2016 Fiscal Year Research-status Report
非遺伝性散発性乳癌の発症、悪性進展におけるTREX2複合体因子の機能解析
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15K10083
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
桑原 一彦 新潟大学, 医歯学系, 助教 (10263469)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | 乳癌発症機構 / 転写共役型ＤＮＡ傷害 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
平成２８年度は、１）乳癌発症におけるヒトｇａｎｐゲノムＳＮＰｓの関与（平成２７年度の解析の継続）、２）乳癌臨床検体におけるヒトｇａｎｐスプライシング異常、３）ＧＡＮＰ以外のＴＲＥＸ２複合体分子の乳癌発症や悪性進展への関与、に関して解析を行った。
１）に関して愛知県がんセンター研究所で保管されているデータの解析が進み、ヒトｇａｎｐ ＳＮＰｓは乳癌発症リスクと強く相関することが明らかになった。この相関は乳癌のフェノタイプとは関係なく、また様々な発症リスクとも相関がみられなかった。現在さらにさらに解析を進め、また乳癌患者予後との相関がみられないかも検討している。２）に関して約５０例のヒト乳癌臨床検体から抽出したｍＲＮＡを用いてシークエンス解析を行い、約２０％でスプライシング異常が起こっており、ほとんどがＨＡＴドメインに影響することを確認した。実際にｇａｎｐ遺伝子でＨＡＴドメインを欠失されたリコンビナントはＨＡＴ活性が消失することを確認した。３）に関してヒト乳癌臨床検体を用いた解析で、ＰＣＩＤ２もＤＳＳ１も高発現群が低発現群に比べて無再発生存期間が短縮することが明らかになった。また最近ＢＲＣＡ２とＴＲＥＸ２複合体との関連が報告されたが、ＢＲＣＡ２の発現レベルと無再発生存期間とは有意な相関がないことがわかった。現時点でＰＣＩＤ２とＤＳＳ１の発現が乳癌発症に影響を与えているというデータはなく、悪性進展にこれらの分子が関わる可能性が示されたため、今後化学療法感受性の観点からさらなる解析を行う。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
平成２８年度の研究項目としてあげた三点は多少の変更が加わったが当初の予定通りに遂行することができた。１）のヒトｇａｎｐ ＳＮＰｓは１３個のうち１０個は連鎖不平衡の関係にあったため、代表的な１個のＳＮＰで乳癌発症リスクとジェノタイプの関係を解析した。三種類のモデルでオッズ比を計算したところ、マイナーアレルを有する集団はメジャーアレルを有する集団に比べて乳癌の発症が約40%に低下することが示され、ｇａｎｐ ＳＮＰｓのマイナーアレルは乳癌発症リスクに対して抑制的に働くことが示唆された。予定よりも少し時間を要したが、ここまでは当初の計画通りに進行して成果をあげることができた。２）の解析は検体から抽出したＲＮＡの純度にかなり依存する実験だったため、ＰＣＲの条件検討に時間を要したが５０例の散発性乳癌の検体からのｍＲＮＡからｃＤＮＡを合成し、その全てをシークエンス解析することができた。予想通り、スプライシング異常をもつ検体ではＨＡＴ活性の機能不全が誘導されることがわかり、ヒト乳癌細胞株でみられたスプライシング異常がヒト臨床検体にもみられることを確認した。３）は当初予定した乳腺特異的ＰＣＩＤ２欠損マウスの樹立及び解析が自身の異動等が原因で遂行することが不可能になってしまった。これまでの結果を詳細に検討して方針を一部変更して研究を進めることにした。その結果、当初の予想とは異なる解析結果が出たが、これは哺乳細胞におけるＴＲＥＸ複合体の機能を考える上で今後大きな展開がみられると考えられる。
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| Strategy for Future Research Activity |
１）のｇａｎｐ ＳＮＰｓの解析では、平成２８年度にマイナーアレルの発症リスクにおける重要性が明らかとなったなったが、これまでのＧＡＮＰのヒト乳癌検体を用いた解析から、ＧＡＮＰ低発現群では高発現群に比べて患者の予後が悪いことがわかっている。そこで、ｇａｎｐ ＳＮＰｓと患者予後にも相関がみられないかを愛知県がんセンターのデーターベースには10年間の患者予後の追跡結果が登録されており、そこからデータを抽出して統計学的に解析する。２）はほぼ解析を終えたが、得られた結果を機能面からどのように考えるかという問題がある。そこでヒト乳癌細胞株を用いてＧＡＮＰのＨＡＴドメインを欠失した細胞株をゲノム編集技術によって作成し、乳癌細胞における意義を解析する。３）はＰＣＩＤ２とＤＳＳ１の化学療法感受性に関わる機能の類似性からＴＲＥＸ２複合体の機能がこれに関わることが考えられるが、過去の報告からＴＲＥＸ２複合体機能不全はＲ－ループの形成が重要であると考えられている。Ｒ－ループはＤＮＡ傷害を受けやすいことが知られており、化学療法の感受性に影響を与えることは十分に考えられ、今後この点を中心に解析を進める。ＧＡＮＰ、ＰＣＩＤ２、ＤＳＳ１個々の分子が乳癌発症、悪性進展においてどのような役割を果たすのか、複合体としてはどのような機能を示すのかを明確にする。
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| Causes of Carryover |
本研究で得られた研究成果をＡＡＣＲ ＡＮＮＵＡＬ ＭＥＥＴＩＮＧ ２０１７（平成２９年４月１日から６日まで、米国・ワシントンＤ．Ｃ．）で発表するための旅費に使用するため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
平成２９年度研究費で参加する場合、最終年度の研究費に余裕がないため研究遂行に支障がでる恐れがある。平成２９年度最初の学会のため、次年度使用とはいえほとんど繰り越さないのと同じ状況である。
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[Journal Article] GANP protein encoded on human chromosome 21/mouse chromosome 10 is associated with resistance to mammary tumor development.2016
Author(s)
K. Kuwahara, M. Yamamoto-Ibusuki, Z. Zhang, S. Phimsen, N. Gondo, H. Yamashita, T. Takeo, N. Nakagata, D. Yamashita, Y. Fukushima, Y. Yamamoto, H. Iwata, H. Saya, E. Kondo, K. Matsuo, M. Takeya, H. Iwase & N. Sakaguchi
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Journal Title
Cancer Science
Volume: 107
Pages: 469-477
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] SARS-corona virus epitopes appeared immunodominant in human elicited both enhancing and preventive effects on infection in non-human primates.2016
Author(s)
Q. Wang, L. Zhang, K. Kuwahara, L. Li, Z. Liu, T. Li, H. Zhu, J. Liu, Y. Xu, J. Xie, H. Morioka, N. Sakaguchi, C. Qin & G. Liu
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Journal Title
ACS Infectious Diseases
Volume: 2
Pages: 361-376
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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