2017 Fiscal Year Annual Research Report
Development of methods for making glycan atlas, and data collection for database publishing
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15K06991
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
長束 俊治 新潟大学, 自然科学系, 教授 (00243163)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | 糖鎖 / 網羅的解析 / データベース / グライコーム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
【前年度までの成果】N-結合型糖鎖に加え、遊離糖鎖およびO-結合型糖鎖の網羅的解析法を確立した。そしてその手法を用いてゼブラフィッシュの胚発生時期における糖鎖構造の変遷を網羅的に分析することに成功し、N-結合型糖鎖に関する部分を論文として発表した（K. Hanzawa et al. Glycobiology, 2017）。さらに既に解析を終えているO-結合型糖鎖と遊離糖鎖に関する論文および希少糖を含む新規末端構造を持つ糖鎖構造に関する論文も投稿準備中である。一方、数種類の糖タンパク質標品や動物組織の網羅的糖鎖構造解析を行って構造と発現量に関するデータを蓄積することにも成功し、それらのデータを二次元糖鎖マップに編集してインターネット上で公開した。さらに、標準糖鎖の糖鎖マップデータの件数を大幅に増加したデータベースの改訂版を公開した。糖鎖アトラスの簡易版の作成を目的として、ヤツメウナギの各臓器から糖鎖を調製して網羅的に解析を行い、各臓器の糖鎖マップを作成した。それぞれの臓器の糖鎖マップは、特徴的な構造と発現量を示しており、この方法によって有用性の高いデータベースを構築できることを示すことができた。現在この解析結果に関する論文も執筆中である。今回作成した糖鎖アトラスは部位数が限られた簡易版であるが、本研究において確立した手法で大規模な解析を行い、部位数を桁違いに増やせば、さらに有用性の高いデータベースを作成できることを示すことができた。
【最終年度の成果】前年度までに技術的課題を克服できたので、予定していた計画をさらに進めて大規模解析に着手し始めた。その結果これまでにマウスの臓器数種の網羅的糖鎖構造解析を行い、多くの糖鎖データを蓄積することができた。
本研究により、マウスの糖鎖アトラスさらにはヒトの糖鎖アトラス作成のための技術的問題点を克服することに成功した。
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Research Products
(7 results)
