The role of protozoa in the emergence of diseases

2017 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 15K14850
• Research Institution: Hokkaido University
• Principal Investigator: 中尾 亮 北海道大学, 獣医学研究院, 准教授 (50633955)
• Project Period (FY): 2015-04-01 – 2018-03-31
• Keywords: 原生生物 / アメーバ / メタゲノム / 共生微生物 / 細菌叢

Outline of Annual Research Achievements

本研究は、環境中に生息するアメーバ等の原生生物が「病原体の自然界での潜伏」と「環境菌から病原菌への進化」において重要な役割を担うのではないかとの仮説を立て、環境サンプル中の細菌および原生生物組成を明らかにすることを目的とした。タイ王国の類鼻疽流行地から採集した土壌および環境水およびザンビア共和国首都ルサカ近隣で採取した環境水を材料に原核生物16SリボソーマルRNA遺伝子および真核生物18SリボソーマルRNA遺伝子の超可変領域をPCR増幅し、Illumina MiSeqを用いてアンプリコン解析を実施した。タイ王国の類鼻疽流行地由来サンプルからは、類鼻疽病原体であるBurkholderia pseudomalleiに相同性の高い配列が多数得られた。一方で、解析した16SリボソーマルRNA遺伝子領域の配列のみではB. pseudomalleiと近縁である非病原性のB. thailandensisと区別が困難であり、今後MinIONなどのロングリードシーケンサーを用いた解析の必要性が明らかとなった。ザンビア共和国由来のサンプルからは、FusobacteriumおよびTermimonas等が最優占細菌属として検出されたが、当地で流行する感染症との関連は見出せなかった。真核生物18SリボソーマルRNA遺伝子の解析については、データベース整備が進まず、多くのリードのアノテーションが困難となる課題が残った。今後、データベースの拡充とリボソーマルRNA遺伝子間領域であるITS（internal transcribed spacer）1 および ITS2等の他の超可変領域を追加した解析が必要と考えられた。

Research Products

• [Int'l Joint Research] University of Zambia(Zambia)
  • Country Name: Zambia
  • Counterpart Institution: University of Zambia
• [Int'l Joint Research] Mahidol University(Thailand)
  • Country Name: Thailand
  • Counterpart Institution: Mahidol University
• [Journal Article] Tick-borne haemoparasites and Anaplasmataceae in domestic dogs in Zambia (2018)
  • Author(s): Qiu Yongjin, Kaneko Chiho, Kajihara Masahiro, Ngonda Saasa, Simulundu Edgar, Muleya Walter, Thu May J., Hang'ombe Mudenda B., Katakura Ken, Takada Ayato, Sawa Hirofumi, Simuunza Martin, Nakao Ryo
  • Journal Title: Ticks and Tick-borne Diseases Volume: 印刷中 Pages: 印刷中
  • DOI: 10.1016/j.ttbdis.2018.03.025
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] First molecular detection and genetic characterization of Coxiella burnetii in Zambian dogs and rodents (2018)
  • Author(s): Chitanga Simbarashe、Simulundu Edgar、Simuunza Martin C.、Changula Katendi、Qiu Yongjin、Kajihara Masahiro、Nakao Ryo、Syakalima Michelo、Takada Ayato、Mweene Aaron S.、Mukaratirwa Samson、Hang’ombe Bernard M.
  • Journal Title: Parasites & Vectors Volume: 11 Pages: 40
  • DOI: 10.1186/s13071-018-2629-7
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Geographic strain differentiation of Schistosoma japonicum in the Philippines using microsatellite markers (2017)
  • Author(s): Moendeg Kharleezelle J.、Angeles Jose Ma M.、Nakao Ryo、Leonardo Lydia R.、Fontanilla Ian Kendrich C.、Goto Yasuyuki、Kirinoki Masashi、Villacorte Elena A.、Rivera Pilarita T.、Inoue Noboru、Chigusa Yuichi、Kawazu Shin-ichiro
  • Journal Title: PLOS Neglected Tropical Diseases Volume: 11 Pages: e0005749
  • DOI: 10.1371/journal.pntd.0005749
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Listeria monocytogenes serotype 4b strains replicate in monocytes/macrophages more than the other serotypes (2017)
  • Author(s): HASEBE Rie、NAKAO Ryo、OHNUMA Aiko、YAMASAKI Takeshi、SAWA Hirofumi、TAKAI Shinji、HORIUCHI Motohiro
  • Journal Title: The Journal of Veterinary Medical Science Volume: 79 Pages: 962～969
  • DOI: 10.1292/jvms.16-0575
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] Potential of cell-free DNA as a novel diagnostic biomarker for parasite infections in dog (2017)
  • Author(s): Akter S, Nakao R, Katakura K
  • Organizer: 26th International Conference of the World Association for the Advancement of Veterinary Parasitology (WAAVP)
  • Int'l Joint Research