Development of TP53 signature in vitro diagnostics (IVD)

2017 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 15K06851
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: 高橋 信 東北大学, 大学病院, 講師 (20431570)
• Project Period (FY): 2015-04-01 – 2018-03-31
• Keywords: バイオマーカー / 遺伝子発現プロファイル / TP53 / 予後予測 / 治療効果予測

Outline of Annual Research Achievements

我々が開発したTP53 signatureは予後および術前化学療法の治療効果の予測性が非常に高く、臨床的有用性が高い。本研究はこれまでの研究の出口戦略として、TP53 signatureの臨床応用を目指し、簡便な診断キットの開発を行うものである。また、その診断キットを利用したデータ検証のための後ろ向き観察研究を行うものである。
nCounterを用いたTP53 signatureのプローブセットを作成した。TP53ステータスが既知のコホート（n=30）を用いてTP53 signatureデータを取得し、TP53ステータスを診断するカットオフ値(0.78)を設定した。Stage I-IIの早期乳がんコホート（n=174）を用いて、TP53 signatureを取得した。その結果、変異型64例、野生型110例であった。両群において、Stageに有意差は認めなかったが、ER、PR、HER2、Gradeには統計学的有意差を認めた。また、術後補助化学療法は変異型群で、術後補助内分泌療法は野生型群で実施率が高かった。無再発生存期間（RFS）では、TP53 signatre、Stage、リンパ節転移の有無において予後に有意な差を認めたが、多変量解析の結果からはTP53 signatureが最もRFSと関連する因子であることが明らかとなった。また、RNAシークエンスにより網羅的遺伝子発現データを取得し、臨床応用されている遺伝子発現プロファイルであるMammaprint、OncotypeDXおよびPAM50と予後予測性の比較を行ったところ、TP53 signatureがもっとも予後の予測性が高いことが示された。術前化学療法症例を対象としたTP53 signatureと効果予測性の検証として、100例の術前化学療法症例の検体を取得してTP53 signatureデータを取得した。

Research Products

• [Journal Article] Molecular and clinical features of the <i>TP53</i> signature gene expression profile in early-stage breast cancer (2018)
  • Author(s): Yamaguchi Shigeo、Takahashi Shin、Mogushi Kaoru、Izumi Yuki、Nozaki Yumi、Nomizu Tadashi、Kakugawa Yoichiro、Ishida Takanori、Ohuchi Noriaki、Ishioka Chikashi、Kato Shunsuke
  • Journal Title: Oncotarget Volume: 9 Pages: 14193-14206
  • DOI: https://doi.org/10.18632/oncotarget.24447
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] Molecular and clinical features of the TP53 signature gene expression profile in early-stage breast cancer (2017)
  • Author(s): Yamaguchi Shigeo、Takahashi Shin、Mogushi Kaoru、Izumi Yuki、Nozaki Yumi、Nomizu Tadashi、Kakugawa Yoichiro、Ishida Takanori、Ohuchi Noriaki、Ishioka Chikashi、Kato Shunsuke
  • Organizer: European Society of Medical Oncology (ESMO) 2017 Congress, Madrid, Spain
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Development of TP53 signature diagnostic system using multiplex RT-PCR and observational study to confirm the prognostic value of TP53 signature in breast cancer (2017)
  • Author(s): Shin Takahashi, Takafumi Fukui, Tadashi Nomizu, Yoichiro Kakugawa, Takanori Ishida, Shigeo Yamguchi, Shunsuke Kato, Noriaki Ouchi, Nobuhisa Gondo, Chikashi Ishioka
  • Organizer: European Society of Medical Oncology (ESMO) 2017 Congress, Madrid, Spain
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Development of in vitro diagnostics for TP53 signature aiming at optimization of breast cancer treatment (2017)
  • Author(s): Shin Takahashi, Takafumi Fukui, Tadashi Nomizu, Yoichiro Kakugawa, Takanori Ishida, Shigeo Yamguchi, Shunsuke Kato, Noriaki Ouchi, Nobuhisa Gondo, Chikashi Ishioka
  • Organizer: 第15回日本臨床腫瘍学会学術集会 神戸国際会議場（兵庫）