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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis for transcriptional regulation mechanism of retrotransposon

Research Project

Project/Area Number 15K18578
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

池田 陽子  岡山大学, 資源植物科学研究所, 特任助教 (80467688)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywordsトランスポゾン / エピジェネティクス / サイレンシング
Outline of Annual Research Achievements

レトロトランスポゾンは、生物のゲノム中に多数存在し、その転移は生物の進化において多様性を生み出すと共に生存に必要な遺伝子を破壊する可能性もあるため、通常、転移が抑制されている。転移の第1段階として、レトロトランスポゾンの転写活性化が必要であると考えられるが、その機構については不明な点が多い。本研究では、シロイヌナズナを用いトランスポゾンサイレンシングに異常がみられる変異体を単離解析し、レトロトランスポゾン抑制に関わる新規因子を明らかにした。
最終年度では、トランスポゾンの転写抑制が解除されるkumonosu(kun)変異体について、どのような機構でトランスポゾンサイレンシングを制御しているかを詳しく解析し、KUNと既知のサイレンシング制御因子との遺伝学的相互作用や、細胞死の経路との関連性を詳細に解析した。また、KUNは植物に特有のトランスポゾン関連ドメインであるPlant mobile domainを有するが、このPlant mobile domainタンパク質の系統樹解析などにより、植物進化の過程におけるPlant mobile domainとトランスポゾンの挿入の関係について考察した。これまでの結果を論文に発表し、Plant mobile domainを持つKUN(MAIL1)及びその相同遺伝子MAINがDNAメチル化や主要なクロマチン修飾とは異なる新規の機構でペリセントロメア領域の凝集に関わることでサイレンシングを制御することを報告した。

  • Research Products

    (6 results)

All 2017 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Universite Clermont Auvergne/CNRS/Inserm(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      Universite Clermont Auvergne/CNRS/Inserm
    • # of Other Institutions
      2
  • [Int'l Joint Research] Max planck institute/Universitat Hamburg(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      Max planck institute/Universitat Hamburg
  • [Journal Article] Arabidopsis proteins with a transposon-related domain act in gene silencing.2017

    • Author(s)
      Ikeda, Y., Pelissier, T., Bourguet, P., Becker, C., Pouch-Pelissier, M. N., Pogorelcnik, R., Weingartner, M., Weigel, D., Deragon, J. M. and Mathieu, O.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 8 Pages: 15122

    • DOI

      doi:10.1038/ncomms15122

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] トランスポゾン関連ドメインをもつ新規遺伝子サイレンシング因子の同定2017

    • Author(s)
      Ikeda, Y., Pelissier, T., Bourguet, P., Becker, C., Pouch-Pelissier, M. N., Pogorelcnik, R., Weingartner, M., Weigel, D., Deragon, J. M. and Mathieu, O.
    • Organizer
      日本植物学会第81回大会
  • [Presentation] トランスポゾン関連ドメインをもつ新規遺伝子サイレンシング因子の同定2017

    • Author(s)
      Ikeda, Y., Pelissier, T., Bourguet, P., Becker, C., Pouch-Pelissier, M. N., Pogorelcnik, R., Weingartner, M., Weigel, D., Deragon, J. M. and Mathieu, O.
    • Organizer
      日本遺伝学会第89回大会
  • [Presentation] The role of plant mobile domain family protein in gene silencing.2017

    • Author(s)
      Ikeda, Y.
    • Organizer
      国立遺伝学研究所 研究集会
    • Invited

URL: 

Published: 2018-12-17  

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