2015 Fiscal Year Research-status Report
次世代シーケンサーによるビワ連鎖地図の構築と果実形質等を選抜できるマーカーの獲得
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15K07293
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| Research Institution | Saga University |
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Principal Investigator |
福田 伸二 佐賀大学, 農学部, 講師 (70503770)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
永野 幸生 佐賀大学, 総合分析センター, 准教授 (00263038)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | ビワ / 連鎖地図 / 抵抗性 / QTL解析 / 果実形質 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
１．次世代シーケンサーによるマーカー開発 連鎖地図解析用集団の全個体においてDNAを抽出・精製を行い、次世代DNAシークエンサーによるDNA配列解読を行った結果、Total read bases (bp)6,340,251,507、Total reads 124,318,657の情報が得られた。今後、そのビッグデータからSNPs マーカーやRFLP マーカーをできる限り取得し、連鎖地図の構築を図る。
２． 果実形質に関する遺伝解析 連鎖地図解析用集団における果実形質(果実の大きさ、糖度、酸度、熟期、果肉色)や開花時期の調査を行った。今後もQTL 解析のためのデータを積み重ねる。
３． 病害抵抗性の遺伝解析 がんしゅ病AおよびCグループ菌の抵抗性検定を行い、Cグループ菌抵抗性と連鎖するDNAマーカーを開発し、抵抗性遺伝子の座乗位置を明らかとした。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
１．次世代シーケンサーによるマーカー開発、２．果実形質に関する遺伝解析および３．病害抵抗性の遺伝解析の３項目について順調にデータが蓄積されている。
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| Strategy for Future Research Activity |
１．次世代シーケンサーによるマーカー開発 ビッグデータからSNPsマーカーやRFLPマーカーをできる限り取得し、１染色体当たり、100 マーカー以上を取得し、ビワ標準連鎖地図を作成する。
２．果実形質に関する遺伝解析 果実形質(果実の大きさ、糖度、酸度、熟期、果肉色)や花の開花時期の調査を行い、QTL 解析のためのデータを積み重ねる。また、糖については、全糖含量のみならず、糖組成についても調査する。
３．病害抵抗性の遺伝解析 がんしゅ病(AおよびCグループ菌の2レース)の抵抗性検定結果を基にビワの高密度連鎖地図にマッピングし、連鎖マーカーを獲得する。
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| Causes of Carryover |
本年度から予定していたビワ果汁中の糖組成の分析が実験機器等の調整の遅れで、実施できなかったことにより、差額を生じさせてしまいました。現在は調整も終了し、順次解析できる体制を整えた。なお、果汁もディ―プフリーザにて保存中であるので研究の進展には影響しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
１．次世代シーケンサーによるマーカー開発 ビッグデータからマーカーを取得し、１染色体当たり、100 マーカー以上を取得し、ビワ標準連鎖地図を作成する。
２．果実形質に関する遺伝解析 果実形質(果実の大きさ、糖度、酸度、熟期、果肉色)や花の開花時期の調査を行い、QTL解析のためのデータを積み重ねる。また、糖については、全糖含量のみならず、糖組成についても調査する。
３． 病害抵抗性の遺伝解析 がんしゅ病(A およびC グループ菌の2 レース)の抵抗性検定は終了したのでビワの高密度連鎖地図にマッピングし、密接に連鎖する連鎖マーカーを獲得する。
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