2017 Fiscal Year Annual Research Report
Application of modificomic technologies to discover and identify biomarkers for periodontal diseases
| Project/Area Number |
15K11379
|
|---|
| Research Institution | Chiba University |
|---|
Principal Investigator |
土田 祥央 千葉大学, 医学部附属病院, 特任助教 (90410422)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐藤 守 千葉大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (20401002)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
|
| Keywords | 歯学 / 歯周病学 / プロテオミクス / モディフィコミクス / 質量分析計 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
プロテオーム解析技術の発展により、歯周疾患のバイオマーカーの開発が盛んに行われている。発現プロテオーム解析を駆使して歯周 疾患のバイオマーカー探索を続けてきた。しかし、大部分のタンパク質が何らかの翻訳後修飾を受けて初めてその本来の機能を獲得することを考慮すると、従来の発現プロテオミクスに頼る手法では限界がある。従ってタンパク質の翻訳後修飾にも注目する必要があった。
本研究ではモディフィコミクス（翻訳後修飾を特異的に検出する技術）を発展させ、歯周疾患に起こりうる代表的な翻訳後修飾であ る糖鎖修飾および最も広く研究されているリン酸化とユビキチン化にも焦点をあてて、歯周疾患における翻訳後修飾を網羅的探索により捉え、歯周疾患 の早期診断および再発予測治療効果判定等に応用することを目的とした。歯周疾患マーカー候補Ｎ型糖タンパク質・ペプチドのバリディーションおよび歯周疾患特異的リン酸化ペプチドアレイの作 製と多検体でのバリディーションを行った。免疫沈降とSDS-PAGE によりGCF中のユビキチン化タンパクのバンドを多数検出し、最終年度では質量分析技術とウエスタンブロットによりユビキチン化タンパク質をGCF中から検出した。従って、これまで網羅的な探索が行われてこなかった歯周疾患のユビキチン化を最新の質量分析技術により検出し、診断マーカーの可能性を追及することが可能となった。しかし、 歯周疾患特異的リン酸化ペプチドでのアレイ作製まで至らなかったため、実現化に向けて今後も検討を重ねる。
|
-
-
-
[Journal Article] Assessment by Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry of the Effects of Preanalytical Variables on Serum Peptidome Profiles Following Long-Term Sample Storage.2018
Author(s)
Tsuchida S, Satoh M, Umemura H, Sogawa K, Takiwaki M, Ishige T, Miyabayashi Y, Iwasawa Y, Kobayashi S, Beppu M, Nishimura M, Kodera Y, Matsushita K, Nomura F
-
Journal Title
Proteomics Clin Appl
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
-
-
-
[Presentation] 37mmクオリティモニターを用いたMALDI-TOF MSによる血液培養ボトルからの迅速細菌同定の検討2017
Author(s)
土田 祥央, 宮部 安規子, 村田 正太, 齊藤 知子, 瀬川 俊介, 佐海 知子, 上原 麻美, 中村 恵海, 渡邊 正治, 曽川 一幸, 滝脇 正貴, 西村 基, 佐藤 守, 松下 一之, 野村 文夫
Organizer
第42回日本医用マススペクトル学会
-
-
