2015 Fiscal Year Research-status Report
HLA関連眼疾患におけるゲノム全域を対象とした遺伝子間相互作用の検討
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15K08331
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
安村 玲子 横浜市立大学, 附属病院, 助教 (80534362)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
目黒 明 横浜市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任講師 (60508802)
水木 信久 横浜市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (90336579)
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| Project Period (FY) |
2015-10-21 – 2018-03-31
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| Keywords | ベーチェット病 / サルコイドーシス / HLA / 遺伝子間相互作用 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ベーチェット病およびサルコイドーシスは免疫系の異常が発症の要因となる疾患である。いずれの疾患においても、その免疫系の異常には何らかの遺伝要因が関与していることが示唆されており、HLA遺伝子が両疾患の有力な遺伝要因である。ベーチェット病ではHLA-B遺伝子が、サルコイドーシスではHLA-DRB1遺伝子が発症リスクと顕著に相関することが知られている。近年、HLA関連免疫疾患において、HLA遺伝子が他の遺伝子との相互作用により、疾患の発症リスクを有意に上昇させることが報告されている。したがって本研究では、ベーチェット病およびサルコイドーシスについて、ゲノム全域の遺伝子を対象に、HLA遺伝子と遺伝子間相互作用を示す遺伝子の網羅的なスクリーニングを行う。
平成27年度は、すでに取得している日本人集団を対象としたベーチェット病およびサルコイドーシスのゲノムワイド関連解析（GWAS）データおよびHLAアリルデータを用いて、HLA遺伝要因と遺伝子間相互作用を有する遺伝子のゲノムワイドなスクリーニングを行い、各々の疾患において、HLA遺伝子と遺伝子間相互作用を示す遺伝子多型を網羅的に検出した。
今後継続して本研究を遂行することで、ベーチェット病およびサルコイドーシスにおいて、HLA遺伝子と遺伝子間相互作用を示す遺伝子の同定が期待される。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究では、ベーチェット病およびサルコイドーシスを対象に、すでに取得しているGWASデータを用いて、HLA遺伝要因と遺伝子間相互作用を有する遺伝子のゲノムワイドなスクリーニングを行う。
現在までに、日本人集団のGWASデータを用いた解析を完了し、各々の疾患において、HLA遺伝子と遺伝子間相互作用を示す遺伝子多型を網羅的に検出している。
以上より、本研究は当初の研究計画のとおり、「おおむね順調に進展している。」といえる。今後引き続き研究を進めることで、当初の目標を達成できると考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成27年度に特定したHLA遺伝要因との遺伝子間相互作用の再現性を新たな患者・健常者集団を用いて評価する。ベーチェット病では、新たな独立した集団としてトルコ人および韓国人を、サルコイドーシスでは、新たな独立した集団として日本人、チェコ人およびドイツ人を用いる予定である。
その後、特定したHLA遺伝要因と遺伝子間相互作用を示す遺伝子を対象に機能解析を実行し、特定した遺伝子が関与する疾患発症のメカニズムを解明する。
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