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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Development of system-wide zebrafish immune repertoire analysis at the individual level

Research Project

Project/Area Number 15K14879
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

一戸 辰夫  広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 教授 (80314219)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 本庶 仁子  広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 講師 (80614106)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywordsゼブラフィッシュモデル / 免疫系 / 主要組織適合性抗原 / 造血細胞移植 / 次世代シーケンサー
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目標は、ゼブラフィッシュの優れたモデル生物としての特性を利用し、主要組織適合性複合体(major histocompatibility complex, MHC)相同遺伝子の組み替え型個体や免疫不全個体の作成によって安定した造血細胞移植のシステムを確立するとともに、それ らを利用して個体全体に存在するT細胞/B細胞レパトワの網羅的かつ鳥瞰的な解析技術を開発することである。この目的を達成するため、以下の研究を行なった。
(1)ゼブラフィッシュの単一個体に存在する全てのT細胞クローンを、T細胞受容体CDR3コード領域遺伝子配列の高速シーケンシングによって、網羅的かつ半定量的に同定する技術を開発した。
(2)ゼブラフィッシュ のMHC遺伝子のタイピング法を用いて、申請者の研究室で保有しているさまざまな野生型および遺伝子改変型ゼブラフィッシュのMHCハプロタイプを同定し、従来は報告されていない新しいクラスI遺伝子(U遺伝子)を見出し、cDNA全長のクローニングを試みた。
(3)野生型同一種のゼブラフィッシュを用いたMHC部分不一致個体間におけるwhole kidney marrowの移植モデルを用いて、GVHDに相当する反応を誘導できる系を作成し、全個体レベルでドナー由来造血細胞のライブイメージングによる解析を試みた。
(4)上記の網羅的T細胞受容体解析系のヒトへの応用可能性を検討し、ヒトのウイルス抗原特異的免疫応答や造血幹細胞移植後のT細胞レパトワの再構築を行い、末梢血T細胞サブセットの階層性を明らかにした。

  • Research Products

    (10 results)

All 2018 2017 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] Next-generation immune repertoire sequencing as a clue to elucidate the landscape of immune modulation by host-gut microbiome interactions.2018

    • Author(s)
      Ichinohe T, Miyama T, Kawase T, Honjo Y, Kitaura K, Sato H, Shin-I T, Suzuki R.
    • Journal Title

      Front Immunol.

      Volume: 9 Pages: 668

    • DOI

      10.3389/fimmu.2018.00668.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Highly functional T-cell receptor repertoires are abundant in stem memory T cells and highly shared among individuals.2017

    • Author(s)
      Miyama T, Kawase T, Kitaura T, Chishaki R, Shibata M, Oshima K, Hamana H, Kishi H, Muraguchi A, Kuzushima K, Saji H, Shin-I T, Suzuki R, Ichinohe T.
    • Journal Title

      Sci Rep.

      Volume: 7 Pages: 3663

    • DOI

      10.1038/s41598-017-03855-x.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Tumor growth limited to subcutaneous site vs tumor growth in pulmonary site exhibit differential effects on systemic immunities.2017

    • Author(s)
      Masuda J, Takayama E, Strober W, Satoh A, Morimoto Y, Honjo Y, Ichinohe T, Tokuno SI, Ishizuka T, Nakata T, Mizutani A, Umemura N, Kitani A, Fuss IJ, Shigehiro T, Kawaki H, Mizuno-Kamiya M, Kondoh N, Seno M.
    • Journal Title

      Oncol Rep.

      Volume: 38 Pages: 449-455

    • DOI

      doi:10.3892/or.2017.5646.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 新しい養子免疫療法を目指したTALEN法によるT細胞受容体ゲノム編集技術の開発.2017

    • Author(s)
      本庶仁子, 一戸辰夫.
    • Journal Title

      無菌生物.

      Volume: 47 Pages: 68-69

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] T-cell receptor gene editing by transcription activator-like effector nuclease (TALEN) as a novel tool for adoptive T-cell immunotherapy.2017

    • Author(s)
      Yasuko Honjo, Takahiko Miyama, Takakazu Kawase, Tetsushi Sakuma, Takashi Yamamoto, Tatsuo Ichinohe.
    • Organizer
      The 19th International Symposium on Gnotobiology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Next-generation sequencing-based immunobioinformatics: toward a comprehensive understanding of the human immune system.2017

    • Author(s)
      Tatsuo Ichinohe.
    • Organizer
      The 19th International Symposium on Gnotobiology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Landscape of immune reconstitution after allogeneic hematopoietic cell transplantation is superdominated by distinct T cell populations bearing T-cell receptor clonotypes shared among different individuals.2017

    • Author(s)
      Takahiko Miyama, Takakazu Kawase, Yasuko Honjo, Kazutaka Kitaura, Tadasu Shin-I, Ryuji Suzuki, Tatsuo Ichinohe.
    • Organizer
      59th Annual Meeting of the American Society of Hematology
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] ウイルスに対する反応性が高いT細胞は「共有T細胞レセプター」を利用していることを解明しました

    • URL

      https://www.hiroshima-u.ac.jp/rbm/news/40259

  • [Patent(Industrial Property Rights)] Platinum TALENを用いたT細胞受容体の完全置換技術2017

    • Inventor(s)
      一戸辰夫、山本 卓、佐久間哲史、本庶仁子、他3名
    • Industrial Property Rights Holder
      一戸辰夫、山本 卓、佐久間哲史、本庶仁子、他3名
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2017-197010
  • [Patent(Industrial Property Rights)] エフェクターT細胞(Teff)抗原受容体を用いた抗原特異的制御性T 細胞(Treg)の作出技術2017

    • Inventor(s)
      一戸辰夫、山本 卓、佐久間哲史、本庶仁子、他3名
    • Industrial Property Rights Holder
      一戸辰夫、山本 卓、佐久間哲史、本庶仁子、他3名
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2017-197010

URL: 

Published: 2021-01-27  

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