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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Searching for the genetic factors predisposing to PBC

Research Project

Project/Area Number 15K06908
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

川嶋 実苗  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), その他 (00396706)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords原発性胆汁性胆管炎(PBC) / ゲノムワイド関連解析(GWAS) / 層別化解析(悪性化) / ヒト白血球抗原(HLA)
Outline of Annual Research Achievements

ゲノムワイド関連解析(GWAS)により、原発性胆汁性胆管炎(PBC)の発症メカニズムや病態の進展に関与する遺伝要因を探索し、診断や予後予測、治療の対象となり得る要因を検出することを目的に研究を実施してきた。
H.29年度は、2報の論文を発表した。
1報目は、PBCの感受性領域として知られている17q12-21領域(約350kbに及び、15遺伝子が存在する領域)について、どの遺伝子の発現に関与する変異がプライマリーに影響を及ぼすか、Forkhead box protein O1 (FOXO1) とのaffinity解析(EMSAやcompetitorアッセイ)、eQTL解析によって同定することに成功し、IKZF3(B リンパ球の分化)を介してではなくORMDL3やGSDMBの免疫系に対する機能変化(Th17誘導など)を介してPBC発症に関与している可能性があることを示した(Hitomi et al., Sci Rep. 2017 Jun 6;7(1):2904)。
2報目は、PBCと強い関連を示すHLA領域について、これまでHLA-A、-B、-DRB1、-DQA1、-DQB1、-DPA1、-DPB1遺伝子についてgenotypeを決定した1200名のPBC患者さんと1196名の関連解析およびハプロタイプ解析を行うことで、DQB1*06:04アリル及びDQB1*03:01アリルが疾患抵抗性に寄与していることが分かったと共に、これらのアリルによって補正すると、DPB1 *02:01アリルが関与することも新たに分かった(Sci Rep. 2017 Sep 11;7(1):11093)。
その他にも、昨年度の拡大GWAS論文よりも更に対象数を増やして(PBC:668名、コントロール:480名)実施したGWASや、3SNP haplotype法により検出された疾患関連変異について投稿中である。

  • Research Products

    (16 results)

All 2017 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 1 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] アルバータ大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      アルバータ大学
  • [Int'l Joint Research] ケンブリッジ大学/オックスフォード大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      ケンブリッジ大学/オックスフォード大学
  • [Int'l Joint Research] 上海大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      上海大学
  • [Int'l Joint Research] Humanitas大学(イタリア)

    • Country Name
      ITALY
    • Counterpart Institution
      Humanitas大学
  • [Journal Article] Identification of the functional variant driving ORMDL3 and GSDMB expression in human chromosome 17q12-21 in primary biliary cholangitis.2017

    • Author(s)
      Hitomi Y, Kojima K, Kawashima M, et al.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7(1) Pages: 2904-2914

    • DOI

      doi:10.1038/s41598-017-03067-3

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Principal contribution of HLA-DQ alleles, DQB1*06:04 and DQB1*03:01, to disease resistance against primary biliary cholangitis in a Japanese population.2017

    • Author(s)
      Yasunami M, Nakamura H, Tokunaga K, Kawashima M, et al.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7(1) Pages: 11093

    • DOI

      doi:10.1038/s41598-017-11148-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 原発性胆汁性胆管炎(PBC)感受性遺伝子NFKB1/MANBAを対象とした、第一義的な機能的遺伝子 多型の同定研究2017

    • Author(s)
      人見 祐基、仲谷 健、小島 要、 西田 奈央、河合 洋介、川嶋 実苗、 相葉 佳洋、長崎 正朗、中村 稔、 徳永 勝士
    • Organizer
      日本人類遺伝学会
  • [Presentation] 疾患リスクアレル頻度分布の非対称性に関する統計数理解析2017

    • Author(s)
      城戸 隆、川嶋 実苗、菊地 進一、 鎌谷 直之
    • Organizer
      日本人類遺伝学会
  • [Presentation] ゲノムワイド関連解析により同定された産科抗リン脂質抗体症候群の新たな発症関連遺伝子2017

    • Author(s)
      大前 陽輔、杉浦 真弓、川嶋 実苗、 豊岡 理人、Seik-Soon Khor、澤井 裕美、堀田 哲也、 渥美 達也、村島 温子、藤田 太輔、 藤田 富雄、森本 真司、森下 英理子、 北折 珠央、片野 衣江、尾崎 康彦、 徳永 勝士
    • Organizer
      日本人類遺伝学会
  • [Presentation] 研究データの共有におけるゲノムデータや臨床情報の取り扱いについて2017

    • Author(s)
      川嶋実苗
    • Organizer
      日本人類遺伝学会
    • Invited
  • [Presentation] NELFCD and CTSZ loci are associated with jaundice-stage progression in primary biliary cholangitis in the Japanese population.2017

    • Author(s)
      M. Kawashima, N. Nishida, Y. Hitomi, K. Kojima, Y. Kawai, Y. Aiba, H. Nakamura, M. Nagasaki, K. Tokunaga, M. Nakamura
    • Organizer
      American Society of Human Genetics
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of the primary functional variants in primary biliary cholangitis susceptibility gene loci NFKB1/MANBA.2017

    • Author(s)
      Y. Hitomi, K. Nakatani, K. Kojima, N. Nishida, Y. Kawai, M. Kawashima, Y. Aiba, M. Nagasaki, M. Nakamura, K. Tokunaga
    • Organizer
      American Society of Human Genetics
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Controlled-access databases for genetic and phenotypic human data in Japan.2017

    • Author(s)
      Y. Kodama, A. Fukuda, J. Mashima, M. Minowa, M. Kawashima, K. Miyazaki, N. Mitsuhashi, E. Kaminuma, O. Ogasawara, K. Okubo, Y. Nakamura, T. Takagi
    • Organizer
      American Society of Human Genetics
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] GWAS polygenic model approach applied to primary biliary cholangitis (PBC) in a Japanese population.2017

    • Author(s)
      O. Gervais, K. Ueno, K. Kojima, Y. Aiba, M. Kawashima, Y. Kawai, Y. Hitomi, K. Tokunaga, M. Nakamura, M. Nagasaki
    • Organizer
      American Society of Human Genetics
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 実験医学2017

    • Author(s)
      川嶋実苗
    • Total Pages
      227頁中16頁
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      978-4-7581-0366-4
  • [Remarks] 東京大学大学院医学系研究科人類遺伝学教室HP

    • URL

      http://www.humgenet.m.u-tokyo.ac.jp/

URL: 

Published: 2018-12-17   Modified: 2022-08-05  

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