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2016 Fiscal Year Research-status Report

神経特異的RNA結合蛋白質HuDが担う部位特異的翻訳制御機構の解析

Research Project

Project/Area Number 15K18480
Research InstitutionKindai University

Principal Investigator

深尾 亜喜良  近畿大学, 薬学部, 助教 (50733979)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
KeywordsRNA結合蛋白質 / 翻訳制御
Outline of Annual Research Achievements

発生や分化のような高次生命現象では、特定の遺伝子が特定の時期・場所に適正量供給されるような時空間的な遺伝子発現制御機構が必須であり、様々なRNA結合蛋白質の仲介により可能となっている。神経細胞特異的に発現しているRNA結合蛋白質の1つとしてHuDが挙げられ、これまでの研究からHuDはmRNAの翻訳活性化機能を有すること、そしてHuDの翻訳活性化機能が神経分化誘導に必須であることが示されてきた。またHuDは神経突起中を輸送されるmRNA-蛋白質複合体(mRNP)に含まれ、標的mRNAの翻訳スイッチとして機能する可能性が示唆されている。本研究ではHuDの翻訳活性化機能に対して阻害的に働く因子を同定することでmRNP輸送時の翻訳抑制機構を分子レベルで解明することを目的としている。
本年度は前年度の研究によりHuDとの相互作用が確認された候補因子について、各因子を過剰発現させた細胞抽出液を調製しHuDの翻訳活性化機能への影響を解析した。その結果、脊髄性筋萎縮症(SMA)の原因遺伝子として知られるSMNがHuDの翻訳活性化機能を阻害することが明らかになった。またHuDとの結合能を欠失させたSMN変異体はHuDの翻訳活性化機能を阻害しなかった。このことから、SMNはHuDとの結合を介してHuDのもつ翻訳活性化機能を阻害するという可能性が示唆された。また、主として核局在を示すSMNがHuDとの共発現により細胞質へ移行することが明らかとなった。これは、これまで不明であったSMNの細胞質における機能を知る上で非常に重要な結果である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

前年度に引き続きHuDとの相互作用が確認された既知因子(KIF3A、IMP1、SMN)に関してHuDの翻訳活性化機能に対する効果を無細胞in vitro翻訳システムにより解析した。そして、候補因子の1つであったSMNがHuDとの結合活性依存的にHuDの翻訳活性化機能を阻害することを明らかにした。さらに、主として核局在を示すSMNがHuDとの共発現により細胞質へ移行することを明らかにし、これまで不明であったSMNの細胞質における機能を知る上で非常に重要な結果を得た。以上のように、本年度の研究からHuDとSMNの結合を介したmRNA-蛋白質複合体(mRNP)の翻訳抑制機構が存在する可能性を見出すことができた。本研究においてHuDと相互作用する因子によるHuDの翻訳活性化機能阻害を当研究室のもつ無細胞in vitro翻訳システムを用いて再現することは最も重要な課題であり、今後の分子機構解明に必須である。これらの観点から、本研究課題は順調に進展していると評価した。

Strategy for Future Research Activity

これまでの研究により、HuDによるmRNAの翻訳活性化機能がSMNによって阻害されることを明らかにした。さらに、SMNのTudorドメインへの変異導入により、HuDとの相互作用およびHuDの機能阻害効果が失われることを明らかにした。これらのことから、HuDとSMNの結合を介したmRNA-蛋白質複合体(mRNP)の翻訳抑制機構が存在する可能性を見出すことができた。今後は、HuDおよびSMNを含むmRNPがどのような分子機構で翻訳抑制状態を維持しているのかをショ糖密度勾配遠心およびmRNA pull-down法などの生化学的手法を用いて解明する。

Causes of Carryover

物品費として使用するため当該年度内に発注をしていたが、在庫切れにより納品の遅延が生じたため、予算の執行は次年度に持ち越された。

Expenditure Plan for Carryover Budget

遅延していた物品は既に納品済みであり次年度使用額は早々に執行されるため、使用計画に大幅な変更はない。

  • Research Products

    (22 results)

All 2017 2016

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (20 results) (of which Int'l Joint Research: 14 results)

  • [Journal Article] The coupled and uncoupled mechanisms by which trans-acting factors regulate mRNA stability and translation2017

    • Author(s)
      Akira Fukao and Toshinobu Fujiwara
    • Journal Title

      The Jounal of Biochemistry

      Volume: 161(4) Pages: 309-314

    • DOI

      10.1093/jb/mvw086

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Spatial regulation of the KH domain RNA-binding protein Rnc1 mediated by a Crm1-independent nuclear export system in Schizosaccharomyces pombe2017

    • Author(s)
      Ryosuke Satoh, Yasuhiro Matsumura, Akitomo Tanaka, Makoto Takada, Yuna Ito, Kanako Hagihara, Masahiro Inari, Ayako Kita, Akira Fukao, Toshinobu Fujiwara, Shinya Hirai, Tokio Tani and Reiko Sugiura
    • Journal Title

