2016 Fiscal Year Research-status Report
小児骨髄異形成症候群（RAEB, RAEBT）の分子病態解析
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15K09653
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| Research Institution | Okayama University |
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Principal Investigator |
嶋田 明 岡山大学, 大学病院, 准教授 (70391836)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | RAEBT / RAEB / 遺伝子変異 / epigenetic変化 / メチル化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
FAB分類のRAEBT例についてはWHO2008分類ではAMLに分類され、WHO2016分類でも踏襲された。FAB分類のRAEB例に関してもWHO2016分類で大きな変更はみられなかった。RAEB例はこれまで前方視的解析がなかったため、JPLSG AML委員会で観察研究を行うことが決定した。
メチル化解析に関しては、Methylation-Specific Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification(MS-MLPA)法を用いて、25種類の癌抑制遺伝子のpromotorのメチル化解析を実施した。low grade MDSに分類されるRCC (n=5)、RCMD(n=2)ではメチル化はみられなかった。一方high grade MDSのRAEB (n=3)では、ESR1とCADM1遺伝子のメチル化、RAEBT (n=2)ではESR1, CDKN2B, CADM1遺伝子のメチル化がみられた。AML (n=23)では、ESR1, CDKN2B, CADM1, TP73, CDH13,などのメチル化がみられたが(中央値１個、0-5個）、正常検体や寛解期検体のDNAではメチル化はみられなかった。
変異遺伝子解析に関しては、白血病に関与していると考えられる163遺伝子をパネル化したtarget sequenceを行った。RAEB/RAEBT(n=4)では、GATA3, PTPN11, SMARCA2, BRCA2, CREBBP, IKZF3, ASXL1, CRLF2, SETBP1, NRASなどに変異がみられた。これはAML (n=23)と比較して、GATA3, ASXL1などの成人MDS/AMLでは多くみられ、小児のMDS/AMLでは少ない遺伝子変異がみつかっており、興味深い。今後症例数を増やす予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
メチル化解析に関しては、MLPA法による解析に加え、バイサルファイトPCR法を用いた解析も可能となっている。Target sequence法による遺伝子解析もSanger法による確認もできており、可能である。RAEB/RAEBTの多数例での解析について、院内の倫理審査は通過し、JPLSGの倫理審査の結果をまってから解析を開始する予定である。
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| Strategy for Future Research Activity |
JPLSGの倫理審査が終了次第、速やかに検体をいただき、メチル化解析と変異遺伝子解析を行う予定である。また臨床的にはWHO2016分類に対応し、これまで国内ではRAEBの前方視的疾患登録が行われてこなかったので、JPLSG AML委員会内にRAEBに関するworking groupを立ち上げ、次年度中に開始する予定である。合わせてこれまでの後方視的検討も行う予定である。
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| Causes of Carryover |
予定していた遺伝子解析の検体数に達しなかったため
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
倫理審査承認後、多数例での解析を実施予定
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] Five Cases of Pediatric-Onset Bechet’s disease complicated with Myelodysplastic Syndrome2017
Author(s)
Kanamitsu K, Shimada A, Nishiuchi R, Shigemura T, Nakazawa Y, Koike K, Kodama Y, Shinkoda Y, Kawano Y, Yasui K, Sasaki K, Kajiwara R, Tsukahara H, Manabe A.
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Journal Title
International Journal of Hematology
Volume: 105
Pages: 377-382
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Whole-exome sequencing reveals the spectrum of gene mutations and the clonal evolution patterns in paediatric acute myeloid leukaemia2016
Author(s)
Shiba N, Yoshida K, Shiraishi Y, Okuno Y, Yamato G, Hara Y, Nagata Y, Chiba K, Tanaka H, Terui K, Kato M, Park MJ, Ohki K, Shimada A, Takita J, Tomizawa D, Kudo K, Arakawa H, Adachi S, Taga T, Tawa A, Ito E, Horibe K, Sanada M, Miyano S, Ogawa S, Hayashi Y.
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Journal Title
Br J Haematol
Volume: 175
Pages: 476-489
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Relapsed AML patient with inv(16) harboring a low FLT3-ITD allelic burden and KIT mutations2016
Author(s)
Yamada A., Moritake H., Kinoshita M., Sawa D., Kamimura S., Iwamoto S., Yamashita Y., Inagaki J., Takahashi T., Shimada A., Obara M., Nunoi H.
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Journal Title
Pediatric Int.
Volume: 58
Pages: 905-908
DOI
Peer Reviewed
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