放射線治療後再発した肺癌組織は、治療前と分子生物学的プロファイルがどう異なるか

2015 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 15K10017
• Research Institution: Foundation for Biomedical Research and Innovation
• Principal Investigator: 藤田 史郎 公益財団法人先端医療振興財団, その他部局等, その他 (60612140)
• Project Period (FY): 2015-04-01 – 2018-03-31
• Keywords: 非小細胞肺癌 / 放射線 / 分子標的薬 / 次世代シークエンサー

Outline of Annual Research Achievements

肺癌の大多数を占める非小細胞肺癌に関する研究である。非小細胞肺癌に対しては、完治を目的として定位放射線療法あるいは化学療法と併用した放射線療法が行われることがある。これら治療後に再発した場合、現状では、放射線療法前に採取した癌細胞の分子生物学的プロファイルを参考にした上で、分子標的薬を含む抗がん剤を用いることとなる。しかし、放射線療法により癌細胞のプロファイルが変化している可能性がある。
本研究では、当院にて定位放射線療法を施行しのちに再発をきたした症例群と、化学療法と放射線療法を併用した加療にて一旦奏効したのち、再発をきたした症例群の2群において、それぞれ解析する検体を選定し解析を行う。具体的には、治療前に採取した検体と治療後再発をきたした際採取した検体の二つについて腫瘍DNAやRNAの抽出、ならびに次世代シークエンサーを用いた解析を行う。合計16例を予定として、研究期間は3年を予定しており現在解析を進めている。
これまでに、対象患者さん4名の同意のもと、放射線治療前3検体、治療後3検体の次世代シークエンスを施行した。予想外に放射線治療前の検体のDNA断片化が進んでいることが判明し、シークエンス自体不調に終わった事例もあった。種々のDNA抽出法を試み、またPCRのサーマルサイクラーの機種を変更するなどしてより深くシークエンスできる条件を探っている。同時に、患者さんからの同意を得た上での検体収集も並行して行っている。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

放射線治療前の検体のDNA断片化が予想外に進んでおり、アッセイの方法の見直しを強いられていることが主な理由である。

Strategy for Future Research Activity

放射線治療前の断片化した検体からのDNAやRNAの抽出及び次世代シークエンサーを用いた解析がスムースに効率よく図れるように、アッセイの方法をより洗練したものとし、引き続き解析をすすめる。

Causes of Carryover

解析の途中で、放射線照射前の検体の幾つかのDNAが断片化していたため、さらなる検体解析を止めて現在アッセイ手法（特に次世代シークエンサーの解析の手前のライブラリー作成の際の手順）を見直し、極少量のホルマリン固定パラフィン包埋検体からの解析手法の確立を行っている。したがって、検体の解析を進めることが出来ず、検体の解析に必要な物品購入も予定額には達していない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

アッセイ手法が確立次第、検体解析に必要な物品を購入の上、検体の解析を進める予定。