2015 Fiscal Year Research-status Report
DNAメチル化とマイクロRNAの統合的エピゲノム解析による肝細胞癌の病態解明
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15K09017
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| Research Institution | Kyoto Prefectural University of Medicine |
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Principal Investigator |
安居 幸一郎 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (30323695)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | 肝細胞癌 / エピゲノム / DNAメチル化 / マイクロRNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
癌には多数の体細胞変異（ゲノム異常）だけでなく、エピゲノム異常も生じており、両者が協働して癌の表現型を形成する。本研究は、エピゲノム異常のうちでDNAメチル化とマイクロRNA（microRNA; 以下、miRNA）に焦点を当て、肝細胞癌においてプロモーター領域のDNAメチル化によって発現が抑制されているtumor suppressor miRNAを同定することを目的とする。今年度は、まず、肝細胞癌の癌部と非癌部肝組織におけるDNAメチル化レベルをメチル化アレイで網羅的に検索し、癌部で過剰なDNAメチル化が生じているプロモーター領域のCpG部位を同定した。また、同一サンプルで、miRNAアレイを用いてmiRNAの発現量を網羅的に検索し、非癌部と比べて癌部で有意に発現が上昇あるいは低下しているmiRNAを同定した。次いで、両アレイの結果を統合的に解析した。
それらの結果、癌部で最も発現量が低下していたmiRNA はmiR-214とmiR-199aであった。miR-214とmiR-199aは染色体1q24.3領域に隣接して座位している。興味深いことに、癌部で最も過剰なDNAメチル化が生じていたCpG部位はmiR-214とmiR-199aの共通プロモーター領域のCpG部位であった。すなわち、miR-214とmiR-199aはDNAメチル化によって発現が消失するtumor suppressor miRNA候補であると示唆された
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
肝細胞癌の癌部と非癌部肝組織におけるDNAメチル化レベルとmiRNA発現量をそれぞれアレイで解析することを終了した。そして、DNAメチル化によって発現が消失するtumor suppressor miRNA候補を同定できた。
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| Strategy for Future Research Activity |
miR-214とmiR-199aがそれぞれ標的とするmRNAとその下流のシグナル経路を解明する。具体的には、肝細胞癌の細胞株にmiR-214とmiR-199aそれぞれのmimicとinhibitorを導入し、アルゴリズム解析から標的と予想されるmRNAについて、ルシフェラーゼ・アッセイやウエスタンブロット実験で標的RNAであるかどうか検証する。
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Research Products
(10 results)
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[Journal Article] Genome-wide DNA methylation analysis in hepatocellular carcinoma.2016
Author(s)
Yamada N, Yasui K, Dohi O, Gen Y, Tomie A, Kitaichi T, Iwai N, Mitsuyoshi H, Sumida Y, Moriguchi M, Yamaguchi K, Nishikawa T, Umemura A, Naito Y, Tanaka S, Arii S, Itoh Y.
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Journal Title
Oncol Rep.
Volume: 35
Pages: 2228-2236
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] EVI1, a target gene for amplification at 3q26, antagonizes transforming growth factor-β-mediated growth inhibition in hepatocellular carcinoma.2015
Author(s)
Yasui K, Konishi C, Gen Y, Endo M, Dohi O, Tomie A, Kitaichi T, Yamada N, Iwai N, Nishikawa T, Yamaguchi K, Moriguchi M, Sumida Y, Mitsuyoshi H, Tanaka S, Arii S, Itoh Y.
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Journal Title
Cancer Sci.
Volume: 106
Pages: 929-937
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Effect of PNPLA3 rs738409 variant (I148M) on hepatic steatosis, necroinflammation, and fibrosis in Japanese patients with chronic hepatitis C.2015
Author(s)
Yasui K, Kawaguchi T, Shima T, Mitsuyoshi H, Seki K, Sendo R, Mizuno M, Itoh Y, Matsuda F, Okanoue T.
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Journal Title
J Gastroenterol.
Volume: 50
Pages: 887-893
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Helicobacter pylori infection might have a potential role in hepatocyte ballooning in nonalcoholic fatty liver disease.2015
Author(s)
Sumida Y, Kanemasa K, Imai S, Mori K, Tanaka S, Shimokobe H, Kitamura Y, Fukumoto K, Kakutani A, Ohno T, Taketani H, Seko Y, Ishiba H, Hara T, Okajima A, Yamaguchi K, Moriguchi M, Mitsuyoshi H, Yasui K, Minami M, Itoh Y.
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Journal Title
J Gastroenterol.
Volume: 50
Pages: 996-1004
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Predictors of malignancies and overall mortality in Japanese patients with biopsy-proven nonalcoholic fatty liver disease.2015
Author(s)
Seko Y, Sumida Y, Tanaka S, Taketani H, Kanemasa K, Ishiba H, Okajima A, Nishimura T, Yamaguchi K, Moriguchi M, Mitsuyoshi H, Yasui K, Minami M, Itoh Y.
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Journal Title
Hepatol Res.
Volume: 45
Pages: 728-738
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] EVI1 is a target for gene amplification at 3q26 and suppresses growth inhibition by transforming growth factor-β in hepatocellular carcinoma.2015
Author(s)
Yasui K, Umemura A, Nishikawa T, Yamaguchi K, Moriguchi M, Sumida Y, Mitsuyoshi H, Tanaka S, Arii S, Itoh Y.
Organizer
65th Annual Meeting of the American Association for the Study of Liver Disease (AASLD).
Place of Presentation
San Francisco, USA.
Year and Date
2015-11-17 – 2015-11-17
Int'l Joint Research
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