• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2016 Fiscal Year Annual Research Report

Relationship between solvation structures and functionalities of proteins in ionic liquids

Research Project

Project/Area Number 15K17467
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

梅田 健一  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特別研究員 (60746915)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Keywords3次元周波数変調型原子間力顕微鏡 / イオン液体 / 溶媒和構造 / 分子動力学計算 / 密度汎関数法
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、市販の装置に改良を行った超低雑音の液中動作3D-FM-AFMを用いて、イオン液体水溶液中において、生体試料表面上に形成された溶媒和構造可視化機構の解明を目的としている。
これまでイオン液体中におけるAFMの実験結果に関する報告例はあるが、3次元的な構造を可視化した内容は存在しない。またバルク溶液中の理論計算結果の報告例は多いが、表面上に形成された溶媒和構造を議論している報告例も少ない。前年度までの研究において、弱電解質水溶液中およびイオン液体水溶液中において、3次元溶媒和構造の可視化に成功しており、表面電荷と溶媒和構造の相関に関して知見を得ることができた。
今年度は、更に効率的に3次元計測を可能とするための計測および解析プログラムの開発を行った。また、共同研究先であるフィンランドの理論グループから分子動力学計算による二つの異なった帯電表面の境界近傍における水和構造のシミュレーション結果を得ることにも成功した。その他、京都大学の産官学連携本部の研究室との共同研究により、密度汎関数法を用いたイオン液体分子の電子状態最適化および分子動力学法を用いた水溶液中における溶媒和構造のシミュレーション結果を得ることにも成功し、3D-FM-AFMの実験結果に対応する理論計算データを得ることにも成功した。
実験と理論の比較から、プロトン性のイオン液体の場合には、水分子と水素結合ネットワークを形成するため、アニオンとカチオンが複数個合体した溶媒和クラスター構造を形成する。一方で、非プロトン性のイオン液体の場合には、このような構造は形成せず、アニオンとカチオンが分離して観察されることを明らかにした。

  • Research Products

    (8 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] アールト大学(フィンランド)

    • Country Name
      FINLAND
    • Counterpart Institution
      アールト大学
  • [Journal Article] Molecular resolution of the water interface at alkali halide terraces and steps2016

    • Author(s)
      F. Ito, K. Kobayashi, P. Spijker, L. Zivanovic, Kenichi Umeda, T. Nurmi, N. Holmberg, K. Laasonen, Adam S. Foster, and H. Yamada
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry C

      Volume: 120 Pages: 19714-19722

    • DOI

      10.1021/acs.jpcc.6b05651

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 液中動作3D-FM-AFMおよびMD計算を用いた異種帯電表面上のドメイン境界における局所水和構造の解明2017

    • Author(s)
      梅田健一、小林 圭、L. Zivanovic、P. Spijker、A.S. Foster、山田啓文
    • Organizer
      第64回春期応用物理学会学術講演会(2016)
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県、横浜市)
    • Year and Date
      2017-03-14 – 2017-03-17
  • [Presentation] Local hydration structures around boundary between heterogeneously charged surfaces by FM-AFM and MD simulation2016

    • Author(s)
      K. Umeda, K. Kobayashi, L. Zivanovic, P. Spijker, A.S. Foster, and H. Yamada
    • Organizer
      24th International Colloquium on Scanning Probe Microscopy
    • Place of Presentation
      Hawaii, USA
    • Year and Date
      2016-12-14 – 2016-12-16
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 液中動作3D-FM-AFMを用いた異種帯電表面上における局所水和構造計測2016

    • Author(s)
      梅田健一、小林 圭、L. Zivanovic、P. Spijker、A.S. Foster、山田啓文
    • Organizer
      第36回表面科学学術講演会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県、名古屋市)
    • Year and Date
      2016-11-29 – 2016-12-01
  • [Presentation] Molecular-scale local hydration structures on heterogeneously charged surfaces by FM-AFM and MD calculation2016

    • Author(s)
      K. Umeda, K. Kobayashi, L. Zivanovic, P. Spijker, A.S. Foster, and H. Yamada
    • Organizer
      4th Kanazawa Bio-AFM Workshop
    • Place of Presentation
      KKRホテル(石川県、金沢市)
    • Year and Date
      2016-10-03 – 2016-10-06
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 3D-FM-AFMを用いたイオン液体3次元溶媒和構造と分子種の相関に関する研究2016

    • Author(s)
      梅田健一、小林 圭、山田啓文
    • Organizer
      第76回秋期応用物理学会学術講演会(2016)
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ(新潟県、新潟市)
    • Year and Date
      2016-09-13 – 2016-09-16
  • [Presentation] Three-dimensional local hydration structures on silicate minerals with various tetrahedral arrangements studied by liquid-3D-FM-AFM2016

    • Author(s)
      K. Umeda, K. Kobayashi, and H. Yamada
    • Organizer
      19th International Conference on Noncontact Atomic Force Microscopy
    • Place of Presentation
      Nottingham, UK
    • Year and Date
      2016-07-25 – 2016-07-29
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-01-16  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi