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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Quantitative analysis of the ability of ice recrystallization inhibition of antifreeze protein

Research Project

Project/Area Number 15K13760
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

津田 栄  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 上級主任研究員 (70211381)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Keywords不凍 / タンパク質 / 氷 / 再結晶化 / 氷結晶結合 / 結晶成長 / 分子構造
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、不凍タンパク質(AFP)が有する「氷の再結晶化を阻害する機能(Ice Recrystallization Inhibition, IRI)」を定量的に解析する方法を検討し、優れたIRI機能をもつAFPを解明して製品化に至るまでの進捗を得た。前年度の研究により氷核サイズの経時変化がOstward Ripening則(r3=r3(0)+Kt)で近似できること、再結晶化速度(K)を用いてAFPのIRI機能が定量できることが示された為、本年度ではこの手法に更なる改良と高速化を施すことを検討した。すなわち、前述の式を時間(t)で微分するとr3/dt=Kと単純化されることに注目し、これまでの様に一定時間毎に撮影した視野の異なる氷のスナップショットから200~300個以上の氷核のサイズ(平均値)を見積もるのではなく、視野を変えずに連続撮影した氷画像のムービーから複数個の氷核の成長速度を見積もることによって、より速く正確にKが求まること見出した。更に、この新たな定量的解析法を用いて様々なAFP試料のIRI機能を解析し、そのアミノ酸・遺伝子配列、不凍活性(熱ヒステリシス活性)、溶解度、耐熱性、耐酸・アルカリ性、分子構造との関係を調べた。その結果、魚類由来の小分子量AFP(40アミノ酸残基、分子量3.3kDa)であるBpAFPが、優れたIRI活性を発揮することが明らかになった。そこで蛍光ラベル法や超遠心などの技術を用いてBpAFPの機能が優れている理由を調べたところ、BpAFPは濃度に応じて分子が互いに連結して氷核への結合範囲を拡大して行く新しいタイプのAFPであることが判明した。この研究成果は英科学誌サイエンティフィック・リポーツにオンライン掲載されたほか、研究機関の主な研究成果としてリリースされた。論文数9、学会発表数41(うち招待講演5)。

  • Research Products

    (35 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (25 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Concentration-dependent oligomerization of an alpha-helical antifreeze polypeptide makes it hyperactive2017

    • Author(s)
      Sheikh Mahatabuddin, Yuichi Hanada, Yoshiyuki Nishimiya, Ai Miura, Hidemasa Kondo, Peter L. Davies, & Sakae Tsuda
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: srep42501

    • DOI

      10.1038/srep42501

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Hydrophobic ice-binding sites confer hyperactivity of an antifreeze protein from a snow mold fungus2016

    • Author(s)
      Jing Cheng, Yuichi Hanada, Ai Miura, Sakae Tsuda, Hidemasa Kondo
    • Journal Title

      Biochemical Journal

      Volume: 473 Pages: 4011-4026

    • DOI

      10.1042/BCJ20160543

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Critical Ice Shaping Concentration (CISC): A New Parameter to Evaluate the Activity of Antifreeze Proteins2016

    • Author(s)
      Sheikh Mahatabuddin, Yoshiyuki Nishimiya, Ai Miura, Hidemasa Kondo, and Sakae Tsuda
    • Journal Title

      Cryobiology and Cryotechnology

      Volume: 62 Pages: 95-103

    • DOI

      ISSN 1340-7902

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 不凍タンパク質の構造と機能ー高品質魚類不凍タンパク質がもたらす冷熱技術イノベーションー2016

    • Author(s)
      津田 栄
    • Journal Title

      化学と工業

      Volume: 69 Pages: 646-648

    • DOI

      ISSN 0022-7684

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mass preparation of fish antifreeze protein2016

    • Author(s)
      Sakae Tsuda
    • Journal Title

      Journal of Bioprocess and Biotechnique

      Volume: 6 Pages: 30

    • DOI

      ISSN 2155-9821

    • Open Access
  • [Journal Article] Chemical synthesis of homogeneous antifreeze glycoprotein having uniform GalNAc modification and its antifreeze activity2016

    • Author(s)
      Ryo Okamoto, Masayuki Izumi, Yasuhiro Kajiwara, Daichi Fukami, and Sakae Tsuda
    • Journal Title

      Protein Science

      Volume: 25 Pages: 65

    • DOI

      ISSN 0961-8368

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] III型不凍蛋白質ー水系のガラス転移挙動2016

    • Author(s)
      東 信晃、宮崎裕司、津田 栄
    • Journal Title

      大阪大学科学熱学レポート

      Volume: 37 Pages: 86-87

    • DOI

      ISSN 0910-6774

  • [Journal Article] 不凍液2016

    • Author(s)
      津田 栄
    • Journal Title

      再生医療

      Volume: 15 Pages: 52-53

    • DOI

      ISSN 1347-7919

  • [Presentation] 不凍タンパク質の生産と産業医学応用2017

    • Author(s)
      津田 栄
    • Organizer
      TIAかけはし第3回ナノバイオ・コンソーシアム討論会
    • Place of Presentation
      東京大学、東京都
    • Year and Date
      2017-02-27
    • Invited
  • [Presentation] Temperature dynamics of single molecular AntiFreeze Protein2017

    • Author(s)
      岡田璃生、池崎圭吾、関口博史、張 宰源、宮澤佳甫、福間剛士、太田 昇、津田 栄、佐々木裕次
    • Organizer
      61st Biophysical Society Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Ernst N. Morial Convention Center, New Orleans, USA
    • Year and Date
      2017-02-11 – 2017-02-15
  • [Presentation] 魚類由来不凍タンパク質を用いた細胞冷蔵保存2017

    • Author(s)
      室井宏仁、新井達也、三浦 愛、大山恭史、近藤英昌、津田 栄
    • Organizer
      第26回化学工学・粉体工学研究発表会
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌市
    • Year and Date
      2017-01-27
  • [Presentation] Quantitative Method to Evaluate Ice Recrystallization Kinetics of AFP Solutions2017

    • Author(s)
      ラーマンアニカ、マハタウッディンシェイク、大山恭史、近藤英昌、津田 栄
    • Organizer
      第26回化学工学・粉体工学研究発表会
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌市
    • Year and Date
      2017-01-27
  • [Presentation] 不凍物質の科学2017

    • Author(s)
      津田 栄
    • Organizer
      第3回低温科学技術交流調査会
    • Place of Presentation
      ちよだプラットフォーム、東京都
    • Year and Date
      2017-01-20
    • Invited
  • [Presentation] 不凍タンパク質の1分子動態・構造・吸着の温度依存性測定2017

    • Author(s)
      岡田璃生、深見大地、新井達也、松下祐福、張 宰源、関口博史、太田 昇、森 直、西島 正樹、宮澤佳甫、福間剛士、池崎圭吾、津田 栄、佐々木裕次
    • Organizer
      第30回日本放射光学会年会
    • Place of Presentation
      神戸芸術センター、神戸市
    • Year and Date
      2017-01-07 – 2017-01-09
  • [Presentation] Quantitative Methods to Evaluate Ice Recrystallization Inhibition Rate Using Feret`s Diameter2016

    • Author(s)
      ラーマンアニカ、大山恭史、マハタウッディンシェイク、近藤英昌、津田 栄
    • Organizer
      4th International Lilfe-Science Symposium
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌市
    • Year and Date
      2016-11-18
  • [Presentation] Characterization of An Antifreeze Protein from an Ascomycete, Antarctomyces psychrotrophicus2016

    • Author(s)
      新井達也、深見大地、近藤英昌、津田 栄
    • Organizer
      4th International Lilfe-Science Symposium
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌市
    • Year and Date
      2016-11-18
  • [Presentation] Antifreeze protein from righteye flounder enhances cell viability with Fetal Bovine Serum in hypothermic condition2016

    • Author(s)
      室井宏仁、新井達也、大山恭史、三浦 愛、近藤英昌、津田 栄
    • Organizer
      4th International Lilfe-Science Symposium
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌市
    • Year and Date
      2016-11-18
  • [Presentation] A New Parameter to Evaluate the Activity of Antifreeze Proteins, CISC2016

    • Author(s)
      マハタウッディンシェイク、津田 栄
    • Organizer
      4th International Lilfe-Science Symposium
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌市
    • Year and Date
      2016-11-18
  • [Presentation] Activity modification by mixing of antifreeze proteins2016

    • Author(s)
      深見大地、マハタウッディンシェイク、近藤英昌、三浦 愛、津田 栄
    • Organizer
      4th International Lilfe-Science Symposium
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌市
    • Year and Date
      2016-11-18
  • [Presentation] X-ray crystal structure of a hyperactive antifreeze protein isoform from a snow mold fungus,Typhula ishikariensis2016

    • Author(s)
      成 晶、花田祐一、三浦 愛、津田 栄、近藤英昌
    • Organizer
      4th International Lilfe-Science Symposium
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌市
    • Year and Date
      2016-11-18
  • [Presentation] Introducing a calcite-binding function into fish antifreeze protein2016

    • Author(s)
      長内雄基、新井達也、津田 栄、近藤英昌
    • Organizer
      4th International Lilfe-Science Symposium
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌市
    • Year and Date
      2016-11-18
  • [Presentation] Calcite-binding site and its mechanism of biomineralization protein, lithostathine2016

    • Author(s)
      奈良真帆、津田 栄、近藤英昌
    • Organizer
      4th International Lilfe-Science Symposium
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌市
    • Year and Date
      2016-11-18
  • [Presentation] 高純度魚類不凍タンパク質を用いた細胞保存技術の創生2016

    • Author(s)
      新井達也、室井宏仁、武山将大、近藤英昌、津田 栄
    • Organizer
      Cryopreservation Conference 2016
    • Place of Presentation
      基礎生物学研究センター、岡崎市
    • Year and Date
      2016-11-10 – 2016-11-11
    • Invited
  • [Presentation] 人工脂質二重膜を用いた不凍蛋白質の細胞保護機能の解析2016

    • Author(s)
      武山将大、マハタウッディンシェイク、近藤英昌、津田 栄
    • Organizer
      Cryopreservation Conference 2016
    • Place of Presentation
      基礎生物学研究センター、岡崎市
    • Year and Date
      2016-11-10 – 2016-11-11
  • [Presentation] Mass preparation of fish antifreeze protein2016

    • Author(s)
      Sakae Tsuda
    • Organizer
      BIOPROCESS 2016 International Meeting
    • Place of Presentation
      Crowne Plaza Houston River Oaks, Houston, USA
    • Year and Date
      2016-10-20 – 2016-10-21
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] バイオミネラリゼーション機能を付加した不凍タンパク質の創出2016

    • Author(s)
      長内雄基、新井達也、津田 栄、近藤英昌
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター、仙台市
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] 人工脂質二重膜を用いた不凍タンパク質の細胞膜保護機能の解析2016

    • Author(s)
      武山将大、マハタウッディンシェイク、近藤英昌、津田 栄
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター、仙台市
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] Observation of abnormal Brownian motion of Antifreeze Protein by using Diffracted X-ray Tracking2016

    • Author(s)
      岡田璃生、新井達也、松下祐福、関口博史、池崎圭吾、津田 栄、佐々木裕次
    • Organizer
      第18回結晶成長国際会議(ICCGE-18)
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、名古屋市
    • Year and Date
      2016-08-07 – 2016-08-12
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Anomalous Glass Transition Behavior of Hexagonal Ice Caused by Antifreeze Protein III2016

    • Author(s)
      東 信晃、宮崎裕司、津田 栄、中野元裕
    • Organizer
      THE CALORIMETRY CONFERENCE 2016 (CALCON 2016)
    • Place of Presentation
      Turtle Bay Resort, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2016-07-31 – 2016-08-04
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Cell Pausing法でのIII型不凍タンパク質の応用可能性に関する検討2016

    • Author(s)
      室井宏仁、新井達也、三浦愛、近藤英昌、津田 栄
    • Organizer
      第61回低温生物工学会年会
    • Place of Presentation
      東京電機大学、埼玉県比企郡鳩山町
    • Year and Date
      2016-06-25 – 2016-06-26
  • [Presentation] 魚類Type II AFPの細胞保護機能の解析2016

    • Author(s)
      新井達也、近藤英昌、津田 栄
    • Organizer
      第61回低温生物工学会年会
    • Place of Presentation
      東京電機大学、埼玉県比企郡鳩山町
    • Year and Date
      2016-06-25 – 2016-06-26
  • [Presentation] 熱容量測定によるI型不凍蛋白質が結合した氷のダイナミクス2016

    • Author(s)
      東 信晃、宮崎裕司、津田 栄、中野元裕
    • Organizer
      第61回低温生物工学会
    • Place of Presentation
      東京電機大学、埼玉県比企郡鳩山町
    • Year and Date
      2016-06-25 – 2016-06-26
  • [Presentation] X線1分子追跡法による不凍タンパク質の異常なブラウン運動観察2016

    • Author(s)
      岡田璃生、松下祐福、張 宰源、関口博史、西島 正樹、池崎圭吾、津田 栄、佐々木裕次
    • Organizer
      第16回日本蛋白質化学会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡市
    • Year and Date
      2016-06-07 – 2016-06-09
  • [Remarks] 連結して氷の結晶成長を食い止める不凍タンパク質を発見

    • URL

      http://www.aist.go.jp/aist_j/new_research/2017/nr20170216/nr20170216.html

  • [Remarks] 不凍タンパク質 (AFP) の研究 ~機能解明から産業応用まで~ 津田 栄

    • URL

      https://staff.aist.go.jp/s.tsuda/AFP_study/afp_study.html

URL: 

Published: 2018-01-16  

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