2017 Fiscal Year Annual Research Report
The exploration of endogenous virus in tick genomes
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15K15126
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| Research Institution | Nagasaki University |
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Principal Investigator |
早坂 大輔 長崎大学, 熱帯医学研究所, 准教授 (10346926)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鍋島 武 長崎大学, 熱帯医学研究所, 助教 (30546859)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | マダニ / 内在性ウイルス / オオトゲチマダニ / ヤマトマダニ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
長崎県で採集されたヤマアラシチマダニ、タカサゴチマダニ、タカサゴキララマダニ、北海道で採集されたオオトゲチマダニ、ヤマトマダニからDNAを抽出し、ダニのゲノムDNAをフラグメント化したのち、cDNAライブラリを構築した。Ion proton(Thermo Fisher)でcDNAのシークエンシングを行い、翻訳産物に最も近縁となるウイルスのアミノ酸配列を検索した。
その結果、ダニのゲノム中からssRNAウイルス、dsRNAウイルスに属する多様ウイルス類似の配列が見つかった。ssRNAウイルスでは、Orthomyxoviridae科、Phenuiviridae科、Rhabdoviridae科、及び未分類の直鎖状RNAゲノムを持つウイルス、環状RNAゲノムを持つウイルスに近縁の配列が見つかった。Orthomyxoviridae科Quaranjavirus属、Phenuiviridae科Phlebovirus属、Rhabdoviridae科のウイルスは、昆虫、またはダニによって媒介されるアルボウイルスを含む群である。直鎖状RNAゲノムを持つWuhan Tick Virus 1、環状RNAゲノムを持つBole Tick Virus 3とTacheng Tick Virus 4は、ともに近年、中国から報告されたウイルスである。オオトゲチマダニおよびヤマトマダニのゲノムからは、dsRNAウイルスであるTotiviridae科のウイルスに近縁な配列が見つかった。また、ヤマトマダニのゲノムからは、dsRNAウイルスで分節ゲノムを持つ、Reoviridae科Sedoreovirinae亜科Orbivirus属のウイルスに近縁な配列が見つかった。
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