2017 Fiscal Year Annual Research Report
Longitudinal analyses of genetic alterations in malignant lymphoma using cell-free DNA: detection of refractory disease related abnormalities and application possibility in clinical trials.
Project/Area Number |
15K09473
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Research Institution | Fujita Health University |
Principal Investigator |
冨田 章裕 藤田保健衛生大学, 医学部, 准教授 (80378215)
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Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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Keywords | リキッドバイオプシー / 悪性リンパ腫 / 血管内大細胞型B細胞リンパ腫 / 網羅的遺伝子変異解析 / 免疫回避 |
Outline of Annual Research Achievements |
びまん性大細胞型B細胞性リンパ腫(DLBCL)の亜型である血管内大細胞型B細胞リンパ腫(IVLBCL)より採取された腫瘍細胞および末梢血無細胞遊離DNA(cfDNA)を用いて、全エクソン解析(WES)を行い、検出された遺伝子変異のvalidationをSanger sequence法により行った。初発IVLBCL (N=21)より得られたcfDNAは、全症例においてWESで解析可能であった。IVLBCLにおけるcfDNA濃度の経時的解析(N=6)では、cfDNA濃度は血清LDH値に相関し、治療効果を反映して経過にともない著明に減少することを確認した。WESにおいては、NFκB経路関連因子における変異が蓄積することが確認され、特にMYD88, CD79B変異の重複が特徴的であった。また、PIM1, IGLL5のsomatic hypermutation、CDKN2A欠失、エピゲノム・転写調節関連因子の変異に加え、免疫回避に関連する因子における変異が蓄積することが確認された。また、免疫回避関連因子の遺伝子座における構造異常(SV)についても検出された。特定の免疫回避関連因子に対する3種類の抗体を用いた免疫組織染色では、異常に見合うパターンでの蛋白発現が確認され、実際の症例において免疫回避関連因子変異やSVが、蛋白発現異常に強く関与していることが示唆された。これらの解析から、IVLBCLにおける遺伝子変異解析にcfDNAは極めて有用であり、また検出される遺伝子変異のパターンを解析することは、臨床現場においてしばしば困難とされるIVLBCLの診断を、より鋭敏で確実にできる方法となり得ることが推測された。この知見をもとに、IVLBCLを疑う症例におけるcfDNAを用いた遺伝子解析の有用性の検討を目的として、前向き臨床試験の実施を計画している。
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Research Products
(12 results)
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[Journal Article] earrangement of VPS13B, a causative gene of Cohen syndrome, in a case of RUNX1-RUNX1T1 leukemia with t(8;12;21).2017
Author(s)
Abe A, Yamamoto Y, Katsumi A, Okamoto A, Tokuda M, Inaguma Y, Yamamoto K, Yanada M, Kanie T, Tomita A, Akatsuka Y, Okamoto M, Kameyama T, Mayeda A, Emi N.
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Journal Title
Int J Hematol.
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Phase II Study of the Efficacy and Safety of Pembrolizumab for Relapsed/Refractory Classic Hodgkin Lymphoma.2017
Author(s)
Chen R, Zinzani PL, Fanale MA, Armand P, Johnson NA, Brice P, Radford J, Ribrag V, Molin D, Vassilakopoulos TP, Tomita A, von Tresckow B, Shipp MA, Zhang Y, Ricart AD, Balakumaran A, Moskowitz CH; KEYNOTE-087.
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Journal Title
J Clin Oncol.
Volume: 92(12)
Pages: 1324-1332
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Emetine elicits apoptosis of intractable B-cell lymphoma cells with MYC rearrangement through inhibition of glycolytic metabolism.2017
Author(s)
Aoki T, Shimada K, Sakamoto A, Sugimoto K, Morishita T, Kojima Y, Shimada S, Kato S, Iriyama C, Kuno S, Harada Y, Tomita A, Hayakawa F, Kiyoi H.
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Journal Title
Oncotarget
Volume: 8(8)
Pages: 13085-13098
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Detection of Recurrent Genetic Mutations in Intravascular Large B-Cell Lymphoma By Comprehensive Genetic Analyses Using Peripheral Blood Circulating Cell-Free DNA.2017
Author(s)
Akihiro Tomita, Kazuyuki Shimada, Kenichi Yoshida, Yasuhiro Suzuki, Chisako Iriyama, Masashi Sanada, Masaaki Yuge, Yusuke Takagi, Shigeru Kusumoto, Yasufumi Masaki, Takahiko Ito, Yuichiro Inagaki, Akinao Okamoto, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, Satoru Miyano, Seishi Ogawa and Hitoshi Kiyoi.
Organizer
59th Annual meeting od American Society of Hematology
Int'l Joint Research
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