2017 Fiscal Year Annual Research Report
A feasibility study for genome analysis of ancient human skeletons excavated from the western part of Japan
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15K07240
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| Research Institution | Kanazawa University |
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Principal Investigator |
佐藤 丈寛 金沢大学, 医学系, 助教 (10558026)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
Hudson Mark ふじのくに地球環境史ミュージアム, 学芸課, 教授 (20284052)
覚張 隆史 金沢大学, 国際文化資源学研究センター, 特任助教 (70749530)
深瀬 均 北海道大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (00582115) [Withdrawn]
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | 古代DNA分析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究課題においてこれまで行ってきた古人骨中のコラーゲンラセミ化率の測定結果からDNAの保存状態が良好と見込まれた、和歌山県地ノ島遺跡出土弥生時代人骨1個体、沖縄県武芸洞遺跡出土貝塚時代人骨1個体、沖縄県長墓遺跡出土人骨3試料（遊離歯であるため、個体同定はできていない）からDNA抽出を試みた。Rohland & Hofreiter (2007)の方法に従ってDNAを抽出し、バイオアナライザーを用いて電気泳動を行った。いずれの試料もラセミ化率の測定結果は比較的良好であったものの、DNAを検出することができたのは和歌山県地ノ島遺跡出土弥生時代人骨のみであった。検出できたDNAの断片長のピークは2,000 bp付近にあり、温帯～亜熱帯にかけての地域にから出土した古人骨のDNAとしては明らかに長すぎ、大量のバクテリアDNAの混入が予想された。
DNAを検出できた試料について次世代シーケンシング用ライブラリーの作製を試みたが、古人骨DNAでよくみられる、インサート長が100 bp程度のライブラリーをPCR増幅することができず、検出できたDNAはやはりそのほとんどがバクテリアDNAに由来していることが示唆された。
残念ながら本研究期間内に古代ゲノム分析に耐えうる西日本出土の古人骨試料を同定することはできなかったが、今後も新たに西日本出土の古人骨試料を収集し、ゲノム解析の可能性調査を継続する予定である。
尚、本研究において検討した古人骨DNAライブラリー調整法は、他の地域から出土した古人骨DNAに対しても応用しており、特に寒冷地から出土した古人骨については非常に良好な結果を得ることができている。
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