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2016 Fiscal Year Research-status Report

ナチュラルバリエーションを利用した植物の高温耐性付与遺伝子の探索

Research Project

Project/Area Number 15K07845
Research InstitutionTokyo University of Agriculture

Principal Investigator

太治 輝昭  東京農業大学, 応用生物科学部, 教授 (60360583)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords高温耐性 / シロイヌナズナ / エコタイプ / ナチュラルバリエーション
Outline of Annual Research Achievements

本年度については、①シロイヌナズナ近縁の高温耐性植物Eutrema salsugineum (Thellungiella salsuginea)より得られた高温耐性付与遺伝子Heat shock factor A1d (HsfA1d) 導入トマトの作出と評価、および②高温耐性シロイヌナズナDa(1)-12と高温感受性シロイヌナズナEi-2を用いた高温耐性遺伝子座の同定を進めた。①については、前年度までに作成したHsfA1d導入トマトにおけるHsfA1d遺伝子発現量が低く、HsfA1dが転写制御すると予想されるHeat Shock Protein (HSP)群についても高発現が認められない問題が生じたことから、新たに形質転換体を作成することにした。前回との変更点としては、1)遺伝子を導入するベクターをトマトで実績のあるベクターに変更する、2)E. salsugineum由来のEsHsfA1dに加え、トマト内在性のオーソログ遺伝子であるSlHsfA1d、およびトマトHsfA1ホモログ遺伝子の内、高温により遺伝子発現誘導が認められるSlHsfA1b1を用いてトマトへの形質転換を行った。まだ種子まで得られていないものの、作出したそれぞれの形質転換体における導入遺伝子の発現量、およびHSP群発現量を確認した結果、導入遺伝子・HSP群ともに野生型と比較して高発現している形質転換体を獲得することに成功した。②については、前年度にEi-2 x Da(1)-12にDa(1)-12を3回掛け戻すことで作出したNear Isogenic Lines (NILs)の高温耐性と遺伝子型を解析することで、高温耐性に寄与する遺伝子座を144kbp内まで絞り込むことに成功した。加えて、両accessionをゲノムシークエンスすることで144kbp内に存在する全遺伝子多型の検出を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

高温耐性トマトの作出に向けては、新たにベクターを変更し、かつ複数種類のHsfA1遺伝子群を導入したことで、目的遺伝子の過剰発現、および高温耐性向上の肝となるHSP遺伝子群の高発現が確認出来たのは大きな進捗であった。また、シロイヌナズナaccession間に見られる高温耐性バリエーションの解析については、昨年作成したNILにより原因遺伝子座を精密に絞り込むことに成功したことのみならず、目的遺伝子座のみで大きな高温耐性の差を生じることを明らかにすることが出来た。さらにゲノムシークエンスにより非同義置換を誘導する遺伝子が分かったことから、原因遺伝子の候補を大きく絞り込むことに成功した。

Strategy for Future Research Activity

HsfA1導入トマトの解析については、種子の獲得と増産を行い、耐性試験およびRNAseqによる導入遺伝子の影響、すなわち下流遺伝子の特定を進める。耐性試験については、共同研究先である筑波大学の江面博士および星川博士に協力頂き、長期高温ストレス下におけるストレス耐性試験を行う。特にトマトの高温障害として知られる、着果不良(高温による影響が出やすい花粉への影響確認)・不良果(着色不良)・尻腐れ果・日焼け果への影響を調べる。また最終年度となるため、論文作成を行う。
シロイヌナズナaccession間に見られる高温耐性バリエーションの解析については、原因遺伝子領域として絞り込みに成功した144kbp間における非同義置換を有する遺伝子を優先的に、相補試験による原因遺伝子の特定を行う。具体的には、高温感受性NILにDa(1)-12(耐性)由来の遺伝子を相補、あるいは耐性NILにEi-2(感受性)由来の遺伝子を相補する試験により決定する。またほとんどEi-2ゲノムを有するが、非常に小さな領域のみDa(1)-12(耐性)由来のゲノムを持つだけで耐性を示すNILが得られたことから、このNILとEi-2を用いた様々な生理学試験およびRNAseq解析を行うことで、原因遺伝子がどのようなメカニズムで高温耐性の差を生み出すのかを明らかにする。

  • Research Products

    (9 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Max Planck Institute for Plant Breeding(Germany)

    • Country Name
      Germany
    • Counterpart Institution
      Max Planck Institute for Plant Breeding
  • [Presentation] シロイヌナズナ塩馴化後浸透圧耐性獲得株の単離・解析2017

    • Author(s)
      國武悟, 有賀裕剛, 井内聖, 小林正智, 坂田洋一, 林隆久, 太治輝昭
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      鹿児島県
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるABA非依存経路を介した塩馴化後浸透圧応答のトランスクリプトーム解析2017

    • Author(s)
      成島純平, 有賀裕剛, 田中啓介, 坂田洋一, 林隆久, 太治輝昭
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      鹿児島県
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] Arabidopsis thaliana accessions間に見られる高温耐性ナチュラルバリエーションの解析2017

    • Author(s)
      中村浩太朗, 井内聖, 小林正智, 坂田洋一, 林隆久, 太治輝昭
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      鹿児島県
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] 高温耐性シロイヌナズナDa(1)-12と高温感受性Ei-2間における遺伝学的解析2017

    • Author(s)
      佐藤瑛梨奈, 有賀裕剛, 中村浩太朗, Luis Barboza, 田中啓介, 坂田洋一, 林隆久, 太治輝昭
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      鹿児島県
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] 耐塩性Arabidopsis thaliana Bu-5を用いた塩馴化後浸透圧耐性欠損変異株の単離と遺伝学的解析2017

    • Author(s)
      内田康平, 田中啓介, 野澤樹, 長谷純宏, 鳴海一成, 坂田洋一, 林隆久, 太治輝昭
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      鹿児島県
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] A single NLR immunity locus underlies species-wide variation in acquired osmotolerance in Arabidopsis thaliana2016

    • Author(s)
      Teruaki Taji
    • Organizer
      International Workshop on Soil-Microbe-Plant Interaction
    • Place of Presentation
      倉敷市
    • Year and Date
      2016-12-03 – 2016-12-04
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 耐塩性Arabidopsis thaliana Bu-5 を用いた塩馴化後浸透圧耐性欠損変異株の単離と解析2016

    • Author(s)
      内田康平, 吉原亮平, 長谷純宏, 鳴海一成, 野澤樹, 井内聖, 小林正智, 坂田洋一, 林隆久, 太治輝昭
    • Organizer
      日本植物学会
    • Place of Presentation
      沖縄県
    • Year and Date
      2016-09-16 – 2016-09-19
  • [Presentation] Arabidopsis thaliana のナチュラルバリエーションを利用した高温耐性メカニズムの解析2016

    • Author(s)
      中村浩太朗, 有賀裕剛, 井内聖, 小林正智, 坂田洋一, 林隆久, 太治輝昭
    • Organizer
      日本植物学会
    • Place of Presentation
      沖縄県
    • Year and Date
      2016-09-16 – 2016-09-19

URL: 

Published: 2018-01-16  

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