2016 Fiscal Year Research-status Report
エクソームシーケンスを用いた新規高比重リポ蛋白代謝制御因子の発見とその機能解析
| Project/Area Number |
15K09118
|
|---|
| Research Institution | Kanazawa University |
|---|
Principal Investigator |
川尻 剛照 金沢大学, 医学系, 准教授 (90345637)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
野原 淳 金沢大学, 医学系, 助教 (50313648)
多田 隼人 金沢大学, 附属病院, 助教 (90623653)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
|
| Keywords | 高比重リポ蛋白 / 動脈硬化 / 全エクソームシーケンス |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
動脈硬化症予防を目的に、症例に立脚した高比重リポ蛋白（HDL）代謝異常症の病態解明を目指した研究を引き続き試みている。発端者は①著明な高HDLコレステロール血症（170mg/dL）と②著明な低HDLコレステロール血症2例である。
②低HDLコレステロール血症患者2人（症例1：28歳女性、HDLコレステロール値2mg/dL、症例2：35歳女性、同6mg/dL）と2人の両親（HDLコレステロール値37mg/dL、41mg/dL）、4人の非血縁正常者（平均HDLコレステロール値107mg/dL）の計8人を対象に全エクソームシーケンスを行った。
305,202個の遺伝子多型が見出され、SnpEffを用い良性変異を除外した結果、21,708個のナンセンス変異、ミスセンス変異、スプライス部変異が同定された。さらに1%以上の頻度を認める変異を除外した結果5,192個の変異に絞られ、劣性遺伝に合致する変異、C-スコア10点未満の変異を除外した結果、ABCA1遺伝子変異c.6230C>A、c.6137G>A、c.2842>A、c.1130C>Tが残り、症例1はc.6230C>A/c.6137G>A、症例2はc.2842>A、c.1130C>Tのそれぞれコンパウンドヘテロ接合体（Tangier病）と診断された（Tada H, Kawashiri M et al. Atherosclerosis 240:324-329;2015）。
劣性遺伝性疾患の遺伝子診断に、全エクソームシーケンス法は有用であった。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
全エクソームシーケンス法で著明な低HDLコレステロール血症（2、6mg/dL）2例の遺伝子解析を終了した。新規遺伝子ではなかったため機能解析は見送った。
著明な高HDLコレステロール血症（170mg/dL）症例に見出された新規候補「分子X」の機能解析に着手した。遺伝子改変動物を用いた検討は技術的に困難であり、培養細胞を用いたコレステロール引き抜き研究を先行させることにした。
|
| Strategy for Future Research Activity |
遺伝子導入細胞を用いたコレステロール引き抜き研究を展開する予定である。本研究は防衛医科大学校の研究グループが過去に行っている。研究がやや遅れており、共同研究を視野に研究を進める方針である。
|
| Causes of Carryover |
動物実験による「分子X」機能解析は技術的に困難であるため、培養細胞を用いたコレステロール引き抜き研究を優先させることとした。培養細胞実験の方が安価に実験可能であり、当初計上した予算を余すことが出来た。
|
| Expenditure Plan for Carryover Budget |
培養細胞を用いたコレステロール引き抜き研究を防衛大学の研究グループから教わる必要がある。次年度使用額はその旅費や実験消耗品等に充てる予定である。
|
-
-
-
[Journal Article] Impact of combined lipid lowering and blood pressure control on coronary plaque: myocardial ischemia treated by percutaneous coronary intervention and plaque regression by lipid lowering and blood pressure controlling assessed by intravascular ultrasonography (MILLION) study.2017
Author(s)
Kawashiri MA, Sakata K, Hayashi K, Gamou T, Kanaya H, Miwa K, Ueda K, Higashikata T, Mizuno S, Michishita I, Namura M, Nitta Y, Katsuda S, Okeie K, Hirase H, Tada H, Uchiyama K, Konno T, Ino H, Nagase K, Yamagishi M; Behalf of the MILLION Study Group..
-
Journal Title
Heart Vessels.
Volume: -
Pages: -
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
[Journal Article] A Rare Coincidence of Sitosterolemia and Familial Mediterranean Fever Identified by Whole Exome Sequencing.2016
Author(s)
Tada H, Kawashiri MA, Okada H, Endo S, Toyoshima Y, Konno T, Nohara A, Inazu A, Takao A, Mabuchi H, Yamagishi M, Hayashi K.
-
Journal Title
J Atheroscler Thromb.
Volume: 23
Pages: 884-890
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] Impact of Distal Protection with Filter-Type Device on Long-term Outcome after Percutaneous Coronary Intervention for Acute Myocardial Infarction: Clinical Results with Filtrap2016
Author(s)
Teramoto R, Sakata K, Miwa K, Matsubara T, Yasuda T, Inoue M, Okada H, Kanaya H, Kawashiri MA, Yamagishi M, Hayashi K.
-
Journal Title
J Atheroscler Thromb.
Volume: 23
Pages: 1313-1323
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
[Journal Article] Impact of Baseline Angiographic Complexities Determined by Coronary Artery Bypass Grafting SYNTAX Score on the Prediction of Outcome After Percutaneous Coronary Intervention.2016
Author(s)
Nakahashi T, Sakata K, Nomura A, Yakuta Y, Gamou T, Terai H, Horita Y, Ikeda M, Namura M, Takamura M, Kawashiri MA, Yamagishi M, Hayashi K.
-
Journal Title
Am J Cardiol.
Volume: 118
Pages: 974-979
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
[Book] 呼吸と循環2016
Author(s)
川尻剛照、多田隼人、山岸正和
Total Pages
1239（1087-1094）
Publisher
医学書院
-
[Book] 薬局2016
Author(s)
川尻剛照、多田隼人、山岸正和
Total Pages
3540（2691-2695）
Publisher
南山堂
