2016 Fiscal Year Research-status Report
統合失調症多発罹患家系エクソーム解析を起点とするリスク遺伝子確定と死後脳発現解析
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15K09802
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
布川 綾子 新潟大学, 医歯学総合研究科, 客員研究員 (90584607)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | エクソーム解析 / 統合失調症 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
我々のグループは、統合失調症の発症に大きな影響を与える稀な変異が存在する可能性が高いと考えられる多発罹患家系について連鎖解析を行うとともに、エクソーム解析に基づいてUNC13B遺伝子V1525M変異が疾患とほぼ共分離することを見出している。この研究成果を発展させ、１) 多発罹患家系の連鎖解析とエクソーム解析、２） 発端者・両親トリオのリスク遺伝子リシークエンス、３） 症例・対照サンプルの多段階関連解析という３つのアプローチの組み合わせによりリスク遺伝子を確定し、死後脳研究によりリスク遺伝子の脳内発現異常を明らかにすることが本研究の目的である。
平成２７年度は、まず多発罹患家系のパラメトリック解析を行い、陽性領域を絞り込んだ。そして、家系内の罹患者２人、非罹患者１人のエクソーム解析データを用いて、以下の４つの条件を満たす変異を選択した。１） 連鎖解析により絞り込まれた陽性領域内にある変異、２） 罹患者2人が共有し、非罹患者には存在しない変異、３） 機能的意義を有する可能性の高い変異（ナンセンス変異、フレームシフト変異、ミスセンス変異など）、４） アレル頻度が１％未満の稀な変異。この結果、６個の変異が選択された。
平成２８年度は、昨年度に選択された６個の候補リスク変異について、直接シークエンス法により、家系内のすべてのサンプルをタイピングした。しかし、疾患と共分離する変異は存在しなかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の計画通り、平成27～28年度で統合失調症多発罹患家系について連鎖解析およびエクソーム解析を行い、候補リスク変異をほぼ同定することができた。従って、概ね順調に進展していると考える。
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| Strategy for Future Research Activity |
6個の候補リスク変異の中、家系内で疾患と共分離するものはなかったが、リスク遺伝子内の異なる変異も統合失調症の発症に寄与するアレル異質性の可能性があるため、統合失調症発端者・両親110トリオについて、リスク遺伝子のタンパク質コード領域をリシークエンスし、リスク遺伝子内の稀な変異を網羅的に検索する。
同定されたリスク変異について、大規模症例・対照サンプルを用いた関連解析を実施する。これらの結果から統合失調症多発罹患大家系において同定されたリスク変異が特定の家系のみでなく、一般に統合失調症の発症リスクに大きな効果を有していることを確認する。
本研究で得られる成果を基盤として、統合失調症の発症機序を解明し、新規の診断・治療法を開発し臨床応用に結びつけることが最終的な目標である。
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| Causes of Carryover |
平成27年度のエクソーム解析により選択された6個の変異のうち、疾患との共分離が確認された変異が存在する遺伝子をリスク遺伝子として、大規模関連解析を行う予定であった。しかし、この方法ではリスク遺伝子を特定することができず、続く関連解析を行うことができなかった。このため、関連解析に用いる試薬類を購入する必要がなくなり、次年度使用額が生じることとなった。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
6個の候補リスク変異の中、家系内で疾患と共分離するものはなかったが、リスク遺伝子内の異なる変異も統合失調症の発症に寄与するアレル異質性の可能性があるため、統合失調症発端者・両親110トリオについて、リスク遺伝子のタンパク質コード領域をリシークエンスし、リスク遺伝子内の稀な変異を網羅的に検索する予定である。さらに、同定されたリスク変異について、大規模症例・対照サンプルを用いた関連解析を実施することを検討している。こうしたリシークエンスや関連解析に用いる試薬類に次年度使用額を充てる予定である。
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[Journal Article] Rare FBOX18 variations and risk of schizophrenia: whole-exome sequencing in two parent-affected offspring trios followed by resequencing and case-control studies.2017
Author(s)
Hoya S, Watabe Y, Hishimoto A, Nunokawa A, Inoue E, Igeta H, Otsuka I, Shibuya M, Egawa J, Sora I, Someya T
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Journal Title
Psychiatry and Clinical Neurosciences
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] High-resolution copy number variation analysis of schizophrenia in Japan.2017
Author(s)
Kushima I, Aleksic B, Nakatochi M, Shimamura T, Shiino T, Yoshimi A, Kimura H, Takasaki Y, Wang C, Xing J, Ishizuka K, Oya-Ito T, Nakamura Y, Arioka Y, maeda T, Yamamoto M, Yoshida M, Noma H, Hamada S, Morikawa M
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Journal Title
Molecular Psychiatry
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Rare UNC13B variations and risk of schizophrenia: whole-exome sequencing in a maltiplex family and follow-up resequencing and a case-control study.2016
Author(s)
Egawa J, Hoya S, Watanabe Y, Nunokawa A, Shibuya M, Ikeda M, Inoue E, Okada S, Kondo K, Saito T, Kaneko N, Muratake T, Igeta H, Iwata N, Someya T
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Journal Title
American Journal of Medical genetics. part B, neuropsychiatric genetics
Volume: 171(6)
Pages: 797-805
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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