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2016 Fiscal Year Research-status Report

若年性大腸癌の発症における新規原因遺伝子の探索

Research Project

Project/Area Number 15K08335
Research InstitutionResearch Institute for Clinical Oncology, Saitama Cancer Center

Principal Investigator

赤木 究  埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 腫瘍診断・予防科, 科長(兼)部長 (30244114)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 角田 美穂  埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 腫瘍診断・予防科, 研究員 (60347359)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords若年癌 / 原因遺伝子 / 胚細胞性変異
Outline of Annual Research Achievements

昨年度の解析で、若年大腸がんにおける網羅的な遺伝子変異解析は、かなりの確率(10症例中2例)でgermlineでの原因遺伝子候補を検出できるということが明らかになった。近年、AYA世代の癌患者におけるgermline遺伝子変異について数多くの報告が成されており、原因遺伝子の同定あるいは候補遺伝子の抽出を行う事によって予後予測やサーベイランスの計画立案をより精密に行う事が可能である。その結果は患者本人のQOL向上だけでなく、血縁者に対しても健康増進に大きく寄与できると考えられる。そこで我々は癌腫をMSS(マイクロサテライト安定性)大腸癌に加えて、MSI-H(マイクロサテライト不安定性)大腸癌のうち、MMR遺伝子変異(Lynch症候群)やMLH1遺伝子プロモーターメチル化等の原因が明らかになっていない症例、BRCA遺伝子等に変異の見つかっていない乳癌にも拡大し、prospectiveに遺伝子変異の解析を行った。その結果、大腸癌症例からBUB1B1、BRCA1、BMPR1A、AXIN2等の原因遺伝子候補が検出された。また、乳癌症例からはTP53のデータベースに登録の無いフレームシフト変異が見つかった。さらにすでに解析済みの症例について、Ingenuity Variant Analysisを用いてアノテーション付けを行い、公開されている公共のデータベースでは判断できない文献レベルでの情報を用いて解析中である。また、過去の若年大腸癌症例についても症例数を増やすべく順次解析中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

若年癌におけるGermline遺伝子変異について注目度が高まってきている中で、早い段階で原因遺伝子の解析をProspectiveに行うことが可能となり、実際にいくつかの候補が検出された。また、過去の症例についても解析が進行中であり、おおむね順調に進展していると考えられる。

Strategy for Future Research Activity

継続して症例数を増やし、候補遺伝子についての検証を行っていく。また、明らかになった新規の原因遺伝子あるいは新規の変異については、早期のデータベース登録を目指し、学会や論文の形で報告を行っていく。

Causes of Carryover

臨床的なニーズの高まりにより、Prospectiveな解析を行ったため、試薬類は当初計画よりも多く使用しているが、ライブラリ作成キットの効率的な使用、シーケンスコストの低下により実質的には予算の繰り越しが生じている。

Expenditure Plan for Carryover Budget

計画通り次年度にも10例程度の解析を進める予定であり、さらに新たに見出された若年がんの症例についても解析を進める。

  • Research Products

    (4 results)

All 2016

All Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Presentation] Analysis of responsible gene in early-onset colorectal cancer2016

    • Author(s)
      Gou Yamamoto
    • Organizer
      第75回日本癌学会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2016-10-06 – 2016-10-08
  • [Presentation] 腫瘍診断予防科 若年性大腸癌の原因遺伝子検索-Lynch症候群を中心に-2016

    • Author(s)
      藤吉健司
    • Organizer
      第85回大腸癌研究会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2016-07-01 – 2016-07-01
  • [Presentation] 若年性大腸がんのTranscriptome解析2016

    • Author(s)
      山本 剛
    • Organizer
      第22回日本家族性腫瘍学会学術集会
    • Place of Presentation
      愛媛
    • Year and Date
      2016-06-03 – 2016-06-04
  • [Presentation] Mutation spectrum of Japanese Lynch syndrome patients diagnosed by Universal tumor screening for colorectal cancer2016

    • Author(s)
      Kiwamu Akagi
    • Organizer
      ICHG
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2016-04-03 – 2016-04-07
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-01-16  

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