2016 Fiscal Year Research-status Report
高次クロマチン構造解析・ゲノム編集による脂肪細胞特異的な遺伝子発現制御機構の解明
Project/Area Number |
15K09378
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
青山 倫久 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (50645538)
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Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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Keywords | 糖尿病 / 肥満 / 脂肪細胞 / 発生・分化 / 遺伝子 / 転写制御 / 高次クロマチン構造 / ゲノム編集 |
Outline of Annual Research Achievements |
脂肪細胞の分化は転写因子のカスケードにより調節されており、中でもマスターレギュレーターであるPPARγとC/EBPαのポジティブフィードバックループは重要な役割を果たすと考えられているが、PPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御領域(エンハンサー)は現在まで不明であった。これまでの我々の検討で、ChIP-seqによるPPARγ結合部位のゲノムワイドな解析などから、既存のアプローチでは明らかでなかったC/EBPα遺伝子の遠位領域に存在する複数のエンハンサー候補領域を同定した。分化に伴いこれらの領域は、エンハンサー上の転写因子とプロモーター上のPolII間を架橋するMED1サブユニットの高度な集積を認め、スーパーエンハンサーを形成していた。ゲノム領域間の3次元的な近接関係を検出する4C (circular chromosome conformation capture)-seqや3C (Chromosome Conformation Capture)法の解析では、遠位エンハンサーとプロモーター間に分化により増強する近接関係を認めた。PPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御において、CTCFを介したスーパーエンハンサーを有するクロマチンループの形成が重要である可能性が示唆された。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
平成28年度について予定していた研究目的は、ほぼ達成し、おおむね順調に進展している。
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Strategy for Future Research Activity |
平成28年度について予定していた研究目的は、ほぼ達成し、おおむね順調に進展していると考えられるため、引き続き当初の計画通り、研究を推進する予定である。
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Research Products
(7 results)
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[Presentation] Formation of a Super-Enhancer Loop Contributes to Transactivation of Cebpa Expression by PPARγ during Adipocyte Differentiation (oral presentation)2016
Author(s)
Tomohisa Aoyama, Hironori Waki, Ken-ichi Wakabayashi, Tsuyoshi Inoue, Masahiro Nakamura, Jing Yu, Atsushi Okabe, Shuichi Tsutsumi, Masato Iwabu, Miki Okada-Iwabu, Kohjiro Ueki, Youichiro Wada, Juro Sakai, Hiroyuki Aburatani, Tatsuhiko Kodama, Toshimasa Yamauchi and Takashi Kadowaki
Organizer
American Diabetes Association 76th Scientific Sessions
Place of Presentation
New Orleans, USA
Year and Date
2016-06-11
Int'l Joint Research
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