2017 Fiscal Year Annual Research Report
Construction of a High-Density Linkage Map for loquat Using RAD-Seq and development of DNA markers on Fruit traits
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15K07293
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| Research Institution | Saga University |
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Principal Investigator |
福田 伸二 佐賀大学, 農学部, 准教授 (70503770)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
永野 幸生 佐賀大学, 総合分析実験センター, 准教授 (00263038)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | ビワ / 連鎖地図 / QTL解析 / 果実形質 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
RAD-seq分析の結果，1427個のSNP多型マーカーを得た．このSNPマーカーとSSRマーカーの遺伝子型データを供試して解析した結果，合計966個（SNP:795，SSR:170，その他:1）のマーカーが座乗する17連鎖群の全長1724.8 cMの連鎖地図を構築することが出来た．各連鎖群の長さは63.7～156.0（cM／本）の範囲にあり，平均のマーカー密度は1.80（cM/loci）の高密度であった．
表現型評価の結果，出蕾期，開花盛期及び収穫期は，いずれも正規分布を示すデータであり，この3つの形質は，QTLに支配されることが示唆された．QTL解析の結果，出蕾期のQTLはLo12において検出された．近傍マーカーは，538であった．また，開花盛期のQTLはLo12及びLoCにおいて検出された．近傍マーカーは，Lo12においては6538であり，LoCにおいては12773であった．収穫日のQTLは LoA+LoD及びLoBにおいて検出された．近傍マーカーは，LoA+LoDにおいては15065であり，LoBにおいては2349であった．
次に果実形質のQTLの解析の結果，糖度のQTLは2016年にLo9及びLoCにおいて検出された．近傍マーカーは，Lo9は4858で，LoCは497であった．酸度のQTLは2015年にLo10及びLoBにおいて検出された．近傍マーカーは，Lo10は8104で，LoBは13906であった．硬度のQTLは，2015年及び2016年にLo6において検出された．近傍マーカーは，両年において3230であった．果実重のQTLは，2017年にLo7及びLo10において検出された．収穫期のQTLは，2016年及び2017年の2年間において検出された．2016年は，Lo4及びLoBに検出された．近傍マーカーは，Lo4は6102で，LoBは2394であった．また，2017年は，Lo1及びLoBに検出された．以上の結果から本研究において，世界で初めてビワの果実形質に関するQTLを検出した．また，バラ科果樹のリンゴやナシにおいても同領域に上記形質のQTLが検出されていることから，バラ科果樹間の属を超えた関連性が示唆された．
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