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2015 Fiscal Year Research-status Report

SIV複製制御サル群を用いたエイズウイルスLatent Reservoirの解析

Research Project

Project/Area Number 15K19119
Research InstitutionNational Institute of Infectious Diseases

Principal Investigator

野村 拓志  国立感染症研究所, その他部局等, 研究員 (80711001)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
KeywordsSIV / Latent Reservoir / CTL / プロウイルス / 複製制御
Outline of Annual Research Achievements

CTL依存的SIV複製制御アカゲザルにおいてLatent ReservoirでのCTL逃避変異体の検出限界未満でのウイルスの増殖が示唆されており、Latent Reservoirでは大多数のSIV wild typeプロウイルスゲノムに対して、きわめて少数のCTL逃避変異を含むプロウイルスゲノムが混在していると考えられる。平成27年度においてはこのような微小集団の検出・解析のために、Real time PCR法による全プロウイルスゲノム中のwild typeとCTL逃避変異体のコピー数の測定法の確立を目指したが奏功しなかった。このためまずReal time PCR法によりプロウイルスゲノム数を測定した後に、限界希釈 nested PCR法を行うことでプロウイルス性状を解析する系を作製した。
Tfh細胞、CD4陽性メモリー幹細胞、CD34陽性多機能造血幹細胞は、特に抗レトロウイルス薬治療を行った際のHIV/SIV感染症におけるLatent Reservoirの可能性が論じられている。これらの分画はCTL依存的SIV複製制御アカゲザルにおけるLatent Reservoirとなりうる細胞分画であるため、平成27年度にはSIV感染アカゲザルにおいてこれらの細胞分画を、FACSを用いた多重染色により識別し、さらに高純度でSortingする実験系を作製した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

プロウイルスゲノム中のwild typeとCTL逃避変異体のコピー数の測定法については当初、Multiplex Realtime PCR法でwild type/変異体検出プローブの有効性を確認したうえで、Digital PCR法による測定法を確立する予定であったが、各プローブの特異度が十分得られなかったことから断念した。代替法として限界希釈 nested PCR法による解析系を確立した。プロウイルスゲノム数が多い場合は次世代シークエンス法に移行することも視野に入れている。
またアカゲザルのサンプルを用いて、Latent Reservoirとなりうる細胞分画を多重染色により識別し、高純度でSortingする系を確立しており、この点については予定の計画より進展していると言える。

Strategy for Future Research Activity

平成27年度の研究をもとに、SIV複製制御アカゲザルの各種組織よりLatent Reservoirとなることが想定される細胞分画をSortingし、各分画に含まれるwild type/変異体プロウイルス数を比較することで、CTL依存的複製制御個体におけるLatent Reservoirとなる組織および細胞分画の解析を行う。

  • Research Products

    (3 results)

All 2015 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Broadening of Virus-Specific CD8+ T-Cell Responses Is Indicative of Residual Viral Replication in Aviremic SIV Controllers2015

    • Author(s)
      Takushi Nomura, Hiroyuki Yamamoto, Hiroshi Ishii, Hirofumi Akari, Taeko K. Naruse, Akinori Kimura, Tetsuro Matano
    • Journal Title

      PLOS Pathogens

      Volume: 11 Pages: e1005247

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1005247

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Effects of IL-7 and IL-15 administration on SIV controllers2015

    • Author(s)
      Takushi Nomura, Hiroyuki Yamamoto, and Tetsuro Matano
    • Organizer
      The 63rd Annual Meeting of the Japanese Society for Virology
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2015-11-22 – 2015-11-24
  • [Remarks] Matano Research Group(俣野研究グループ) Publications

    • URL

      http://square.umin.ac.jp/arc/Matano_Research_Group_JP/Publications.html

URL: 

Published: 2017-01-06  

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