2015 Fiscal Year Research-status Report
髄液中マイクロRNAとメタボロミクス融合による新たな脳腫瘍診断・病態解析法の構築
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15K19970
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| Research Institution | Kobe University |
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Principal Investigator |
中溝 聡 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), 研究員 (00569238)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | Cerebrospinal fluid / microRNA / metabolome |
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| Outline of Annual Research Achievements |
髄液は脳内の病態を鋭敏に反映する体液である。申請者らは、髄液中のマイクロRNAと髄液メタボローム解析を組み合わせて、脳腫瘍の新たなバイオマーカーを探索し、脳腫瘍の新たな病態解析や診断感度の向上のための研究を計画した。
まず、脳腫瘍患者の髄液を採取し、一般的な髄液検査を施行した。(LDH, 蛋白、糖、細胞数など）その後、髄液の一部をガスクロマトグラフィー/質量分析器を用いて、代謝物を測定した。32例のグリオーマ患者の髄液メタボローム解析では、61個の代謝物が同定できた。IDH変異グリオーマでは一部の腫瘍で髄液中2HGの上昇が認められたが、IDH変異グリオーマの有用なバイオマーカーとなるほど感度、特異度とも高くはなかった。グリオーマの悪性度と髄液中乳酸、クエン酸、イソクエン酸の濃度は非常に良く相関し、またIDH変異グリオーマでは髄液中クエン酸、イソクエン酸の濃度が上昇していた。これらより、髄液メタボローム解析で、グリオーマの悪性度、IDH変異を予測する指標となる可能性が示唆された。
髄液中マイクロRNAの発現に関しては、現在解析中であるが、preliminaryな解析では、miR-10bの上昇が確認できた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
髄液中のマイクロＲＮＡの網羅的発現解析がまだ十分行われていないためである。髄液中のマイクロRNAの抽出法を確立させ、internal controlを決めて、マイクロＲＮＡ量の定量化を早期に確立させなければならない。保存している髄液の量が不十分なものもあり、髄液の採取も引き続き行わなければならない。
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| Strategy for Future Research Activity |
髄液中のマイクロＲＮＡの抽出、網羅的発現解析を行い、様々な脳腫瘍で上昇あるいは低下している髄液中マイクロＲＮＡを同定する。また、代謝物との関連性についても解析する予定である。
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| Causes of Carryover |
髄液中マイクロＲＮＡの測定を行う実験がまだ確立しておらず、検査試薬などを購入できなかったためです。また、メタボローム解析ができる保存されている髄液がまだ少なかったためです。解析できる髄液が集まりましたら、解析する予定です。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
髄液のマイクロＲＮＡ発現解析およびメタボローム解析に必要な試薬、キット、質量分析器使用料などに使用する予定です。
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[Journal Article] Radiographic occult cerebellar germinoma presenting with progressive ataxia and cranial nerve palsy.2016
Author(s)
Minami N, Tanaka K, Kimura H, Hirose T, Mori T, Maeyama M, Sekiya H, Uenaka T, Nakamizo S, Nagashima H, Mizukawa K, Itoh T, Sasayama T, Kohmura E.
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Journal Title
BMC Neurol
Volume: 16
Pages: 1-5
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Tumor-Associated Macrophages Associate with Cerebrospinal Fluid Interleukin-10 and Survival in Primary Central Nervous System Lymphoma (PCNSL).2016
Author(s)
Sasayama T, Tanaka K, Mizowaki T, Nagashima H, Nakamizo S, Tanaka H, Nishihara M, Mizukawa K, Hirose T, Itoh T, Kohmura E.
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Journal Title
Brain Pathol
Volume: 26
Pages: 479-87
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] STAT3 activation is associated with cerebrospinal fluid interleukin-10 (IL-10) in primary central nervous system diffuse large B cell lymphoma.2015
Author(s)
Mizowaki T, Sasayama T, Tanaka K, Mizukawa K, Takata K, Nakamizo S, Tanaka H, Nagashima H, Nishihara M, Hirose T, Itoh T, Kohmura E.
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Journal Title
J Neurooncol
Volume: 124(2)
Pages: 165-74
DOI
Peer Reviewed
