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2015 Fiscal Year Research-status Report

Immuno-MS(質量分析)の臨床検査応用に向けた免疫複合体MS前処理法の開発

Research Project

Project/Area Number 15K08611
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

西村 基  千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (80400969)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 佐藤 守  千葉大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (20401002)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords臨床検査医学 / イムノアッセイ / 質量分析
Outline of Annual Research Achievements

本研究においては申請時に述べた通り、平成27年度においては、免疫複合体より測定対象系である抗原(ペプチド・たんぱく質)を簡便に分離する方法の確立を行った。既存のイムノアッセイは定量を目的としたものが多く、既存の検出系(濁度計など)で明確に検出するため、免疫複合体中の抗原と抗体の質量比は大きく抗体側に傾いている。したがって単純に免疫複合体を質量分析の対象としても、観察されるのは抗体由来の部分が大半を占めると思われ、やはり適切・簡便な前処理を行って抗体成分を減少させることが重要と考えられる。
申請時には低濃度のSDSと加熱により抗体を変性させ、その後、限外ろ過で高分子量の抗体を除去できる可能性を示した。繰り返し実験を行うと、除去できることが多い物の、無視できない回数で除去に失敗し、再現性が悪いことが判明した。したがってこれも申請時に述べたとおり、抗体を固相化する方法に切り替えることで再現性および除去効率の改善に取り組んだが、改善は乏しかった。
数々の方法にチャレンジした結果、結局もっとも再現性良く除去が見込める方法は、輸血検査で用いられている方法にヒントを得た、酸で免疫複合体を処理した上で限外ろ過を行う方法であった。抗体成分を完璧に除去できるとまではいかないものの、処理前の免疫複合体では大きく抗体側に傾いている抗原と抗体の質量比を、この比較的簡便な処理により再現良く大幅に改善する事が可能であった。
100%純粋な抗原が得られなくとも、精密測量を観測するという質量分析計の特性から、この程度の粗精製物でも質量分析で解析対象にすることは可能と考えられ、目下、再現性の良い、前処理後の質量分析プロトコールの確立に取り組んでいる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

H27年度半ばに、申請時の申請書に記した研究協力者のS.T.Nが出産のため産休を取得したため進捗状況のペースが落ちたことは否めない。
さらに、研究実績の概要で述べた通り、当初「免疫複合体のMS(質量分析)前処理法」として採用する予定であったSDS処理の、前処理として用いた際の再現性の悪さが判明したため、代替法(これも述べた通り、酸処理)の開発を行ったため、やや遅れたところがある。
S.T.Nの産休が終了し現在、研究に復帰していること及び代替法の開発により、今後は予定通りの進捗が見込めると考えている。

Strategy for Future Research Activity

「現在までの進捗状況」で述べた通り、代替法の開発に要した期間はあるが、それを除けば今後は予定通りの進捗を見込んでいる。
具体的には予定通り、臨床検査試薬・研究的イムノアッセイの検出系を質量分析器とすることで、Immuno-MS化を手掛けていく。

Causes of Carryover

H27年度半ばに、申請時の申請書に記した研究協力者のS.T.Nが出産のため産休を取得したため本研究の進捗状況のペースが落ちたことは否めない。
反面、産休で実験が滞った分の次年度使用額が生じた。

Expenditure Plan for Carryover Budget

研究協力者のS.T.Nは既に産休より研究に復帰しており、順次、必要な実験を実施するに伴い、「次年度使用額」により試薬を購入する予定である。

  • Research Products

    (10 results)

All 2016 2015

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Combined Secretomics and Transcriptomics Revealed Cancer-Derived GDF15 is Involved in Diffuse-Type Gastric Cancer Progression and Fibroblast Activation.2016

    • Author(s)
      Ishige T, Nishimura M, Satoh M, Fujimoto M, Fukuyo M, Semba T, Kado S, Tsuchida S, Sawai S, Matsushita K, Togawa A, Matsubara H, Kaneda A, Nomura F.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Pages: 21681

