2015 Fiscal Year Research-status Report
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15K18578
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| Research Institution | Okayama University |
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Principal Investigator |
池田 陽子 岡山大学, その他部局等, 助教(特任) (80467688)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | トランスポゾン / エピジェネティクス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
トランスポゾン制御機構を明らかにするため、トランスポゾンのサイレンシングが解除された変異体及びストレス感受後のトランスポゾン活性化に対する変異体を単離した。今年度は、トランスポゾン抑制に関わる2つの変異体の解析を進めた。
（１）トランスポゾンの転写抑制が解除されるkumonosu（kun）の解析
維管束及び茎頂組織特異的なサイレンシングの解除が見られるkun変異体について、ゲノムワイドRNAシーケンスを行い、ターゲット遺伝子及びトランスポゾン等を同定した。一方、ゲノムワイドバイサルファイトシーケンスを行い、DNAメチル化状態についてのデータ解析を進めている。ヒストンメチル化抗体による免疫組織染色及びクロマチンIPにより、kun変異体におけるヒストン修飾についても解析を行っている。
（２）トランスポゾン抑制に関わるE5変異体
トランスポゾンサイレンシングが解除された変異体E5について、詳細なマッピングと変異の探索を進めた所、既知の遺伝子上に変異が見つかった。該当遺伝子のT-DNA変異体とのアレルテストを行い、変異の原因が確かに今回同定した遺伝子であることを確かめた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
平成２７年度に計画した内容については、おおむね計画通り進んでいる。
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| Strategy for Future Research Activity |
（１）トランスポゾンの転写抑制が解除されるkumonosu（kun）の解析
上記の研究実績の概要には局在解析の内容が含まれないが、これについては既にマーカー植物の準備を進めており、今後解析を行う予定である。また、現在進めているバイサルファイト解析のデータ処理及びヒストン修飾の解析についても引き続き進める。
（２）トランスポゾン抑制に関わるE5変異体
既知の原因遺伝子が同定されたので、解析をストップする予定である。
（３）その他の変異体についても解析を順次進める。
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| Causes of Carryover |
共同研究により実施しているRNAシーケンスの消耗品等は次年度に請求される予定であるため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
RNAシーケンス消耗品やシーケンスのデータ処理のソフト等の購入、人件費等に計画的に使用予定である。
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[Journal Article] Comprehensive quantification and genome survey reveal the presence of novel phytohormone action modes in red seaweeds2016
Author(s)
Mikami, K., Mori, I.C., Matsuura, T., Ikeda, Y., Kojima, M., Sakakibara, H., Hirayama, T.
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Journal Title
J. Applied Phycology
Volume: 未定
Pages: 未定
DOI
Peer Reviewed
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