2015 Fiscal Year Research-status Report
Project/Area Number |
15K19623
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Research Institution | Kyushu University |
Principal Investigator |
石村 匡崇 九州大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (10448417)
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Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2017-03-31
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Keywords | 全身型若年性特発性関節炎 / 早期診断 / 遺伝子発現 |
Outline of Annual Research Achievements |
先行研究として正常コントロール、川崎病や菊池病などを対照とし、全身型JIA患者由来末梢血単核球でmicroarray解析を行った。microarrayで全身型JIAで発現が亢進している遺伝子につき、Taqman probeを用いた比較定量PCRを行った。まず、AHSP(Alpha-hemoglobin-stabilizing protein)、FGF7(Fibroblast growing factor)、ETS1(V-ets avian erythroblastosis virus E26 oncogene homolog 1)について解析した。この3遺伝子のうち、AHSPは全身型JIAで有意に発現上昇がみられたが、FGF7/ETS1遺伝子については正常コントロール、疾患コントロールと比べて有意な上昇は見られなかった。そのため、他の論文も参考に、SLC6A8、RAP1Aについても定量PCRを追加した。SLC6A8については発現上昇がみられたが、RAP1Aは有意な差は認めなかった。 AHSP、SLC6A8については相関関係を認めた。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
全身型若年性特発性関節炎(JIA)患者でのmicroarray解析結果より、高発現である遺伝子について定量PCRでの解析を行ったところ、有意に上昇がみられた遺伝子もあったが、microarray結果と異なり、発現上昇がみられない遺伝子も認められたため、解析対象遺伝子の検討が必要である。
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Strategy for Future Research Activity |
他の論文などを参考に、全身型JIAで高発現がみられる遺伝子につき、定量PCR解析を追加する。複数の遺伝子発現量を用いての特異診断について、統計解析を行う。 定量PCRで上昇が確認できた遺伝子について、全身型JIAの病態について新たな知見が得られるか検討を行う。
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Causes of Carryover |
Microarrayは先行研究のみ行い、追加での解析は現時点で行わなかった。定量PCR検討は多数検体で行ったが、対象遺伝子数がまだ少なかったため、購入物品が当初の予定より少なかった。
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Expenditure Plan for Carryover Budget |
定量PCRでの検討に用いるprobe、bufferなどの購入費用に用いる。また、発現結果に対し統計解析を行う予定であり、統計解析ソフトを購入する。成果発表および情報収集のための旅費として使用する。
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[Journal Article] Invasive Bacterial Infection in Patients with Interleukin-1 Receptor-associated Kinase 4 Deficiency: Case Report.2016
Author(s)
Takada H, Ishimura M, Takimoto T, Kohagura T, Yoshikawa H, Imaizumi M, Shichijyou K, Shimabukuro Y, Kise T, Hyakuna N, Ohara O, Nonoyama S, Hara T.
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Journal Title
Medicine (Baltimore)
Volume: 95(4)
Pages: e2437
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Novel exonic mutation inducing aberrant splicing in the IL10RA gene and resulting in infantile-onset inflammatory bowel disease: a case report.2016
Author(s)
Yanagi T, Mizuochi T, Takaki Y, Eda K, Mitsuyama K, Ishimura M, Takada H, Shouval DS, Griffith AE, Snapper SB, Yamashita Y, Yamamoto K.
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Journal Title
BMC Gastroenterol.
Volume: 16(1)
Pages: 10
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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