• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2018 Fiscal Year Annual Research Report

Study on bupivacaine enantiomer binding site of KcsA channel and its open-close modification

Research Project

Project/Area Number 15K10511
Research InstitutionShiga University of Medical Science

Principal Investigator

瀬戸 倫義  滋賀医科大学, 医学部, 講師 (10335177)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 加藤 稔  立命館大学, 生命科学部, 教授 (00241258)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2019-03-31
Keywordsbupivacaine / enantiomer / KcsA(E71A) / single channel analysis / conductance / mean open time
Outline of Annual Research Achievements

平面膜法によりKcsA(E71A) 再構成膜の1分子開閉K電流を記録した。単チャネル解析により、コンダクタンス、平均開確率を求めた。ブピバカインを加え、振幅解析、開閉遷移解析を行った。ブピバカインは濃度依存性にコンダクタンスを漸減し、更に平均開時間を減少させた。平均閉時間は一定値にとどまり濃度依存性しなかった。ブピバカイン結合によって開状態が短く、すなわち開状態の不安定化を起こすことでチャネル抑制が起こっていることをつきとめた。
KcsAにおける(R), (S)-ブピバカインの結合部位、結合様式をASEDockで計算した。開状態ブピバカインはイオン伝導路に結合することが判明した。結合は、伝導路の閉塞をもたらすことから、コンダクタンスの漸減と矛盾がない。また、伝導路の閉塞は平均開時間の減少と矛盾がない。結合はブピバカイン不斉炭素に結合するHがVal106に配位し、対掌体を識別していることが判明した。
開閉動態には3つのモード(High Po, Low Po, flicker)の存在知られ、解析には単一モードにおける解析が必要である。再構成膜の薄膜化速度を遅くし、解析に十分な開閉事象を得ることができる。薄膜化にともない開閉モードの遷移とは別に多チャンネル開閉と推定される電流が観測された。単チャネル計測になるように、チャネル濃度を薄くしても高頻度で再現した。KcsA-KcsAの会合によって多チャネル化するのではないかと考え、平面膜内のKcsA会合を調べるために、KcsA-KcsAのタンパク-タンパクドッキングを行った。KcsAは会合して2量体をつくると-84 kcal mol-1安定することが判った。再構成膜のKcsAは多量化し、単チャネル単モードの計測を困難にしているのではないかと示唆された。
ブピバカインの副作用-心毒性・循環虚脱は心筋カリウムチャネルの抑制が関与する。中毒域におけるチャネル開閉動態の抑制メカニズムを開閉動態から解明した。

  • Research Products

    (7 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Identification of Verapamil Binding Sites Within Human Kv1.5 Channel Using Mutagenesis and Docking Simulation2019

    • Author(s)
      Ding W-G, Tano A, Mi X, Kojima A, Seto T, Matsuura H
    • Journal Title

      Cellular Physiology and Biochemistry

      Volume: 52 Pages: 302~314

    • DOI

      10.33594/000000022

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Molecular Discrimination of Barbital Enantiomer at Propofol Binding Site of Human b3 Homomeric GABAA Receptor2018

    • Author(s)
      Seto Tomoyoshi、Kato Minoru、Koyano Ken
    • Journal Title

      Chem-Bio Informatics Journal

      Volume: 18 Pages: 154~163

    • DOI

      10.1273/cbij.18.154

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Interactions of Propofol With Human Voltage-gated Kv1.5 Channel Determined by Docking Simulation and Mutagenesis Analyses2018

    • Author(s)
      Kojima Akiko、Fukushima Yutaka、Ito Yuki、Ding Wei-Guang、Ueda Rika、Seto Tomoyoshi、Kitagawa Hirotoshi、Matsuura Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Cardiovascular Pharmacology

      Volume: 71 Pages: 10~18

    • DOI

      10.1097/FJC.0000000000000538

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] QT延長症候群患者における安全な麻酔薬選択の指標2019

    • Author(s)
      瀬戸倫義
    • Organizer
      日本麻酔科学会 第66回学術集会
  • [Presentation] リアノジン1受容体における揮発性麻酔薬結合部位とCICR活性化メカニズムの解明2018

    • Author(s)
      瀬戸倫義
    • Organizer
      日本麻酔科学会 第65回学術集会
  • [Presentation] デスフルランは膜電位依存性ヒト Kv1.5( hKv1.5)チャネルを構成するアミノ酸に直接作用して抑制作用を発揮する2018

    • Author(s)
      福島豊、小嶋亜希子、石原真理子、清水盛浩、瀬戸倫義、北川裕利
    • Organizer
      日本麻酔科学会 第65回学術集会
  • [Remarks] 滋賀医科大学 最新研究の紹介

    • URL

      https://www.shiga-med.ac.jp/research-and-collaboration/priority-projects-and-research-results/latest-research-papers#20190403

URL: 

Published: 2019-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi