• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2017 Fiscal Year Annual Research Report

Identification and characterization of novel biocontrol factors from plant-protecting bacteria

Research Project

Project/Area Number 15K07318
Research InstitutionNational Agriculture and Food Research Organization

Principal Investigator

竹内 香純  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 生物機能利用研究部門, 上級研究員 (40370663)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywordsバイオコントロール / 植物保護細菌 / 二次代謝産物 / 遺伝子発現制御 / ゲノム解析
Outline of Annual Research Achievements

環境中に広く生息するPseudomonas属細菌は、二次代謝産物のバリエーションに富むものが多く、それらが本属細菌の各種の表現型に結びついている。すなわち植物病原毒素は植物病原細菌特有の二次代謝産物であり、植物保護細菌特有のものは病原微生物の増殖を抑える抗菌性物質として作用する。しかし微生物ゲノム情報が飛躍的に蓄積しつつある昨今においてなお、そうした二次代謝産物とその合成酵素遺伝子の特徴づけがなされている細菌はごく一部のモデル系統に限られている。本研究では、様々な植物の根圏から単離された植物保護細菌を対象とし、それらのゲノムデータをもとに新たなバイオコントロール因子とその合成酵素遺伝子群を明らかにすることを目的とする。
平成29年度は、植物保護細菌Pseudomonas protegensの近縁系統であるPseudomonas sp. Os17株における新規バイオコントロール因子の候補遺伝子群(前年度までに同定済み)がコードするタンパク質の特異的抗体を得て、ウエスタンブロット解析により各遺伝子の欠損変異株における発現パターンを明らかにした。また、P. protegensでは、抗菌性に関与する因子の発現は二成分制御系GacS/GacAにより制御されており、Os17株にも同様の機能が保存されていることから、当該遺伝子の発現制御機構について調べたところ、プロモーター活性とタンパク質発現レベルのいずれもがgacA欠損変異株で顕著に低下することが明らかとなり、他のバイオコントロールと同様の制御下にあることが明らかとなった。以上のことから、ゲノムデータに基づくバイオコントロール因子の探索方法が有効であることが示された。

  • Research Products

    (7 results)

All 2018 2017

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] GABA, A Primary Metabolite Controlled by the Gac/Rsm Regulatory Pathway, Favors a Planktonic Over a Biofilm Lifestyle in Pseudomonas protegens CHA0.2018

    • Author(s)
      Kasumi Takeuchi
    • Journal Title

      Mol Plant Microbe Interact

      Volume: 31 Pages: 274-282

    • DOI

      10.1094/MPMI-05-17-0120-R

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] シュードモナス~基礎と応用をつなぐ2018

    • Author(s)
      竹内香純
    • Journal Title

      アグリバイオ

      Volume: 2 Pages: 26-30

  • [Journal Article] Pseudomonas protegens-植物の守護者と命名された細菌2017

    • Author(s)
      染谷信孝、諸星知広、竹内香純
    • Journal Title

      土と微生物

      Volume: 71 Pages: 37-43

    • DOI

      10.18946/jssm.71.2_37

  • [Presentation] ゲノムマイニングによるPseudomonas sp. Os17の抗菌性関連遺伝子の探索と解析2018

    • Author(s)
      竹内香純、土屋渉、染谷信孝、山崎俊正
    • Organizer
      平成30年度 日本植物病理学会大会
  • [Presentation] GABAはPseudomonas protegensの浮遊状態を促進する2017

    • Author(s)
      竹内香純、Dieter Haas
    • Organizer
      平成29年度 日本植物病理学会大会
  • [Presentation] 「植物の守り菌」-日本産Pseudomonas protegensの探索と機能解析2017

    • Author(s)
      染谷信孝、諸星知広、海野佑介、窪田昌春、竹内香純
    • Organizer
      環境微生物系学会合同大会2017
  • [Presentation] 植物保護効果を有するPseudomonas属細菌による抗菌物質生産制御機構の解析2017

    • Author(s)
      久勝順平、染谷信孝、竹内香純、諸星知広
    • Organizer
      第69回 日本生物工学会大会

URL: 

Published: 2018-12-17  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi