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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Development of high-throughput system of visible immunoprecipitation assay

Research Project

Project/Area Number 15K14456
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

中山 和久  京都大学, 薬学研究科, 教授 (40192679)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Keywordsタンパク質間相互作用 / GFP / Nanobody / マイクロプレート / ポリスチレン親和性タグ
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、独自に開発した改変型共免疫沈降法である『観るだけでわかるタンパク質間相互作用解析法:visible immunoprecipitation assay(VIPアッセイ)』に関して、マイクロプレートによりアッセイが可能になるように改良するとともに、このアッセイを用いてさまざまな結合タンパク質のスクリーニングを行うことを目的とした。
まず、共免疫沈降に用いるGST融合型抗GFP-Nanobodyに関して、これまでの検討結果でもっとも吸着性の高かったポリスチレン(PS)親和性ペプチド配列をタグとして用い、PSマイクロプレートへの吸着条件、およびプレート洗浄の条件の最適化を図った。PSタグNanobodyは、BSAや界面活性剤のTween20の存在下においても、PSマイクロプレートに対して高い吸着性を示した。ただし、感度はグルタチオンセファロースビーズを用いる通常の共免疫沈降系と比べてはるかに悪かった。
そこで、抗GST抗体を二次抗体、抗ウサギIgGを三次抗体として用いてシグナルを増幅し、最終的にELISAで検出することを検討した。さまざまな比率で二次抗体と三次抗体を試し、最適の比率条件を決定した。そして、ELISAで検出することによって、高感度化に成功した。さらに、GST融合型抗GFP-Nanobody(一次抗体)、二次抗体、三次抗体の添加に関して、One-Step、Two-Step、Three-Step添加法を試し、One-Step法での高感度化を達成できた。ただし、ELISAを用いる方法ではVIPアッセイの利点(すなわち簡便であること)を十分には活かせていないことから、実用化のためには今後の検討が必要である。

  • Research Products

    (28 results)

All 2017 2016

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results) Presentation (20 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Regulation of ciliary retrograde protein trafficking by the Joubert syndrome proteins ARL13B and INPP5E2017

    • Author(s)
      Nozaki S, Katoh Y, Terada M, Michisaka S, Funabashi T, Takahashi S, Kontani K, Nakayama K
    • Journal Title

      J. Cell Sci.

      Volume: 130 Pages: 563-576

    • DOI

      10.1242/jcs.197004

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Intraflagellar transport-A complex mediates ciliary entry and retrograde trafficking of ciliary G protein-coupled receptors2017

    • Author(s)
      Hirano T, Katoh Y, Nakayama K
    • Journal Title

      Mol. Biol. Cell

      Volume: 28 Pages: 429-439

    • DOI

      10.1091/mbc.E16-11-0813

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Ciliary entry of KIF17 is dependent on its binding to the IFT-B complex via IFT46-IFT56 as well as on its nuclear localization signal2017

    • Author(s)
      Funabashi T, Katoh Y, Michisaka S, Terada M, Sugawa M, Nakayama K
    • Journal Title

      Mol. Biol. Cell

      Volume: 28 Pages: 624-63

    • DOI

      10.1091/mbc.E16-09-0648

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Practical method for targeted disruption of cilia-related genes by using CRISPR/Cas9-mediated, homology-independent knock-in system2017

    • Author(s)
      Katoh Y, Michisaka S, Nozaki S, Funabashi T, Hirano T, Takei R, Nakayama K
    • Journal Title

      Mol. Biol. Cell

      Volume: 28 Pages: 898-906

    • DOI

      10.1091/mbc.E17-01-0051

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Overall Architecture of the Intraflagellar Transport (IFT)-B Complex Containing Cluap1/IFT38 as an Essential Component of the IFT-B Peripheral Subcomplex2016

    • Author(s)
      Katoh Y, Terada M, Nishijima Y, Takei R, Nozaki S, Hamada H, Nakayama K
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 291 Pages: 10962-10975

    • DOI

      10.1074/jbc.M116.713883

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Alteration of transbilayer phospholipid compositions is involved in cell adhesion, cell spreading, and focal adhesion formation2016

    • Author(s)
      Miyano R, Matsumoto T, Takatsu H, Nakayama K, Shin HW
    • Journal Title

      FEBS Lett.

      Volume: 590 Pages: 2138-2145

    • DOI

      10.1002/1873-3468.12247

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The phospholipid flippase ATP9A is required for the recycling pathway from the endosomes to the plasma membrane2016

    • Author(s)
      Tanaka Y, Ono N, Shima T, Tanaka G, Katoh Y, Nakayama K, Takatsu H, Shin HW
    • Journal Title

      Mol. Biol. Cell

      Volume: 27 Pages: 3883-3893

    • DOI

      10.1091/mbc.E16-08-0586

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modulation of primary cilia length by melanin-concentrating hormone receptor 12016

    • Author(s)
      Hamamoto A, Yamato S, Katoh Y, Nakayama K, Yoshimura K, Takeda S, Kobayashi Y, Saito Y
    • Journal Title

      Cell. Signal.

      Volume: 28 Pages: 572-584

    • DOI

      10.1016/j.cellsig.2016.02.018

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Phospholipid flippase ATP10A, a me mber of type IV P-type ATPases, translocates phosphatidylcholine and is involved in plasma membrane dynamics.2016

    • Author(s)
      Naito, T., Takatsu, H., Miyano, R., Takada, N., Nakayama, K. & Shin, H.-W.
    • Organizer
      2016 ASCB Annu al Meeting.
    • Place of Presentation
      San Francisco, California, USA,
    • Year and Date
      2016-12-03 – 2016-12-07
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Regulation of ciliary retrograde protein trafficking by Joubert syndrome proteins Arl13b and INPP5E.2016

    • Author(s)
      Nozaki, S., Katoh, Y. & Nakayama, K.
    • Organizer
      2016 ASCB Annu al Meeting.
    • Place of Presentation
      San Francisco, California, USA,
    • Year and Date
      2016-12-03 – 2016-12-07
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Arl13b-dependant localization of INPP5E within cilia maintains ciliary r etrograde protein trafficking.2016

    • Author(s)
      Nozaki, S., Katoh, Y. & Nakayama, K.
    • Organizer
      The 28th CDB Meeting, “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-11-27 – 2016-11-29
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Overall architecture of the intraflagellar transport (IFT)-B complex rev ealed by a visible immunoprecipitation assay.2016

    • Author(s)
      Katoh, Y., Terada, M. & Nakayama, K.
    • Organizer
      he 28th CDB Meeting, “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Dir ections”
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-11-27 – 2016-11-29
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Differential roles of KIF17 and heterotrimeric kinesin-II interacting with the IFT-B complex in biogenesis of primary cilia.2016

    • Author(s)
      Funabashi, T., Katoh, Y. & Nakayama, K.
    • Organizer
      The 28th CDB Meeting, “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”.
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-11-27 – 2016-11-29
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] IFT-A複合体と相互作用するC11orf74の繊毛内タンパク質輸送における役割.2016

    • Author(s)
      高原万梨子、平野友章、加藤洋平、中山和久
    • Organizer
      第89回日 本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] キネシン2とIFT複合体の相互作用の様式の解明と繊毛形成における役割.2016

    • Author(s)
      船橋輝記、加藤洋平、中山和久
    • Organizer
      第89回日 本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] P4-ATPaseによるリン脂質フリップが膜変形に与える影響.2016

    • Author(s)
      高田直人、中山和久、申 惠媛
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] リン脂質フリッパーゼATP11CのPKCによる制御機構.2016

    • Author(s)
      高津宏之、高山真裕、中山和久、申 惠媛
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] ジュベール症候群原因遺伝子産物Arl13bによって制御される繊毛内タンパク質輸送の分子機構.2016

    • Author(s)
      加藤洋平、野崎梢平、中山和久
    • Organizer
      第 89回日本生化学会大会シンポジウム「Arfファミリー低分子量Gタンパク質群が介在する多彩な生理機能と関連疾患」
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
    • Invited
  • [Presentation] 繊毛内のイノシトールリン脂質代謝とタンパク質の局在におけるArl13bとIFT-Bの役割.2016

    • Author(s)
      野崎梢平、加藤洋平、中山和久
    • Organizer
      第15回 次 世代を担う若手ファーマ・バイオフォーラム2016
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2016-09-10 – 2016-09-11
  • [Presentation] 繊毛内タンパク質の輸送を担うIFT-A複合体の構築様式と機能の解明.2016

    • Author(s)
      平野友章、加藤洋平、中山和久
    • Organizer
      第15回 次 世代を担う若手ファーマ・バイオフォーラム2016
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2016-09-10 – 2016-09-11
  • [Presentation] 中心体/基底小体で複合体を形成するRabL2-Cep19-FOPの機能の解析.2016

    • Author(s)
      西島侑哉、萩谷遥平、加藤洋平、中山和久
    • Organizer
      第15回 次 世代を担う若手ファーマ・バイオフォーラム2016
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2016-09-10 – 2016-09-11
  • [Presentation] 繊毛内のイノシトールリン脂質代謝とタンパク質の局在におけるArl13bとIFT-Bの役割.2016

    • Author(s)
      野崎梢平、加藤洋平、中山和久
    • Organizer
      第68回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2016-06-16
  • [Presentation] 繊毛内タンパク質輸送複合体IFT-Aの構築様式と機能の解明.2016

    • Author(s)
      平野友章、加藤洋平、中山和久
    • Organizer
      第68回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2016-06-15
  • [Presentation] KIF17とIFT複合体の相互作用様式の解明と繊毛形成における役割.2016

    • Author(s)
      船橋輝記、加藤洋平、中山和久
    • Organizer
      第68回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2016-06-15
  • [Presentation] 観るだけでわかるタンパク質間相互作用解析法」を活用した繊毛内タンパク質輸送複合体 IFT-Bの構築様式の解明.2016

    • Author(s)
      加藤洋平、寺田将也、野崎梢平
    • Organizer
      第68回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2016-06-15
  • [Presentation] Trafficking Machineries within Cilia: Arc hitectures and Functions of the IFT-A and IFT-B complexes.2016

    • Author(s)
      Nakayama, K., Katoh, Y., Terada, T., Nozaki, S., Hirano, T. & Funabashi, T.
    • Organizer
      第68回日本細胞生物学会大会シンポジウム「高次生命機能を司るメンブレ ントラフィック:分子基盤からその破綻による疾患発症の理解に向けて」
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2016-06-15
    • Invited
  • [Presentation] 「観るだけでわかるタンパク質間相互作用解析法」の開発と繊毛内タンパク質輸送複合体 IFT-B の 構築様式の解明.2016

    • Author(s)
      加藤洋平、寺田将也、中山和久
    • Organizer
      第63回日本生化学会近畿支部例会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-05-21
  • [Presentation] KIF17 と IFT 複合体の相互作用様式の解明と繊毛内輸送における役割.2016

    • Author(s)
      船橋輝記、加藤洋平、中山和久
    • Organizer
      第63回日本生化学会近畿支部例会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-05-21

URL: 

Published: 2018-01-16  

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