスを考察する上で重要な物質であるが,従来分析手法では再現性と検出感度の点で課題が残されていた.一方,IC/Q Exactive分析法においては,これらの代謝物についてもシャープなピーク形状を保ち,高感度の測定が可能であることを見出した.開発した分析手法を用いて微生物や動物培養細胞,体液などの生体試料の分析を行ったところ,生体試料においても保持時間及びピークエリアの再現性は極めて高く,また精密質量をベースとした高精度の化合物同定,高感度測定が達成できることを示した.
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
平成27年度は,課題Ⅰである「親水性代謝物の高感度分析手法の開発」を達成するためにイオンクロマトグラフィー高分解能質量分析 (IC/MS) による陰イオン性代謝物の網羅的測定法の開発を実施した.開発したIC/MS分析手法は,網羅性,高感度,及び高い分析再現性を併せ持った実用的な新規のメタボローム解析手法であり,本研究を遂行する上で、きわめて重要な基盤分析技術になると考えられる.さらに,課題Ⅱの「微生物における定量メタボローム分析手法の開発」にも着手しており,芽酵母(S. cerevisiae BY4742)を用いた包括的な標識代謝物の調製手法を検討中である.以上のことから,実験計画の進歩状況としては,「おおむね順調に進展している」と判断している.
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Strategy for Future Research Activity |
平成28年度は,平成27年度に開発したイオンクロマトグラフィー高分解能質量分析による陰イオン性代謝物の網羅的測定法を用いて,課題Ⅱの「微生物における定量メタボローム分析手法の開発」を実施する.さらに,課題Ⅲの「動物試料における定量メタボローム解析分析手法の開発」についても同時並行で研究を進める.また,アミノ酸やポリアミン,核酸塩基,ヌクレオシド,などの陽イオン性を測定対象としたメタボローム分析手法についても新たに検討を行う予定である.
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Causes of Carryover |
課題Ⅱを実施するために購入を予定していた試薬類の納品が大幅に遅れてしまい,年度内の入手が困難となったため.
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Expenditure Plan for Carryover Budget |
平成27年度から繰り越した研究費においては,課題Ⅱ「微生物における定量メタボローム分析手法の開発」及び課題Ⅲ「動物試料における定量メタボローム解析分析手法の開発」に関する研究を実施するための消耗品試薬購入及び培養設備に使用する.さらに,平成28年度では,平成27年度の結果を踏まえ,新たに,陽イオン性代謝物の分析系構築を予定している.分析系を構築するための標準試薬は概ね使用可能な状態にあるが,一部の標準試薬については当該年度の予算を使用して購入を計画する.また,まとまったデータは,学会発表や論文発表していく予定にしており,それに関わる諸経費も,平成28年度の予算を使用する.
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Research Products
(32 results)
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[Journal Article] Lipidomic analysis of plasma lipoprotein fractions in myocardial infarction-prone rabbits.2015
Author(s)
Takeda, H., Koike, T., Izumi, Y., Yamada, T., Yoshida, M., Shiomi, M., Fukusaki, E., Bamba, T.
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Journal Title
J. Biosci. Bioeng.
Volume: 120(4)
Pages: 476-482
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Lipidome analysis of plasma lipoprotein fractions in myocardial infarction-prone rabbits2015
Author(s)
Takeda, H., Koike, T., Izumi, Y., Yamada, T., Yoshida, M., Shiomi, M., Fukusaki, E., Bamba, T.
Organizer
Pacifichem 2015
Place of Presentation
Hawaii Convention Center etc, Honolulu, Hawaii, USA.
Year and Date
2015-12-15 – 2015-12-20
Int'l Joint Research
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[Presentation] Rapid in-depth regioisomer focused lysophospholipidomics of human serum by online supercritical fluid extraction-supercritical fluid chromatography tandem mass spectrometry2015
Author(s)
Izumi,Y., Nakao, M., Tuckett, N., Funada, Y., Uchikata, T., Iwata, Y., Tomita, M., Nishimura , M., Kim Ekroos., Bamba, T.
Organizer
Pacifichem 2015
Place of Presentation
Hawaii Convention Center etc, Honolulu, Hawaii, USA.
