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2016 Fiscal Year Research-status Report

根尖性歯周組織炎・口腔底蜂窩織炎病巣細菌の網羅的解析による病態-菌種間関係の解明

Research Project

Project/Area Number 15K11023
Research InstitutionTokyo Dental College

Principal Investigator

石原 和幸  東京歯科大学, 歯学部, 教授 (00212910)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 村松 敬  東京歯科大学, 歯学部, 教授 (00276982)
菊池 有一郎  東京歯科大学, 歯学部, 助教 (30410418)
柴山 和子  東京歯科大学, 歯学部, 講師 (60408317)
国分 栄仁  東京歯科大学, 歯学部, 講師 (70453785)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords根尖性歯周炎 / 細菌叢 / 16S rRNA pyrosequencing / 口腔底蜂窩織炎 / 歯根嚢胞
Outline of Annual Research Achievements

根尖性歯周炎は、病巣が骨内に存在しアクセスが困難であるため、難治性の場合抜歯も選択肢となる。本疾患の病巣からは多数の菌種が分離されるが、その病態と菌種の関わりは未だ明らかにされていない。本研究では、本疾患の病態と菌種との関わりの解析を行うことにより、本疾患の診断および病巣の状態に基づいた治療方針の確立に必要な細菌学的エビデンスを確立することを目的とした。
慢性化膿性根尖性歯周炎患者根尖部よりサンプルを採取した。サンプルを得た病巣の病態としては、サンプル採取時に出血を認めたものと排膿を認めた2つのグループから行った。得られたサンプルからDNAを抽出し、PCRにより16S rRNAの V3-V4 領域を含む460bpを増幅した。得られたfragmentをMiSeq (Illumina) を用いて 16S rRNA pyrosequencing を行い、16SrRNAデータベースとの相同性検索を行い病巣部の菌叢を解析した。
16S rRNA pyrosequencingの結果、サンプルから検出されたoperational taxonomic unit (OTU) 数としては、出血性のサンプルからは、97 OTUsであった。検出されたもののうち、Fusobacterium, Prevotella, Dialisterが主要な属であった。。排膿の認められたサンプルからは、127 OTUsが検出され、主要な属としてはPrevotella, Fusobacterium等の出血の認められた群と共通なものに加え、Porphyromonas, Tannerella, Enterococcus, Lactobacillus, Streptococcus等の異なった属が認められていた。
これらの結果から、根尖性歯周炎の病態により病巣部菌叢を構成する菌種が異なっていることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

サンプル採取からデータ解析まで当初予定しているサンプル数について終了している、

Strategy for Future Research Activity

データを増やすと共に、さらに異なった病態についてもサンプル採取を試みる。

  • Research Products

    (11 results)

All 2017 2016

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] SigCH, an extracytoplasmic function sigma factor of Porphyromonas gingivalis regulates the expression of cdhR and hmuYR2017

    • Author(s)
      Ota K, Kikuchi, Y, Imamura K, Kita D, Yoshikawa K, Saito A, Ishihara K.
    • Journal Title

      Anaerobe

      Volume: 43 Pages: 82-90

    • DOI

      10.1016/j.anaerobe.2016.12.006

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] New approach for studying mobile genes using metagenomic analysis2017

    • Author(s)
      Ishihara K.
    • Journal Title

      Oral Dis

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1111/odi.12640

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of a potential ABC-type bacteriocin exporter protein from Treponema denticola2016

    • Author(s)
      Tanaka-Kumazawa K, Kikuchi Y, Sano-Kokubun Y, Shintani S, Yakushiji M, Kuramitsu H K, Ishihara K.
    • Journal Title

      BMC Oral Health

      Volume: 17 Pages: 18

    • DOI

      10.1186/s12903-016-0243-7

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Treponema denticola invasion into human gingival epithelial cell2016

    • Author(s)
      Inagaki S, Kimizuka R, Kokubu E, Saito A, Ishihara K.
    • Journal Title

      Microb Pathog

      Volume: 94 Pages: 104-111

    • DOI

      10.1016/j.micpath.2016.01.010

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Antimicrobial susceptibility of microorganisms isolated from periapical periodontitis lesions2016

    • Author(s)
      Narita M, Shibahara T, Takano N, Fujii R, Okuda K, Ishihara K.
    • Journal Title

      Bull Tokyo Dent Coll

      Volume: 52 Pages: 133-142

    • DOI

      10.2209/tdcpublication.2015-0018

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Functional analysis of marR-like gene of Treponema denticola2017

    • Author(s)
      Numata Y, Okamoto-Shibayama K, Sato T, Kikuchi Y, Kokubu E, Ishihara K
    • Organizer
      IADR/AADR/CADR 95th General Session
    • Place of Presentation
      San Francisco
    • Year and Date
      2017-03-22 – 2017-03-25
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Isolation and characterization of dentipain in Treponema denticola2017

    • Author(s)
      Miyai-Murai Y, Okamoto-Shibayama K, Sato T, Numata Y, Ishihara K
    • Organizer
      IADR/AADR/CADR 95th General Session
    • Place of Presentation
      San Francisco
    • Year and Date
      2017-03-22 – 2017-03-25
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Treponema denticola の細胞侵入に影響する病原因子 の解析2017

    • Author(s)
      国分 栄仁, 菊池 有一郎, 柴山 和子, 石原 和幸
    • Organizer
      第90回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2017-03-19 – 2017-03-21
  • [Presentation] Porphyromonas gingivalis の鉄獲得機構における ECFシグマ因子 PGN_0319 の役割2017

    • Author(s)
      菊池 有一郎, 太田 功貴, 柴山 和子, 国分 栄仁, 齋藤 淳, 石原 和 幸
    • Organizer
      第90回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2017-03-19 – 2017-03-21
  • [Presentation] Porphyromonas gingivalis ECFシグマ因子変異株における菌体表層性状の解析2016

    • Author(s)
      菊池有一郎, 国分栄仁, 柴山和子, 大原直也, 中山浩次, 石原和幸
    • Organizer
      第58回歯科基礎医学会学術大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-08-24 – 2016-08-26
  • [Presentation] Treponema denticola marR 様遺伝子の機能解析2016

    • Author(s)
      沼田由美, 柴山和子, 佐藤亨, 菊池有一郎, 国分栄仁, 石原和幸
    • Organizer
      第58回歯科基礎医学会学術大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-08-24 – 2016-08-26

URL: 

Published: 2018-01-16  

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