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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of the structural basis for the interaction of the ribosomal stalk protein with aminoacyl-tRNA synthetase

Research Project

Project/Area Number 15K06964
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

伊東 孝祐  新潟大学, 自然科学系, 助教 (20502397)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 三好 智博  松本歯科大学, 歯学部, 講師 (60534550)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywordsリボソーム / 触手様タンパク質 / アミノアシルtRNA合成酵素 / 翻訳 / X線結晶構造解析
Outline of Annual Research Achievements

リボソーム表面で柔軟かつ広範囲に運動するリボソームの“触手様タンパク質”は、翻訳因子と直接相互作用して翻訳因子をリボソームへとリクルートする役割を担う。我々はこれまでに、触手様タンパク質と翻訳伸長因子の相互作用の構造基盤を明らかにしてきた。一方で最近、触手様タンパク質が、翻訳因子とは構造も機能も全く異なるアミノアシルtRNA合成酵素とも相互作用し、アミノアシルtRNAを翻訳因子へ効率よく供給する役割も担うという、タンパク質合成の新たな仕組みが明らかになった。そこで本研究では、我々のこれまでの研究基盤を利用し、触手様タンパク質・アミノアシルtRNA合成酵素複合体の構造を明らかにすることを目的とした。
本研究では、まず、結晶化に適した構造が安定な触手様タンパク質断片を作製することを目的とし、触手様タンパク質におけるアミノアシルtRNA合成酵素との相互作用部位の特定を行った。その結果、触手様タンパク質はC末端ドメインのN末端領域でアミノアシルtRNA合成酵素と相互作用していることが明らかになった。一方我々は過去の研究で、触手様タンパク質はC末端ドメインのC末端を介して翻訳因子と相互作用していることを明らかにしている。即ち今回の結果は、アミノアシルtRNA合成酵素と翻訳因子が同時に触手様タンパク質と相互作用し、翻訳効率を上昇させることを示唆するものである。次に我々は、触手様タンパク質とアミノアシルtRNA合成酵素との共結晶化に取り組んだ。その結果、現在までに微結晶を得ることに成功している。なお、本研究の一環で触手様タンパク質に結合する新規因子も探索していた結果、新たな因子を数種同定することができた。また、触手様タンパク質と翻訳因子との相互作用メカニズムについても新たな知見を得ることができた。

  • Research Products

    (6 results)

All 2017

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Binding of translation elongation factors to individual copies of the archaeal ribosomal stalk protein aP1 assembled onto aP0.2017

    • Author(s)
      Honda T., Imai H., Suzuki T., Miyoshi T., Ito K., Uchiumi T.
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 483 Pages: 153-158

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.12.175.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Archaeal ribosomal stalk protein aP1 directly binds to the ribosome recycling factor aABCE1 and promotes ribosome-dependent ATP hydrolysis2017

    • Author(s)
      Imai, H., Abe, T., Miyoshi, T., Ito, K., and Uchiumi, T.
    • Organizer
      EMBL2017 Protein Synthesis and Translational Control
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 新規古細菌リボソーム結合因子aYchFのtRNAに依存する機能に関する研究2017

    • Author(s)
      青木 彩香, 今井 大達, 村田 菜摘, 伊東 孝祐, 内海 利男
    • Organizer
      第19回日本RNA学会年会
  • [Presentation] 翻訳リサイクル因子ABCE1-リボソームストーク間相互作用とその役割2017

    • Author(s)
      今井 大達, 阿部 高也, 三好 智博, 伊東 孝祐, 内海 利男
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会
  • [Presentation] リボソームストークとGTP結合型翻訳伸長因子EF1A間複合体のX線結晶構造解析2017

    • Author(s)
      丸山 圭, 川村 桃子, 今井 大達, 伊東 孝祐, 内海 利男
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会
  • [Presentation] 変異導入解析によるリボソームストークとリサイクル因子ABCE1間相互作用の検証2017

    • Author(s)
      阿部 高也, 今井 大達, 西川 周一, 伊東 孝祐, 内海 利男
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会

URL: 

Published: 2018-12-17  

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