Identification of a new driver oncogene mutation based on comparison of the smoking amount in lung squamous cell carcinoma

2017 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 15K10263
• Research Institution: Oita University
• Principal Investigator: 岡本 龍郎 大分大学, 医学部, 准教授 (80568626)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 諸富 洋介 九州大学, 医学研究院, 助教 (60645365) [Withdrawn] ; 田川 哲三 九州大学, 大学病院, その他 (90419557) ; 杉尾 賢二 大分大学, 医学部, 教授 (70235927) ; 小副川 敦 大分大学, 医学部, 助教 (90432939)
• Project Period (FY): 2015-04-01 – 2018-03-31
• Keywords: 肺扁平上皮癌 / 次世代シーケンス / 喫煙量 / 遺伝子変異 / 非小細胞肺癌 / 扁平上皮癌

Outline of Annual Research Achievements

扁平上皮癌が多くの遺伝子異常を持つことは喫煙の影響が大きいと考えられている。当科の肺扁平上皮癌切除例364例の検討では非/軽喫煙者(30Pack Year以下)を71例(19.5%)認め、非/軽喫煙者は重喫煙者(>30PY)に比べ有意に予後が悪かった。非・軽度喫煙患者と重度喫煙患者の扁平上皮癌は異なる性質・遺伝子変化を持つ可能性があり、その遺伝子異常を指標に治療標的候補の検索が可能と考えられた。現在、非/軽度喫煙者及び重度喫煙者における肺扁平上皮癌の遺伝子変化を比較検討し、治療対象となる標的分子を次世代シーケンサーを用いて探索することを目的に研究を進めている。
まず肺扁平上皮癌症例で使用可能な検体88例に対して、2100バイオアナライザ- RNA ソリューションを用い、RNAのクオリティー検査を行いRNAシークエンス施行可能な検体数を調べた。非/軽喫煙者では癌部8例、正常部10例、重喫煙者では癌部33例、正常部36例であった。
次いでTruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kitを用いて、RNAをシークエンス可能な状態にするライブラリーの作成を施行した。ここまで54サンプル中、24サンプルのライブラリー作成を完了した。続いて手技の確認と解析の検討を兼ねて、12サンプル(非/軽喫煙者:3例の6検体, 重喫煙者3例6検体)でまずRNAシークエンスを施行した。その結果、TCGAのデータベースと併せて解析を行ったところ、非/軽喫煙者の癌部で重喫煙者に比して有意に発現量が増加する遺伝子53種類を同定した。このうち、TCGAのデータベース上で予後不良と関連する遺伝子は3種類であった。

Research Products

• [Journal Article] Clinical and Genetic Implications of Mutation Burden in Squamous Cell Carcinoma of the Lung (2018)
  • Author(s): Okamoto T, Takada K, Sato S, Toyokawa G, Togawa T, Shoji F, Nakanishi R, Oki E, Koike T, Nagahashi M, Ichikawa H, Shimada Y, Watanabe S, Kikuchi T, Akazawa K, Lyle S, Okuda S, Sugio K, Wakai T, Tsuchida M, Maehara Y
  • Journal Title: Ann Surg Oncol Volume: - Pages: -
  • DOI: 10.1245/s10434-018-6401-1
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Clinical Impact and Risk Factors for Skeletal Muscle Loss After Complete Resection of Early Non-small Cell Lung Cancer (2018)
  • Author(s): Takamori Shinkichi、Toyokawa Gouji、Okamoto Tatsuro、Shimokawa Mototsugu、Kinoshita Fumihiko、Kozuma Yuka、Matsubara Taichi、Haratake Naoki、Akamine Takaki、Takada Kazuki、Katsura Masakazu、Hirai Fumihiko、Shoji Fumihiro、Tagawa Tetsuzo、Oda Yoshinao、Honda Hiroshi、Maehara Yoshihiko
  • Journal Title: Ann Surg Oncol Volume: 25 Pages: 1229-1236
  • DOI: 10.1245/s10434-017-6328-y
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Programmed Death-Ligand 1 Expression and EGFR Mutations in Multifocal Lung Cancer (2018)
  • Author(s): Haratake Naoki、Toyokawa Gouji、Takada Kazuki、Kozuma Yuka、Matsubara Taichi、Takamori Shinkichi、Akamine Takaki、Katsura Masakazu、Shoji Fumihiro、Okamoto Tatsuro、Oda Yoshinao、Maehara Yoshihiko
  • Journal Title: Ann Thorac Surg Volume: 105 Pages: 448～454
  • DOI: 10.1016/j.athoracsur.2017.09.025
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] 喫煙量が肺扁平上皮癌の腫瘍生物学に及ぼす影響 (2017)
  • Author(s): 岡本 龍郎、高田 和樹、佐藤 征二郎、松原 太一、上妻 由佳、原武 直紀、高森 信吉、赤嶺 貴紀、桂 正和、豊川 剛二、庄司 文裕、土田 正則、前原 喜彦
  • Organizer: 第117回日本外科学会定期学術集会
• [Presentation] 肺扁平上皮癌に認められる遺伝子異常と遺伝子変異量の臨床的特徴 (2017)
  • Author(s): 岡本 龍郎、高田 和樹、庄司 文裕、豊川 剛二、沖 英次、永橋 昌幸、杉尾 賢二、若井 俊文、前原 喜彦
  • Organizer: 第76回日本癌学会学術集会