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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Sturcture-function relationship of a high-order replication initiator complex in DNA recognition and functional switching

Research Project

Project/Area Number 15K18504
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

川上 広宣  九州大学, 薬学研究院, 助教 (50403952)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Keywords染色体複製 / ORC / 機能構造解析 / DNA結合
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、出芽酵母ORC複合体が染色体の複製起点を認識するために必須なモチーフeukaryotic origin sensor (EOS; Sci. Rep. 2015)を元に発展させた。EOSを含む部分ペプチドの試験管内における特性を踏まえると、EOSとは別に染色体の走査・探索に関わるモチーフの存在が示唆された。実際に、EOS近傍領域がDNAと結合できなくなるような新たな特異的変異を同定した。変異部位のアミノ酸残基は細胞内におけるOrc1機能に必須であった。新たに見出したこれらの部位がEOSと協調して機能することで複製起点の特異的な走査・探索・認識がなされると思われる。
EOSならびにその近傍領域のDNAに対する親和性はORC6量体の1/100未満であり、ORCのDNA結合機能には更なるDNA結合モチーフが関わる示唆される(Sci. Rep. 2015)。そこでそのような新たなモチーフを見出すため、Orc1の計13アミノ酸をカバーする機能構造解析を行った。その結果、細胞内のOrc1機能に必須な新たな機能構造を見出した。変異蛋白質は細胞内で安定に存在したため、ここでみられた表現型は変異Orc1蛋白質の分解によるものではなく、むしろ特異的機能欠損によるものと示唆された。昨年度末に受理され本年度出版されたORCの簡便精製法(Front. Microbiol. 2016)を用いて変異ORC6量体を高速精製し、精製蛋白質を用いた試験管内再構成系を用いて解析した。その結果、ORC機能が実際に異常になっていることを見出した。

  • Research Products

    (20 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 5 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Near-atomic structural model for bacterial DNA replication initiation complex and its functional insights2016

    • Author(s)
      Masahiro Shimizu, Yasuhiro Noguchi, Yukari Sakiyama, Hironori Kawakami, Tsutomu Katayama, Shoji Takada
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.

      Volume: 113 Pages: E8021-E8030

    • DOI

      10.1073/pnas.1609649113

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸菌染色体の複製開始複合体の全体構造とその機能的意義2017

    • Author(s)
      片山 勉、清水 将裕、野口 泰徳、崎山 友香理、川上 広宣、加生 和寿、高田 彰二
    • Organizer
      第11回ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス(神奈川県藤沢市)
    • Year and Date
      2017-03-02 – 2017-03-04
  • [Presentation] Near-atomic structural model for bacterial DNA replication initiation complex and its functional insights2017

    • Author(s)
      Masahiro Shimizu, Yasuhiro Noguchi, Yukari Sakiyama, Hironori Kawakami, Tsutomu Katayama, Shoji Takada
    • Organizer
      Biophysical Society 61st Annual Meeting
    • Place of Presentation
      New Orleans, Louisiana, USA
    • Year and Date
      2017-02-11 – 2017-02-15
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 複製起点認識蛋白質ORCの一本鎖DNA結合能と生物ドメインを超えた保存性2016

    • Author(s)
      川上 広宣、千々布 壮陽、金本 祥太、大橋 英治、釣本 敏樹、片山 勉
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] 真正細菌オーソログとの配列比較に基づく真核生物ORCおよびCdc6の一本鎖DNA結合モチーフの探索2016

    • Author(s)
      千々布 壮陽、金本 祥太、川上 広宣、片山 勉
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] 大腸菌のoriCにおける複製開始とその制御のため複製開始因子DnaAタンパク質が構築する高次複合体の分子機構2016

    • Author(s)
      片山 勉、加生 和寿、﨑山 友香里、赤間 勇介、井上 祐希江、酒井 隆至、杉山 諒、川上 広宣
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会シンポジウム1AS10「染色体複製複合体の形成と構造変化の分子機構とその制御」
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
    • Invited
  • [Presentation] 細菌DNA複製開始複合体の近原子構造モデルと機能解析2016

    • Author(s)
      清水 将裕、野口 泰徳、崎山 友香里、川上 広宣、片山 勉、高田 彰二
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会シンポジウム1AS10「染色体複製複合体の形成と構造変化の分子機構とその制御」
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
    • Invited
  • [Presentation] Multifaceted approach of Orc1 to DNA is the primary determinant of specific recognition of replication origins by ORC2016

