2016 Fiscal Year Research-status Report
イネ融合葉突然変異体の解析による新規マスター調節遺伝子ネットワークの解明
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15K07259
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Research Institution | Akita Prefectural University |
Principal Investigator |
永澤 奈美子 (佐藤奈美子) 秋田県立大学, 生物資源科学部, 准教授 (00535289)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
伊藤 純一 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (30345186)
永澤 信洋 秋田県立大学, 生物資源科学部, 准教授 (90599268)
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Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2019-03-31
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Keywords | 突然変異体 |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、イネの融合葉突然変異体を解析することで未知のマスター調節遺伝子を世界に先駆けて開拓することを目的としている。マスター調節遺伝子の機能解明や相互関係の理解は、植物を自由自在に改変するために必須な知見の一つである。 これまでに、主に2種類の融合葉突然変異体abaxially fused leaf (abl) 1およびAbl2変異体が同定されており、平成28年度もこれらの解析を行った。 劣性のabl1については、融合葉が形成される時期の茎頂分裂組織(SAM)付近の形態観察やSAM内の未分化細胞で発現する遺伝子を分子マーカーとして用いた解析を行ったところ、野生型では見られない位置に新たな分裂組織が形成されていることが明らかになった。abl1の原因遺伝子は、マッピングのみでは絞り切れなかったため、次世代シーケンサによる解析を行い、現在データ処理中である。 優性のAbl2については、融合葉が形成される以前のSAMの幅が野生型より大きくなっていることを明らかにした。また、Abl2の原因遺伝子はポジショナルクローニングにより、ヒスチジンカイネースであることが示された。複数のアリルで同一遺伝子のエキソン内に点変異があることも確認された。 さらに、平成28年度には、Abl2と表現型が非常によく似ているものの劣性の突然変異体を同定し、形態観察を行うことができた。つまり、葉分化に関わるマスター調節遺伝子の機能解析を行うための新たな材料が得られたことになる。今後は、この変異体の解析も同時進行で行っていくこととする。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
突然変異体原因遺伝子の同定は、2種類の突然変異体のうち1種類であり、やや進展が遅いものの、突然変異体の形態観察や新たな突然変異体の同定については順調あるいは予想以上に良い結果が得られている。
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Strategy for Future Research Activity |
未同定の突然変異体の原因遺伝子については同定を急ぎ、同定したものについては、発現解析を行う。また、突然変異体の分子マーカーによる解析を進め、突然変異体で融合葉が生じる原因について推定できるよう努力する。
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Causes of Carryover |
1遺伝子のクローニングは遅れており、その遺伝子が明らかになってから行う実験をまだ行ってないため。
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Expenditure Plan for Carryover Budget |
次世代シーケンサデータを用いて遺伝子のクローニングを進め、その後の発現解析などを行う。
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[Journal Article] Genetic Analysis of Cadmium Accumulation in Shoots of Sorghum Landraces.2017
Author(s)
Tsuboi K, Shehzad T, Yoneda J, Uraguchi S, Ito, Y, Shinsei L, Morita S, Rai H, Nagasawa N, Asari K, Suzuki H, Itoh R, Saito T, Suzuki K, Takano I, Takahashi H, Sakurai K, Watanabe A, Akagi H, Tokunaga T, Itoh M, Hattori H, Fujiwara T, Okuno K, Tsutsumi, N and Satoh-Nagasawa N
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Journal Title
Crop Science
Volume: 57
Pages: 22-31
DOI
Peer Reviewed
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