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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Comprehensive diagnosis of bacterial infection associated with acute cholecystitis using metagenomic approach

Research Project

Project/Area Number 15K10198
Research InstitutionToho University

Principal Investigator

浅井 浩司  東邦大学, 医学部, 講師 (20366454)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 草地 信也  東邦大学, 医学部, 教授 (70169978)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords急性胆道炎 / メタゲノム解析 / 抗菌薬感受性検査 / 多剤耐性菌 / 急性胆管炎 / 急性胆嚢炎
Outline of Annual Research Achievements

急性胆道炎は適切な抗菌薬治療が行われないと致死的となり得る急性感染症である.また,世界的にも抗菌薬耐性菌の蔓延は問題となっており,今後は経験的抗菌薬療法における抗菌薬の選択が困難となる可能性がある.われわれは胆汁細菌におけるメタゲノム解析を行い病原体同定に関する研究を立案し,平成27~29年度に研究を行った.
過去3年間で50例以上の急性胆道炎症例におけるメタゲノム解析を施行した.いずれの症例も研究計画書通りに診断し,重症度を評価した後にインフォームドコンセントを行い,検体を取得した.全症例とも胆汁検体の他に唾液,便のサンプルも集積し解析を行った.
いずれの検体も24時間で起因菌の同定が網羅的に検出可能であった.また,耐性菌の遺伝子型を含めた耐性状況はさらに24時間(合計48時間)で検出可能であった.通常,細菌培養検査から抗菌薬感受性結果を得るのに5日程度必要であった検査過程を48時間に短縮することが可能であった.この検査手法は将来的に抗菌薬治療を画期的に変革するような基礎研究であると考えられた.
本年度は最初の6例に関するまとめが掲載された(Kujiraoka M, Front Microbiol).その後に50例以上の症例集積の結果を解析し,学会発表を複数行った.現在,その結果に関する論文を作成中であり,近日中に投稿予定である.50例以上の解析結果では,細菌同定に関しては100%一致可能であった.また,興味深い点として,今回の解析では5%程度にESBL(extended spectrum β-lactamase)産生菌がキャリアーとして存在していた.ESBLは通常用いられるβラクタム系抗菌薬には効果がないので,国内のESBLキャリアーの状態を把握するうえでも重要な研究であったと考えた.本研究結果をもとに,今後はより簡便な細菌同定システムの開発を行っていく予定である.

  • Research Products

    (11 results)

All 2017

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Comprehensive Diagnosis of Bacterial Infection Associated with Acute Cholecystitis Using Metagenomic Approach2017

    • Author(s)
      Kujiraoka M, Kuroda M, Asai K, Sekizuka T, Kato K, Watanabe M, Matsukiyo H, Saito T, Ishii T, Katada N, Saida Y, Kusachi S
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.3389/fmicb.2017.00685.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluating the timing of laparoscopic cholecystectomy for acute cholecystitis in an experienced center based on propensity score matching2017

    • Author(s)
      Asai K, Watanabe M, Kusachi S, Matsukiyo H, Saito T, Ishii T, Kujiraoka M, Katagiri M, Katada N, Saida Y
    • Journal Title

      Asian Journal of Endoscopic Surgery

      Volume: 10 Pages: 166-172

    • DOI

      doi: 10.1111/ases.12353.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 単孔式腹腔鏡下手術用デバイスを応用した急性胆嚢炎に対する腹腔鏡下胆嚢摘出術における手術指導の工夫2017

    • Author(s)
      浅井浩司,渡邉 学,松清 大,齋藤智明,鯨岡 学,草地信也
    • Journal Title

      日本内視鏡外科学会雑誌

      Volume: 22 Pages: 827-832

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 単剤 or 併用?ESBL産生菌感染症の診断・治療の実際.術後感染症-消化器外科領域を中心に2017

    • Author(s)
      渡邉 学,草地信也,浅井浩司
    • Journal Title

      感染と抗菌薬

      Volume: 20 Pages: 134-138

  • [Presentation] Timing of laparoscopic cholecystectomy in an experienced center for acute cholecystitis using propensity score matching2017

    • Author(s)
      Asai K, Watanabe M, Matsukiyo H, Saito T, Kusachi S
    • Organizer
      Joint Congress of the 6th biennial Congress of the Asian-Pacific Hepato-Pancreato-Biliary Association and the 29th Meeting of Japanese Society of Hepato-Biliary-Pancreatic Surgery
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 急性胆嚢炎に対する腹腔鏡下胆嚢摘出術における術者別の治療成績と最近の工夫2017

    • Author(s)
      浅井浩司,渡邉 学,松清 大,齋藤智明,石井智貴,榎本俊行,中村陽一,片田夏也,斉田芳久,草地信也
    • Organizer
      第53回日本腹部救急医学会総会
  • [Presentation] 急性胆嚢炎の胆汁細菌からみた抗菌薬適正使用に関する検討2017

    • Author(s)
      浅井浩司,草地信也,渡邉 学,齋藤智明,鯨岡 学
    • Organizer
      第65回日本化学療法学会学術集会
  • [Presentation] 急性胆嚢炎に対する腹腔鏡下胆嚢摘出術-術者間別の治療成績の検討と最近の手技の工夫2017

    • Author(s)
      浅井浩司,渡邉 学,松清 大,齋藤智明,石井智貴,榎本俊行,桐林孝治,岡本 康,片田夏也,斉田芳久,草地信也
    • Organizer
      第117回日本外科学会定期学術集会
  • [Presentation] 次世代シークエンサーを用いた急性胆嚢炎の起因菌迅速同定および病態解析2017

    • Author(s)
      浅井浩司,黒田 誠,鯨岡 学,渡邉 学,松清 大,齋藤智明,榎本俊行,片田夏也,斉田芳久,草地信也
    • Organizer
      第72回日本消化器外科学会総会
  • [Presentation] 急性胆道炎における新しい胆汁細菌同定方法-メタゲノム解析による次世代網羅的病原体検出―2017

    • Author(s)
      浅井浩司,黒田 誠,鯨岡 学,渡邉 学,松清 大,齋藤智明,草地信也
    • Organizer
      第53回日本胆道学会学術集会
  • [Presentation] 単孔式腹腔鏡下手術用デバイスを応用した急性胆嚢炎に対する腹腔鏡下胆嚢摘出術における手術指導の工夫2017

    • Author(s)
      浅井浩司,渡邉 学,松清 大,鯨岡 学
    • Organizer
      第15回日本消化器外科学会大会

URL: 

Published: 2018-12-17  

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