2016 Fiscal Year Research-status Report
次世代シーケンサーを用いた重症心不全における左室逆リモデリング予測因子の探索
Project/Area Number |
15K09064
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Research Institution | Chiba University |
Principal Investigator |
小林 欣夫 千葉大学, 大学院医学研究院, 教授 (70372357)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
長谷川 洋 千葉大学, 大学院医学研究院, 講師 (50375656)
岡田 将 千葉大学, 医学部附属病院, 医員 (50514725)
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Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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Keywords | 重症心不全 / 拡張型心筋症 / 左室逆リモデリング / 次世代シーケンサー / 補助人工心臓 / 心筋生検 / RNA sequence |
Outline of Annual Research Achievements |
拡張型心筋症に代表される非虚血性の重症心不全の症例のうち、一部は適切な心筋保護薬や心臓再同期療法(CRT)による治療、また補助人工心臓による心負荷の軽減などにより、左室逆リモデリングと呼ばれる心機能の改善を認めることがある。左室逆リモデリングの機序や、その予測については詳細には解明されていない。 本研究では、千葉大学医学部附属病院に入院した非虚血性の重症心不全患者から、経カテーテル的心筋生検あるいは左室補助人工心臓装着手術時に採取される左室心筋組織からRNAを抽出し、次世代シーケンサーを用いたRNA-sequenceにより組織内に発現する遺伝子を定量的に解析する。一方で患者には最大限の内科的治療、外科的治療を行い、左室逆リモデリングと呼ばれる心機能の改善を認めるか否かにより2群に分類する。発現変動遺伝子と左室逆リモデリングの有無との相関関係を解析することにより、左室逆リモデリング予測因子を探索するものである。 当初目標としていた20症例は昨年度の時点で達成され、臨床的に左室逆リモデリングの評価と同時にRNA-sequenceによる遺伝子発現解析を行った。左室逆リモデリングと関連性が示唆される複数の因子の同定に至ったが、研究の精度を高めるために症例数を増やすこととした。今年度までで合計29症例の登録が完了し、そのうち1症例は6ヶ月以内に心臓移植実施のため除外されたが、それ以外に死亡症例等はなく、28症例について継続的に評価・解析を行っている。17症例が補助人工心臓装着症例であった。22症例が6ヶ月後心機能評価が完了した。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初20症例を目標としていたが、症例の登録が順調であること、またRNA-sequenceのコストが当初の見込みよりも少ない額で実施することができていることから、より精度を向上させるために症例登録を引き続き行うこととした。 臨床的な心機能の評価やRNAの抽出、RNA-sequenceの実施、遺伝子発現データの解析については、概ね順調に行うことができている。
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Strategy for Future Research Activity |
登録した症例の臨床的な評価とともに、RNA-sequenceによる遺伝子発現解析を引き続き行う。左室逆リモデリングの有無による2群間での発現変動遺伝子を同定し、それらの因子の分子生物学的意義を検討する。免疫染色などの手法により組織での発現についても検討を行う。それらの所見を総括し、学会発表および論文作成を行う。
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Causes of Carryover |
追加で登録した症例についてRNA-sequenceを行う必要があること、また新たに免疫染色などの評価法を併せて行う予定であるため、次年度使用額が生じた。
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Expenditure Plan for Carryover Budget |
追加で登録した症例に関してRNA-sequenceを実施し、免疫染色を行うための物品費として使用する。29年度が最終年度であり、研究結果について学会発表を行うための旅費・参加費として、また研究の総括として論文作成を行うための費用として使用する予定である。
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Research Products
(4 results)