Year and Date
2015-12-15 – 2015-12-20
Int'l Joint Research
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[Presentation] 油糧糸状菌 Mortierella alpina のメタボローム解析2015
Author(s)
和泉自泰, 安藤晃規, 阪本鷹行, 光永均, 中尾素直, 岸野重信, 福﨑英一郎, 櫻谷英治, 島純, 小川順, 馬場健史
Organizer
第67回 日本生物工学会大会
Place of Presentation
城山観光ホテル, 鹿児島県鹿児島市
Year and Date
2015-10-26 – 2015-10-28
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[Presentation] 残留農薬分析に資する新規スプリット方式オンライン超臨界流体抽出クロマトグラフシステムの開発2015
Author(s)
酒井美穂, 安部秋晴, 市来弥生, 寺田英敏, 服部考成, 舟田康裕, 和泉自泰, 安藤孝, 福﨑英一郎, 馬場健史
Organizer
第67回 日本生物工学会大会
Place of Presentation
城山観光ホテル, 鹿児島県鹿児島市
Year and Date
2015-10-26 – 2015-10-28
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[Presentation] 油糧微生物 Mortierella alpine のメタボローム解析2015
Author(s)
和泉自泰, 安藤晃規, 阪本鷹行, 光永均, 中尾素直, 岸野重信, 福崎英一郎, 櫻谷英治, 島純,小川順, 馬場健史
Organizer
第9回メタボロームシンポジウム
Place of Presentation
三島市民文化会館 ゆうゆうホール 三島商工会議所, 静岡県三島市
Year and Date
2015-09-30 – 2015-10-02
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[Presentation] Fully automated on-line sample extraction and analysis of residual pesticides in agricultural products by using on-line SFE-SFC-MS2015
Author(s)
Hattori, T., Uchikata, T., Terada, H., Ichikawa, C., Funada, Y., Ichiki, Y., Sakai, M., Ando, T., Izumi, Y., Fukusaki, E., Bamba, T.
Organizer
RSC Tokyo International Conference 2015
Place of Presentation
Makuhari Messe, Chiba-city, Japan.
Year and Date
2015-09-03 – 2015-09-04
Int'l Joint Research
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[Presentation] Automatically extraction and analysis using on-line supercritical fluid extraction (SFE) / supercritical fluid chromatography (SFC) system2015
Author(s)
Uchikata, T., Terada, H., Funada, Y., Izumi, Y., Bamba, T.
Organizer
SFC 2015, 9th International Conference on Packed-Column SFC
Place of Presentation
Loews Philadelphia, Philadelphia, Pennsylvania, USA.
Year and Date
2015-07-22 – 2015-07-25
Int'l Joint Research
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[Presentation] Development of an online supercritical fluid extraction-supercritical fluid chromatography/mass spectrometry method for the simultaneous and rapid analysis of fat-soluble vitamins2015
Author(s)
Ueno, M., Izumi, Y., Funada, Y., Iwata, Y., Tomita, M., Fukusaki, E., Bamba, T.
Organizer
SFC 2015, 9th International Conference on Packed-Column SFC
Place of Presentation
Loews Philadelphia, Philadelphia, Pennsylvania, USA.
Year and Date
2015-07-22 – 2015-07-25
Int'l Joint Research
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[Presentation] Fully automated on-line sample extraction and analysis of residual pesticides in agricultural products by using on-line SFE-SFC-MS2015
Author(s)
Hattori, T., Uchikata, T., Terada, H., Ichikawa, C., Funada, Y., Ichiki, Y., Sakai, M., Ando, T., Izumi, Y., Fukusaki, E., Bamba, T
Organizer
SFC 2015, 9th International Conference on Packed-Column SFC
Place of Presentation
Loews Philadelphia, Philadelphia, Pennsylvania, USA.
Year and Date
2015-07-22 – 2015-07-25
Int'l Joint Research
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[Presentation] Lipidomics of plasma lipoprotein fractions in myocardial infarction-prone rabbits2015
Author(s)
Takeda, H., Koike, T., Izumi, Y., Yamada, T., Yoshida, M., Shiomi, M., Fukusaki, E., Bamba, T.
Organizer
11th International Conference of the Metabolomics Society (Metabolomics2015)
Place of Presentation
Hyatt Regency San Francisco Airport, San Francisco Bay Area, California, USA.
Year and Date
2015-06-29 – 2015-07-02
Int'l Joint Research
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[Presentation] Fully Automated On-Line Sample Extraction and Analysis of Residual Pesticides in Agricultural Products by using On-Line SFE-SFC-MS2015
Author(s)
Hattori, T., Uchikata, T., Terada, H., Ichikawa, C., Funada, Y., Ichiki, Y., Sakai, M., Ando, T., Izumi, Y., Fukusaki, E., Bamba, T.
Organizer
63rd ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
Place of Presentation
America's Convention Center, St. Louis, Missouri, USA.
Year and Date
2015-05-31 – 2015-06-04
Int'l Joint Research
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[Presentation] Rapid In-Depth Regioisomer Focused Lysophospholipidomics of Human Serum by Online Supercritical Fluid Extraction-Supercritical Fluid Chromatography Tandem Mass Spectrometry2015
Author(s)
Izumi,Y., Funada, Y., Uchikata, T., Iwata, Y., Tomita, M., Nishimura, M., Kim Ekroos., Bamba, T.
Organizer
63rd ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
Place of Presentation
America's Convention Center, St. Louis, Missouri, USA.
Year and Date
2015-05-31 – 2015-06-04
Int'l Joint Research
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