    • DOI

      doi: 10.1038/srep21681.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Familial lamin A/C mutation cardiomyopathy with arrhythmia substrate detected by cardiac magnetic resonance imaging and electroanatomical mapping.2016

    • Author(s)
      Nishi T, Takaoka H, Funabashi N, Nishimura M, Ohara O, Makiyama T, Ueda M, Kajiyama T, Kobayashi Y.
    • Journal Title

      International Journal of Cardiology

      Volume: 209 Pages: 248-252

    • DOI

      doi: 10.1016/j.ijcard.2016.02.030.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Detection of Ubiquitinated Dermcidin in Gingival Crevicular Fluid in Periodontal Disease2015

    • Author(s)
      Sachio Tsuchida , Mamoru Satoh, Masaki Takiwaki, Michiru Wakabayashi, Takayuki Ishige, Minako Beppu, Motoi Nishimura, Kazuyuki Matsushita, Fumio Nomura
    • Journal Title

      International Journal of Peptide Research and Therapeutics

      Volume: 1 Pages: 1-5

    • DOI

      doi:10.​1007/​s10989-015-9504-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of Nocardia species using matrix-assisted laser desorption/ionization-time-of-flight mass spectrometry.2015

    • Author(s)
      Segawa S, Nishimura M, Sogawa K, Tsuchida S, Murata S, Watanabe M, Matsushita K, Kamei K, Nomura F.
    • Journal Title

      Clinical Proteomics

      Volume: 12 Pages: 6

    • DOI

      doi: 10.1186/s12014-015-9078-5.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Assessment of Vitamin D Metabolism by LC-MS/MS2015

    • Author(s)
      Ishige T, Satoh M, Ogawa S, Nishimura M, Higashi T, Nomura F.
    • Journal Title

      Rinsho Byori.

      Volume: 63 Pages: 457-464

  • [Journal Article] Laboratory medicine and sex differences2015

    • Author(s)
      Nishimura M, Nomura F.
    • Journal Title

      Nihon Rinsho

      Volume: 73 Pages: 587-600

  • [Presentation] 大学検査部に適した「質量分析手法を用いた次世代臨床検査」とは2015

    • Author(s)
      西村基
    • Organizer
      日本臨床検査医学会
    • Place of Presentation
      長良川国際会議場(岐阜県岐阜市)
    • Year and Date
      2015-11-19 – 2015-11-22
    • Invited
  • [Presentation] 自動分析法による血清25ヒドロキシビタミンD測定値の標準化:SRM 972aを校正に用いた測定2015

    • Author(s)
      西村 基、佐藤 守、石毛崇之 、東 達也、 野村 文夫
    • Organizer
      日本臨床化学会
    • Place of Presentation
      大阪大学コンベンションセンター(大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2015-10-30 – 2015-11-01
    • Invited
  • [Presentation] QT延長症候群遺伝子検査の次世代シーケンサーを用いた立ち上げとこれにより変異同定に至った Jervell and Lange-Nielsen Syndrome(JLNS) の一家系2015

    • Author(s)
      西村基 宇津野 恵美 上田 希彦 江畑 亮太 内海 紀子 糸賀 栄 小原 令子 別府 美奈子 松下 一之 小原 収 野村 文夫
    • Organizer
      日本人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀(東京都江戸川区)
    • Year and Date
      2015-10-14 – 2015-10-17
  • [Presentation] 保険収載された遺伝子検査・遺伝カウンセリング加算と次世代シーケンサー2015

    • Author(s)
      西村基
    • Organizer
      日本遺伝カウンセリング学会
    • Place of Presentation
      三井ガーデンホテル千葉(千葉県千葉市)
    • Year and Date
      2015-06-26 – 2015-06-28

URL: 

Published: 2017-01-06  

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