2016 Fiscal Year Research-status Report
危機的状況にあるリュウキュウアユの存続に向けたメタ個体群構造の解明
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15K07538
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| Research Institution | Research Institute for Humanity and Nature |
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Principal Investigator |
武島 弘彦 総合地球環境学研究所, 研究基盤国際センター, 特任助教 (50573086)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
安房田 智司 大阪市立大学, 大学院理学研究科, 准教授 (60569002)
井口 恵一朗 長崎大学, 水産・環境科学総合研究科(環境), 教授 (00371865)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | 生物多様性 / 絶滅危惧種 / リュウキュウアユ / DNA分析 / メタ個体群 / 保全 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
喪失と変質が深化している淡水生態系において，絶滅危惧種「リュウキュウアユ」は，その自然個体群を奄美大島に残すのみとなった．本研究は，リュウキュウアユの具体的な保全策・存続手法の提案のために不可欠な，メタ個体群の実態解明を，(1)生態調査と(2)遺伝分析の，2つのアプローチから追求することを目的としている．
第2年度である本年度は，(1)に関しては，昨年度に絞り込んだ，21の調査ターゲット河川について，河川生息環境データを取得し，生息に適した環境条件を検討した．(2)に関しては，リュウキュウアユにも適用可能な，アユの大規模なマイクロサテライトDNA分析システムに関する論文を公表した．昨年度進めた，糞便からのDNA分析の有効性を精査したものの，ネガティブな結果を得たため，11の河川から，仔魚ならびに親魚の合計559個体を，新規に採集した．リュウキュウアユについて，40マーカーを越えるマイクロサテライトDNA分析システムを確立し，本研究にて採集した新規個体，ならびに既存個体についてDNA分析，ならびにデータ解析を進めている．
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究は，2つの研究アプローチ(1)生態調査と(2)遺伝分析により達成される．
(1)に関しては，昨年度再調整した21の調査ターゲット河川について，河川生息環境データを取得することができた．
(2)に関しては，昨年度から進めてきた，非侵襲的な糞便からのDNA分析について，予備実験により有効性が望めない結果が得られたため，特別に個体採捕の許可を鹿児島県に申請し，新規に559個体を採集した．継続して進めてきた，大規模マイクロサテライトDNA分析システムの構築については，計画通りに30マーカーを越える分析系を確立し，既存のマーカーを含めて，40マーカーを越える分析系を調整できた．この大規模分析システムに関する論文の公表が行われ，新規採集個体，ならびに既存の個体について，大規模ジェノタイピングが計画通りに実施されてきている．
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| Strategy for Future Research Activity |
最終年度も，分担研究者間の協力連携のもと，着実に研究を推進する．
初年度と第2年度に，河川環境等の生態データの取得と，新規個体のサンプリング，大規模遺伝データ取得のための分析基盤の構築が達成され，遺伝データの取得も進んでいる．これらのデータに基づいて，第2年度に実施できなかった，メタ個体群構造推定のための解析を実施・検討し，成果の取りまとめに向けて効果的に研究を推進する．
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| Causes of Carryover |
新規に採集した個体の大規模DNA分析を，2年度の後半から最終年度の前半にかけて集中的に行うために，次年度使用額とした．
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
最終年度使用額と合わせて，速やかな利用により，着実に研究を推進する．
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[Journal Article] Rapid and effective isolation of candidate sequences for development of microsatellite markers in 30 fish species by using kit-based target capture and multiplexed parallel sequencing2017
Author(s)
Takeshima, H., Muto, N., Sakai, Y. Ishiguro, N., Iguchi, K., Ishikawa, S., Nishida, M.
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Journal Title
Conservation Genetics Resources
Volume: First Online
Pages: 1-12
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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