    • Author(s)
      Hironori Kawakami, Takeaki Chichibu, Eiji Ohashi, Shota Kanamoto, Toshiki Tsurimoto, and Tsutomu Katayama
    • Organizer
      The 10th 3R symposium
    • Place of Presentation
      Matsue, Japan
    • Year and Date
      2016-11-13 – 2016-11-17
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structure, Mechanism and Regulation of Escherichia coli Replication Initiation Complexes in DNA Unwinding2016

    • Author(s)
      Tsutomu Katayama, Yukari Sakiyama, Yasunori Noguchi1, and Hironori Kawakami
    • Organizer
      The 10th 3R symposium
    • Place of Presentation
      Matsue, Japan
    • Year and Date
      2016-11-13 – 2016-11-17
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Functional dynamics of replication initiation complex in Escherichia coli2016

    • Author(s)
      Yukari Sakiyama, Yasunori Noguchi, Hironori Kawakami, and Tsutomu Katayama
    • Organizer
      The 10th 3R symposium
    • Place of Presentation
      Matsue, Japan
    • Year and Date
      2016-11-13 – 2016-11-17
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 真核生物の複製起点認識蛋白質ORCによる多角的なDNA探索認識機構2016

    • Author(s)
      川上 広宣、千々布 壮陽、金本 祥太、川畑 健太、大橋 英治、釣本 敏樹、片山 勉
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(仙台)
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] 大腸菌の複製開始複合体における2重鎖DNA開裂とヘリカーゼ相互作用の分子機構2016

    • Author(s)
      片山 勉、﨑山 友香里、赤間 勇介、野口 泰徳、川上 広宣、加生 和寿
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会シンポジウム 2S15「 ゲノムの維持と継承を制御するタンパク質と核酸の相互作用」
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(仙台)
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
    • Invited
  • [Presentation] 大腸菌染色体の複製起点oriC上で形成されるDnaA多量体の機能動態の解明2016

    • Author(s)
      崎山 友香里, 野口 泰徳, 川上 広宣, 片山 勉
    • Organizer
      日本遺伝学会第88回大会 プレナリーワークショップ --昨年のBP賞受賞講演から--
    • Place of Presentation
      日本大学国際関係学部 三島駅北口校舎(三島)
    • Year and Date
      2016-09-07 – 2016-09-10
    • Invited
  • [Presentation] 真核生物の複製起点認識に必須なORC複合体におけるDNA結合性モチーフ様配列の探索と変異体解析2016

    • Author(s)
      川畑 健太、千々布 壮陽、川上 広宣、片山 勉
    • Organizer
      第13回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      グリーンピア南阿蘇(熊本県南阿蘇村)
    • Year and Date
      2016-06-02 – 2016-06-03
  • [Presentation] 細胞増殖に必須な長鎖逆方向反復配列の役割と保存性の推定2016

    • Author(s)
      川上 広宣, 土田 愛海, 竹原 通秋, 加生 和寿, 末次 正幸, 片山 勉
    • Organizer
      第13回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      グリーンピア南阿蘇(熊本県南阿蘇村)
    • Year and Date
      2016-06-02 – 2016-06-03
  • [Presentation] DnaB複製ヘリカーゼ装着におけるDnaA多量体の機能動態2016

    • Author(s)
      崎山 友香里、西村 昌洋、野口 泰徳、川上 広宣、片山 勉
    • Organizer
      第13回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      グリーンピア南阿蘇(熊本県南阿蘇村)
    • Year and Date
      2016-06-02 – 2016-06-03
  • [Presentation] 出芽酵母ORC複合体による染色体認識機構とその多様性2016

    • Author(s)
      川上 広宣、大橋 英治、金本 祥太、釣本 敏樹、片山 勉
    • Organizer
      平成28年度日本生化学会九州支部例会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学郡元キャンパス (鹿児島市)
    • Year and Date
      2016-05-14 – 2016-05-15
  • [Remarks] 分子生物薬学研究業績

    • URL

      http://bunsei.phar.kyushu-u.ac.jp/BUNSEI-GYOUSEKI.html

  • [Remarks] 染色体DNAの複製開始複合体の精密構造が初めて見えるように

    • URL

      http://www.phar.kyushu-u.ac.jp/bbs/view2.php?S_Publ_Year=2016&word=&page=1&B_Code=357

  • [Remarks] 染色体DNAの複製開始複合体の精密構造が初めて見えるように

    • URL

      http://www.kyushu-u.ac.jp/ja/researches/view/63

URL: 

Published: 2018-01-16  

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