2016 Fiscal Year Annual Research Report
Comprehensive genetic analysis of ALS-related genes in Japanese sporadic ALS patients
| Project/Area Number |
15K19485
|
|---|
| Research Institution | Nagoya University |
|---|
Principal Investigator |
中村 亮一 名古屋大学, 医学部附属病院, 医員 (80723030)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2017-03-31
|
| Keywords | ALS / 次世代シークエンサー / ターゲットリシークエンス / SOD1 / 網羅的解析 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
筋萎縮性側索硬化症（ALS）の病態解明、治療法開発のために病態関連分子を明らかにする必要がある。本研究の目的は大規模ALS患者コホート等から収集した多数のALS患者のDNA検体を用いて、ALS関連遺伝子の網羅的シーケンスを行い、これによりわが国の孤発性ALS患者における既知のALS関連遺伝子変異の頻度を明らかにする、孤発性ALSの発症および臨床像に影響を与えている遺伝子変異の探索、同定を行い、孤発性ALSの病態関連遺伝子を明らかにすることである。
SOD1、ALS2、SETX、SPG11、FUS、VAPB、ANG、TARDBP、FIG4、OPTN、VCP、UBQLN2、SIGMAR1、DAO、NEFH、DCTN1、TAF15、EWSR1、PRPH、GRN、CHMP2B、ZNF512B、PFN1、ATXN2、TFG、C9orf72、RNF19A、SQSTM1、以上の28のALS疾患関連遺伝子のエクソン領域を次世代シークエンサーを用いてハイスループットかつ網羅的に解析するシステムを構築しており、これを活用し、遺伝子解析を施行した。
家族性ALS 39例、孤発性ALS 469例、正常コントロール191例の遺伝子解析を行い、家族性ALSの48.7％にあたる19例と孤発性ALSの3.0%にあたる14例に既知の遺伝子変異を認め、家族性ALSの15.4%にあたる6例と孤発性ALSの6.8％にあたる32例に新規の病原性が疑われるvariantを認めた。この結果から日本におけるALSの遺伝的背景が明らかになり、欧米の既報告と比較し、日本ではC9orf72の遺伝子変異の頻度が低く、SOD1遺伝子変異の頻度が高いことが判明し、日本の孤発性ALSでは欧米と遺伝的背景が異なることが示唆された。また、ALS疾患関連遺伝子のvariantは孤発性ALSにも重要な役割を果たしていると考えられた。
|
