甲状腺形成異常におけるメチローム解析

2015 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 15K09630
• Research Institution: Keio University
• Principal Investigator: 鳴海 覚志 慶應義塾大学, 医学部, 助教 (40365317)
• Project Period (FY): 2015-04-01 – 2018-03-31
• Keywords: エピジェネティクス / メチル化異常 / 次世代シーケンシング / 先天性甲状腺機能低下症 / 甲状腺形成異常

Outline of Annual Research Achievements

３年計画の初年度にあたる2015年度は、甲状腺形成異常の発症に関わるメチル化異常領域を探索するため、Post-bisulfite adaptor-tagging (PBAT)法を利用した末梢血白血球細胞由来DNAに対するメチローム解析を、甲状腺形成異常患者由来検体7検体、健常コントロール由来3検体に対して行った。ライブラリの構築は、研究協力者の伊藤隆司氏（九州大学医学部生化学）の研究室で行い、配列決定は理研、および伊藤隆司氏の研究室で行った。患者データとコントロールデータの比較により、約300か所の候補領域を同定した。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初計画した解析を行うことができた。また、得られた解析データも期待されたクオリティに達しており、研究遂行はおおむね順調に推移していると考える。

Strategy for Future Research Activity

平成28年度には、平成27年度に同定した疾患関連候補領域の詳細な解析を行う。具体的には、バイサルファイト処理ダイレクトシーケンシング法による検証実験を、対象検体数を増加して行う。
ゲノムワイド研究である本研究の留意点はβエラーであり、現時点では偽陽性シグナルが多数混入していると考える。そのことを踏まえて、陽性シグナルについてむ十分に注意深く、多角的な検討を行う予定である。

Causes of Carryover

当初予定より安価に入手できた消耗品があり、繰り越しを生じた。

Expenditure Plan for Carryover Budget

繰り越した経費も含めて、平成28年度に適正に使用する。