      Molecular Microbiology

      Volume: 104(3) Pages: 428-448

    • DOI

      10.1111/mmi.13636

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] The coupling mechanism between translation and mRNA degradation mediated by RNA-binding protein HuD2016

    • Author(s)
      Miwa Takechi, Akira Fukao , Yoshinori Funakami, Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] ポリオウイルスの細胞種特異的なIRES依存的翻訳の解析2016

    • Author(s)
      貞廣暁利、足達俊吾、深尾亜喜良、船上仁範、夏目徹、竹内理、藤原俊伸
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] PABP interacting protein 1(Paip1)による翻訳制御機構の解析2016

    • Author(s)
      Aoyama T, Otsuka H, Funakami Y, Fukao A, Fujiwara T
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] cap依存的翻訳におけるeIF4Hの機能解析2016

    • Author(s)
      友廣拓生、深尾亜喜良、船上仁範、藤原俊伸
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] RNA結合タンパク質HuDによる翻訳促進機構の素過程の解析2016

    • Author(s)
      大塚衆志、深尾亜喜良、船上仁範、藤原俊伸
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] The novel function of PABP interacting protein 1 (Paip1) in translation initiation2016

    • Author(s)
      Aoyama T, Fukao A, Sonenberg N, Fujiwara T
    • Organizer
      The Cold Spring Harbor Asia conference on RNA Biology
    • Place of Presentation
      Suzhou(中国)
    • Year and Date
      2016-11-14 – 2016-11-18
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The coupling mechanism between translation and mRNA degradation mediated by RNA-binding protein HuD2016

    • Author(s)
      Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analyses of cell type specific translation from IRES mRNA derived from two different poliovirus strains2016

    • Author(s)
      Sadahiro, A., Fukao, A., Takizawa, N., Takeuchi, O., Fujiwara, T.
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analyses of the molecular function of PABP interacting protein 1 (PAIP1) in translational regulation2016

    • Author(s)
      Aoyama T, Fukao A, Sonenberg N, Yanagiya A, Fujiwara T
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Mysterious eukaryotic translation initiation factor eIF4H2016

    • Author(s)
      Takumi Tomohiro, Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Elucidation of elementary processes in which RNA-binding protein HuD stimulates the cap- poly(A) dependent translation2016

    • Author(s)
      Hiroshi Ohtsuka, Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] High affinity RNA for capping enzyme of Saccharomyces cerevisiae2016

    • Author(s)
      Yuka Yamada, Manabu Yamasaki, Naoki Takizawa, Akira Fukao, Toshinou Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Butyrate response factor1 induces translation repression independently of ARE-mediated mRNA decay2016

    • Author(s)
      Miwa Takechi, Akira Fukao, Keizo Tomonaga, Toshinou Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Effect of interaction between RNA binding protein HuD and SMN protein on protein synthesis2016

    • Author(s)
      Daisuke Ikeda, Akira Fukao, Toshinou Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Butyrate response factor1 induces translation repression independently of ARE-mediated mRNA decay2016

    • Author(s)
      Miwa Takechi, Hiroshi Otsuka, Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      EMBO|EMBL Symposium:The Complex Life of mRNA
    • Place of Presentation
      Heidelberg(ドイツ)
    • Year and Date
      2016-10-05 – 2016-10-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The coupling mechanism between translation and mRNA degradation mediated by RNA-binding protein HuD2016

    • Author(s)
      Miwa Takechi, Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      Translational Control 2016
    • Place of Presentation
      New York(アメリカ)
    • Year and Date
      2016-09-06 – 2016-09-10
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ポリオウイルスの細胞種特異的なIRES依存的翻訳の解析2016

    • Author(s)
      貞廣暁利、足達俊吾、深尾亜喜良、夏目徹、竹内理、藤原俊伸
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2016
    • Place of Presentation
      いこいの湯宿いろは(北海道)
    • Year and Date
      2016-08-31 – 2016-09-02
  • [Presentation] The coupling mechanism between translation and mRNA degradation mediated by RNA-binding protein HuD2016

    • Author(s)
      Miwa Takechi, Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      RNA2016
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都)
    • Year and Date
      2016-06-28 – 2016-07-02
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analyses of cell type specific translation from IRES mRNA derived from two different poliovirus strains2016

    • Author(s)
      Sadahiro, A., Fukao, A., Takizawa, N., Takeuchi, O., Fujiwara, T
    • Organizer
      RNA2016
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都)
    • Year and Date
      2016-06-28 – 2016-07-02
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analyses of the molecular function of PABP interacting protein 1 (PAIP1) in translational regulation2016

    • Author(s)
      Aoyama T, Yanagiya A, Sonenberg N, Fukao A, Fujiwara T
    • Organizer
      RNA2016
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都)
    • Year and Date
      2016-06-28 – 2016-07-02
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-01-16  

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