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2016 Fiscal Year Research-status Report

2次元円形プール内における細菌集団運動

Research Project

Project/Area Number 15K13537
Research InstitutionChuo University

Principal Investigator

脇田 順一  中央大学, 理工学部, 教授 (30611404)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords集団運動
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、寒天平板上に作成した円形プール内における枯草菌の集団運動を、統計物理学的な立場から理解することを目的としている。初年度は、“換算菌体長λ(菌体長とプールの直径の比で定義される)”と“菌密度ρ”をパラメータとすることにより、集団運動が6種類のパターンに分類されること、λの値に集団運動の急激な質的変化を引き起こす2つの閾値λ_C1、λ_C2(ただし、λ_C1<λ_C2)が存在することを確認している。すなわち、λ<λ_C1のときは個々の菌の運動の方向は比較的ランダムであるのに対して、λ_C1<λ<λ_C2のときはプール壁に沿った方向の回転運動、λ>λ_C2のときは振動的であることを確認している。次年度である平成28年度は、λ_C1近傍のρが高い条件に着目し、λ<λ_C1でみられる“turbulent motion”から“λ>λ_C1”でみられる“two-way rotational motion”への急激な遷移を詳しく観察、解析した。具体的には、まず画像解析によりプール内におけるバクテリアの速度場を求めてから、各場所でバクテリアの速度ベクトルとその場所を通る円(プールと同心円)の接線ベクトルとの内積を計算した。この量を秩序パラメータQとして定義し、λをパラメータとしてQの値がどのように振る舞うかを調べた。その結果、ほぼλ_C1=0.9のときにQの値が0から急激に立ち上がる様子が確認された。これは統計物理学の立場からは相転移を示唆する興味深い結果であると判断している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

次年度の進捗状況に関しては、おおむね計画通りに進展したと考えている。研究結果は、2016年7月に開催されたSTATPHYS 26、および2017年3月に開催された日本物理学会第72回年次大会にて発表した。

Strategy for Future Research Activity

最終年度は、λ_C1近傍のρが低い条件にも着目する予定である。すなわち、λ<λ_C1でみられる“random motion”から“λ>λ_C1”でみられる“one-way rotational motion”への急激な遷移を詳しく調べる予定である。さらに、菌単体と壁との相互作用と菌同士の相互作用についても調べる予定である。そして、λ_C1近傍でみられる集団運動の急激な変化を再現するモデルを提案したいと考えている。

Causes of Carryover

初年度購入予定の顕微鏡用培養装置に新機種発売と価格変更があったため、購入を見送った経緯がある。実験の遂行に関しては他の研究用に使用していた培養装置を代用することで対応し、その代わりに光学顕微鏡による観察をPCにタイムラプス記録するためのモジュールを購入した。その結果として、次年度使用額が生じてしまった。

Expenditure Plan for Carryover Budget

最初に購入を考えていた顕微鏡観察を記録するためのデジタルカメラの購入を予定している。

  • Research Products

    (3 results)

All 2017 2016 Other

All Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Presentation] 円形プール内で集団運動するバクテリアの速度場解析2017

    • Author(s)
      原田翔平,本田良二郎,山本健,脇田順一
    • Organizer
      日本物理学会 第72回年次大会
  • [Presentation] Phase Diagram of Collective Motion of Bacterial Cells2016

    • Author(s)
      Jun-ichi Wakita, Ken Yamamoto, Ryojiro Honda, Makoto Katori
    • Organizer
      STATPHYS 26
    • Place of Presentation
      Centre de Congrès de Lyon, France
    • Year and Date
      2016-07-18 – 2016-07-22
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 中央大学理工学部 物理学科 パターン形成物理学研究室

    • URL

      http://www.phys.chuo-u.ac.jp/labs/wakita/

URL: 

Published: 2018-01-16  

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